从EditSeq开始 EditSeq是能够迅速、正确地输入，并且修改DNA或蛋白质序列工具。每个EditSeq文件都可以分为三个可编辑的部分，上边的一部分为序列文件，中间的一部分里是评论，底部是序列的注释。
EditSeq能读取大部分的序列格式——包括FASTA，GenBank，ABI、GCG和ASCII格式。你可以使用菜单命令或拖拽方式输入序列文件。另外， 序列也许通过使用键盘输入，或者从其他地方复制、粘贴得到。经Entrez或BLAST检索得到的序列可以直接从因特网或企业内部互联网服务器下载。
序列被打开后，EditSeq能使用标准或者指定的遗传密码进行翻译，或者反翻译，寻找开放读框，还可以进行阅读校对。另外， EditSeq能以GenBank，FASTA和GCG格式输出序列。
如果在使用这软件中需要帮助，可以和DNASTAR联络。电话：（608）258-7420，传真：（608）258-7439，电子信件：support@dnastar.com，或者经http://www.dnastar.com.
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内容 打开已有序列 23 寻找开放读框 24 DNA序列翻译 24 遗传密码选择使用 25 遗传密码修改 25 序列的反向互补及反向转换 26 BLAST检索 27 序列信息查看 28 序列校读 29 序列的保存与输出 29
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打开已有序列
我们从用苹果计算机打开“TETHIS21MA”和用Windows打开“tethis21.seq”开始。
假设序列的末尾有载体序列污染。我们在用EditSeq打开序列的同时，用Set Ends命令去除5’和3’污染序列。 从文件菜单（FILE MENU），选择Open。
打开文件夹“Demo Sequences”单击选定序列“TETHIS21”。 单击位于对话框右下角的Set Ends按钮。
Set Ends被打开（如右）。
在5’框和3’框中键入50和850，点击OK。
单击Open打开序列。
当EditSeq窗口打开时，序列长度显示在右上角。通过“setting ends,”现在你只有最初序列中的801 bp的片段。Set Ends选择在全部Lasergene应用程序中都可以使用。
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寻找开放读框
在这入门的一部分中，我们将确定序列中最大的ORF，并翻译它。 从SEARCH MENU找到ORF，点击打
开会出现右边的对话框。 单击Find Next寻找第一个ORF
的位臵。
继续点击Find Next直到你把ORF的位臵选定在位臵183-455。ORF的
坐标会出现在EditSeq窗口的顶端附近。
DNA序列翻译
这一节中我们介绍如何翻译我们的ORF，不过任何序列中的读框内部分都可以用下面的方法进行翻译。如果你的选择是在三联码的读框内，三
联码指示棒显示为实心黑线（如左图）。如果你的选择是不在三联码的读框内，左边的箭头和右面的箭头显示向左或向右移动一个bp，以使所选序列成为三的倍数。
? 选定ORF，从GOODIES MENU菜单中选
择翻译（Translate）。
? 翻译的蛋白质序列出现在一个新的未
命名窗口中（如右图）。它是使用标准的遗传密码翻译的。
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使用其它遗传密码
根据你的序列的来源，你可以选择使用非标准的遗传密码进行翻译等操作。在这节中，我们将标准的遗传密码转换成Ciliate Macronuclear密码 。
从GOODIES MENU菜单选择Genetic Codes打开，子菜单显示如左。
单击“Ciliate Macronuclear”就实现了遗传密码的转换，EditSeq现在使用的就是Ciliate Macronuclear的遗传密码。 同样可以将遗传密码转换为其它类型。
遗传密码的编辑
这一节中我们修改Ciliate Macronuclear的遗传密码。 从GOODIES MENU菜单选择Edit
Selected Code。这将打开右面的窗口，窗口显示遗传密码是怎样翻译DNA和RNA序列的。
如以DNA形式展示密码，点击DNA按钮。 编辑时，单击任何要编辑的密码，从其
目前的位臵拖到新氨基酸对应的位臵则可。
如使用不同的启始密码子，单击Set Starts按钮。第二的遗传密码窗
就会被打开，可以进行起始密码子选择。
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