现代农业产业技术体系由产业技术研发中心和综合试验站二个层级构成。
针对每一个农产品，设臵一个国家产业技术研发中心和一个首席科学家岗位。每一个国家产业技术研发中心由若干功能研究室组成，每个功能研究室设一个研究室主任岗位和若干个研究岗位。其主要职能是：从事产业技术发展需要的基础性工作；开展关键和共性技术攻关与集成，解决国家和区域的产业技术发展的重要问题；开展产业技术人员培训；收集、监测和分析产业发展动态与信息；开展产业政策的研究与咨询；组织相关学术活动；监管功能研究室和综合试验站的运行。
根据每一个农产品的区域生态特征、市场特色等因素，在主产区设立若干综合试验站，每个综合试验站设一个试验站站长岗位。其主要职能是：开展产业综合集成技术的试验、示范；培训技术推广人员和科技示范户，开展技术服务；调查、收集生产实际问题与技术需求信息，监测分析疫情、灾情等动态变化并协助处理相关问题。
3.实施情况
2007年12月29日和2008年12月22日，农业部先后公布了现代农业产业技术体系第一批、第一批增补和第二批建设依托单位与岗位聘用人员名单（2007-2010年），50个农产品的产业技术体系建设已全面启动,其中作物产品34个、畜产品11个、水产品5个。目前，在全国范围内建立了50个产业技术研发中心、231个功能研究室、
970个综合试验站，聘请了首席科学家50人、岗位科学家945人，综合试验站站长970人。2008年中央财政投入专项资金9.675亿元。
四川共有32位专家进入岗位科学家行列，其中种植业有22位，涉及到水稻、玉米、油菜、小麦、高粱、马铃薯、甘薯、大豆、食用菌、茶叶、牧草、蚕桑等12个产业以及育种繁育、耕作栽培、植物保护、土壤肥料、精深加工等5大领域，四川主要优势特色种植业及其优势领域基本进入了国家现代农业产业技术体系。
（二）技术创新体系 1. 技术创新体系
党的十七大、全国科技大会以及《国家中长期科学和技术发展规划纲要（2006-2020年）》提出，要建立以企业为主体、市场为导向、产学研相结合的技术创新体系，引导和支持创新要素向企业集聚，促进科技成果向现实生产力转化，加快提升产业的核心竞争力。
2.产业技术创新战略联盟
构建产业技术创新战略联盟是加强产学研结合，促进技术创新体系建设的重要举措。产业技术创新战略联盟是市场经济条件下产学研结合的新型技术创新组织。
所谓产业技术创新战略联盟，是指由企业、大学、科研机构或其他组织机构，以企业的发展需求和各方的共同利益为基础，以提升产业技术创新能力为目标，以具有法律约束力的契约为保障，形成的联合开发、优势互补、利益共享、风险共担的技术创新合作组织。
其主要任务是组织企业、大学和科研机构等围绕产业技术创新的关键问题，开展技术合作，突破产业发展的核心技术，形成重要的产
业技术标准；建立公共技术平台，实现创新资源的有效分工与合理衔接，实行知识产权共享；实施技术转移，加速科技成果的商业化运用，提升产业整体竞争力；联合培养人才，加强人员的交流互动，为产业持续创新提供人才支撑。
产业技术联盟体现三大特征：其主体是企业，成员之间围绕价值链形成高度专业化的分工与协作，产生了巨大的外部规模效应；其本质是技术联盟，运作高效，形成协同效应，联盟整体优势大于各联盟成员优势之和；产业技术联盟内部联系比较松散，内部的竞争和非竞争企业基于技术创新目标而形成联合体，并将技术目标扩展成为一种技术愿景。
（三）国家现代农业产业技术体系四川省创新团队
启动四川创新团队建设，既是配合国家体系在四川开展相关研究及试验示范工作，又是国家现代农业产业技术体系的延伸和补充。
