但也存在一些差异。
1．流体一流体不配伍性
由于碳酸盐岩储层的地层水矿化度较高，富含二价阳离子（如Ca2+、Mg2+），而使流体一流体不配伍性更为严重。碳酸盐矿物的酸溶解度较高，又使酸化成为一种常用的增产措施。但是，一旦出现油一酸或酸一盐水不相容，尤其是在低渗透性的碳酸盐岩储层，产能不仅不会增加，反而会降低。 2．岩石一流体不配伍性
大多数碳酸盐岩储层粘土矿物含量低，且处于被孤立隔绝状态。因此，多数碳酸盐岩不存在象砂岩中常出现的岩石一流体敏感性问题。但在酸化作业中，释放出来的酸不溶残渣大部分为粘土矿物，这些粘土矿物的活化可以引发微粒运移问题。 3．固相侵入损害
均质碳酸盐岩储层中也存在泥浆和钻屑侵入问题，与均质砂岩储层情况类似。然而，在碳酸盐岩储层钻进时所产生的钻屑是酸溶性的，如果侵入深度较小，通过酸洗或酸压的方式可以比较容易消除固相损害。当在渗透性较高的均质碳酸盐岩系统中钻进时，加入酸溶性屏蔽暂堵剂（如CaCO3），与钻屑一同用于控制流体滤失。 4．相圈闭损害
初始含水饱和度较低的致密碳酸盐岩气藏存在强烈的水相圈闭损害的趋势。此外，绝大多数碳酸盐岩油藏表现为中性到亲油趋势，初始含水饱和度通常也很低，水相圈闭效应同样使这种这类油藏受到损害。 5．处理剂吸附损害
化学处理剂吸附和润湿反转也会损害碳酸盐岩储层，但由于活跃性的粘土矿物含量一般很低，且在初始状态下具有向亲油性自然变化的趋势，因此这些因素的影响（与砂岩储层相比）要弱得多。 6．微粒运移损害
大多数碳酸盐岩储层不含有丰富的粘土矿物或可活化的地层微粒，因此其速敏性相对较弱。有时储层沥青、纤维状石膏、微晶石英、微晶长石、或注入流体引入的就地生长细菌也会存在潜在的微粒运移问题。 六、裂缝/溶蚀孔洞型碳酸盐岩油气藏
绝大部分碳酸盐岩储层表现为强烈的非均质性。对于裂缝性碳酸盐岩储层，要象对裂缝性砂岩储层那样进行评价，确认储层基块是否对产能有贡献(如果存在，流体设计中就应考虑前文所述的要点)，或者产能是否主要来自裂缝系统。同样由于钻屑的可酸溶性，假如裂缝系统中侵入钻屑的损害只是局部的，且深度范围较小，则碳酸盐岩裂缝系统的损害较砂岩储层更易于处理。但应该强调的是，非酸溶性泥浆成分，如重晶石加重材料、人工粘土、或来自井筒上部非碳酸盐岩地层的钻屑，在砂岩地层和碳酸盐岩地层都可能造成损害。
溶蚀孔洞型碳酸盐岩储层的问题较为复杂。如果孔洞之间未广泛连通，
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那么各孔洞仅涉及井筒较浅的范围，不是流体设计和选择优先考虑的因素。 具有很好相互连通性的孔洞系统很可能像开启的大裂缝一样发生严重的流体漏失，大量泥浆和固相颗粒向孔洞系统的漏失是损害渗透率的主要潜在因素。某些情况下，如果孔洞之间的相互连通性规模相对较小，一定大小的固相堵漏剂就会有效地阻止大量的漏失。而对于相互连通规模较大，在欠平衡钻进时，仍会有大量流体漏失，此时应当考虑使用超粗粒级的堵漏材料和桥堵剂。
七、裂缝性变质岩/岩浆岩油气藏
变质岩/岩浆岩储层的形成多与潜山风化壳有关，如酒西盆地鸭儿峡变质岩油藏、辽河大民屯凹陷东胜堡潜山变质岩油藏、济阳坳陷王庄变质岩油藏、和二连盆地阿北油田中生界安山岩油藏。这类储层表现出强烈的非均质性，储渗空间以构造成因的裂缝和风化破碎淋溶的孔隙、溶蚀裂缝、溶洞为主。由于岩石性脆，裂缝密度大，组系多，微裂缝发育，各种规模的裂缝相互连通，可以形成较高的储集和渗流能力。
要详细评价储层基块和裂缝系统对产能的贡献，以制定有针对性的保护措施。与碳酸盐岩储层不同，变质岩/岩浆岩钻屑的可酸溶性差。若裂缝系统中侵入钻屑、非酸溶性泥浆成分，如重晶石加重材料、人工粘土、或来自井筒上部碎屑岩的钻屑，都可能造成损害。对于相互独立的裂缝系统，钻井完井液密度控制更加困难，固相和液相侵入损害比较普遍。井漏、或井喷后的压井通常造成最严重的损害。
变质岩/岩浆岩储层的矿物组成比碳酸盐岩储层复杂得多。首先是初始矿物组分多，然后在风化过程、再次埋藏过程还要发生一系列的矿物形成和转化。裂缝和孔隙中常有方解石、白云石、高岭石、绿泥石、伊利石、蒙皂石、沸石等自生矿物，从敏感性矿物组分的多样性来说，有时并不亚于砂岩储层。所以油气层损害的特点与裂缝性砂岩储层相似。
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