成绩表 考核作业成绩(70%) 回答问题成绩(30%) 总成绩 错误!未找到引用源。
Perl程序设计课程考核
院 系 部 门: 生物信息学院 学 生 专 业: 生物信息专业 学 生 学 号: 2009212256 学 生 姓 名: 彭 莉
2011年6月
Perl程序设计课程考试大作业
【设置目的】
1、 贯彻实施高等教育的质量工程,深化教学改革,对本课程考
试实施改革,以课程大作业形式取代原有的卷面考试;
2、 运用本课程所学知识,掌握
Perl和Bioperl程序开发环境的搭
建、配置和测试;
3、 熟悉和巩固运用
Perl编程实现生物信息学中生物信息的分析
处理等实践技能;
【考评方法】
满分100分:(大作业:70分;随机提问回答情况:30分); 合格控制线:(大作业:>40分;随机提问回答情况:>20分),任意一部分不合格则为不合格。
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第一题:请问Bioperl怎样安装和配置,请结合文字图表概述Bioperl的安装、配置与测试,并简述该过程中出现问题解决经历(10分)。
一、求解过程
(1)、安装最新版本的ActivePerl-5.12.3.1204-MSWin32-x86-294330.msi,后启动ppm,见图1-1;
图1-1:启动PPM安装软件
图1-2:per PPM软件包管理界面
(2)、打开后,选择Edit >> Preferences。添加fig1.3图的站点,添加Bribes的例子见图1-4;
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图1-3:模块相应的站点
图1-4:添加Bribes模块的站点地址
(3)、选择View >> All Packages,在搜索框输入bioperl进行搜索,结果见图1-5;这个结果个人觉得有些奇怪,因为搜索结果里面有些包是一样的,我觉得会不会是在不同的站点里存在了同样的包,然后就出现了一些相同的包。
图1-5:搜索Bioperl软件包的结果
(4)、安装相应的包,首先安装BioPerl包,选中BioPerl,右键选择安装,
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然后按图1-5中右上角的右箭头开始进行下载并安装,其实可以一次性选择所有想安装的模块,然后再一起进行下载安装;不过为了让电脑更好的运行,就分开一个一个进行安装,BioPerl安装情况见图1-6,BioPerl-DB安装情况见图1-7,BioPerl-network安装情况见图1-8,图1-9,BioPerl-Run和Bundle-BioPerl情况见图1-10,BioPerl-BioPerl-Core安装情况见fig1.11,Bio-mGen和Bundle-BioPerl-XMLSimple1.0见图;
图1-6:安装bioperl完成
图1-7:安装完成BioPerl-DB
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