1.启动的产业
2008年，省农业厅与省财政厅在省级层面上，在全国率先开展了马铃薯和茶叶两个产业创新团队建设试点工作，其做法和成效得到了农业部、财政部的充分肯定。2009年，在借鉴试点工作经验的基础上，又适时启动了水稻、玉米、油菜、蔬菜、食用菌、柑橘、攀西特色水果以及生猪八个产业。
2.构建框架
四川创新团队由专家团队和产业示范基地县两个层级构成，每个产业组建1个专家团队，设臵1名首席专家，若干名岗位专家，建立 3-5个产业示范基地县。
按照“个人申报、单位推荐、专家咨询委员会评审、领导小组决定”的遴选程序，坚持“优中选优”原则，选拔了112名科技人员，组成10个农产品的四川创新团队。为更好实现国家体系与四川创新团队有效衔接，邀请国家体系的专家作为相关产业的顾问；鉴于全省生态类型多样、研究单位的研究方向各有侧重等因素，从申报人员中遴选部分人员对某些岗位设臵了协作专家。创新团队共设臵了5个产业顾问、10个首席专家、60个岗位专家和37个协作专家。
按照产业的区域生态特征，每个产业建立3-5个产业示范基地县，与优势特色效益农业区域规划结合、与粮食生产重点县核心线结合、与现代农业产业基地强县结合、与基层农技推广体系改革与建设示范县结合，遴选确定了40个产业示范基地县，项目投入和科技力量统一安排，促进创新要素和优势科技资源向产业示范基地县聚集，农科教联合、省市县互动，形成共建合力。
3.主要职能
首席专家主要职责是：一是组织相关岗位专家编制产业发展现状调研报告和制定本产业研究规划；二是根据产业发展的关键技术环节和突出问题，提出科研攻关和技术推广的重大项目；三是分解岗位专家研发、培训、示范、推广等任务；四是组织岗位专家指导产业示范基地县建设。
专家团队主要职责是：围绕国家体系建设任务规划，制定既与国家体系建设相衔接的又充分体现四川特色的研究规划；重点开展遗传育种、耕作栽培、病虫害防控、产后处理和加工等方面的研究工作；配合国家体系建设开展产业技术集成及试验、示范、培训等工作。
产业示范基地县主要职责是：在专家团队的指导下，承担四川创新团队建设科技示范任务；开展集成技术的示范推广；培训技术指导人员和科技示范户；调查、收集生产实际问题与技术需求信息；为产业发展提供示范[9]。
四、现代农业科技技术链的构建 （一）产业技术链的构建
针对产业链各环节需求，加大研究开发力度，注重生物技术、信息技术等对农业的升级改造作用，努力实现产业核心技术和关键技术的突破，构建完整的支撑产业发展的技术链：良种繁育技术—标准化种养殖技术—精深加工技术—副产物综合利用技术—废弃物循环利用技术。
1.良种繁育技术
优良新品种是农业生产最基本、最主要的生产资料，已经成为提高作物和畜禽水产产量的最重要途径，也是改善农产品品质、提高市场竞争力、促进农业产业结构调整、增加农民收入的瓶颈与抓手。发达国家的实践已经证明良种繁育是农业产业化的重要基础，对推动传统农业向现代农业转变具有重要意义。
广泛收集地方特色资源，充分发掘优异资源的有利基因，综合应用常规技术、分子标记育种技术、转基因技术、分子设计定向育种技术以及航空诱变育种技术，结合抗性鉴定与品质检测技术，聚合高产、优质、抗病、抗逆基因，培育比现有当家品种增产10%以上、品质达到国颁优质以上标准、抗病抗逆性强、适合机械化管理和间套复种的突破性品种，符合特殊加工要求的优质专用新品种，以及具地方特色的优质畜禽新品种(系)或配套系。简化杂交制种程序，降低劳动强度和生产成本，提高制种产量、质量和效益的机械化繁殖制种技术；建立优良畜种的快速扩繁技术体系。