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化学科学二处
化学科学二处资助的范围包括有机化学和化学生物学。化学生物学的研究内容含在各个相关的科学处的指南中。
有机化学是研究有机物质的来源与组成、合成与制备、结构与性质、反应与转化及功能与作用机理的科学。有机化学的新理论、新反应、新方法不仅推动了化学学科的发展，同时也促进了该学科与有关生命、材料、能源、信息和环境等学科在更大程度上的交叉和渗透，进一步拓展了有机化学的研究领域。当今有机化学研究的特点是：有机化学的分子设计、识别与组装等概念正在影响着多个学科研究领域的发展；有机化学中与生命科学的交叉为研究和认识生命体系中复杂现象提供了新的方法和手段；有机化学与材料科学的交叉促进了新型有机功能物质的发现、制备和利用，在满足人类的需求方面做出重要贡献；选择性反应尤其是催化不对称合成，已成为有机合成研究的热点和前沿；绿色化学正成为合成化学研究中具有战略意义的前沿领域，将为人类社会的可持续发展，如合理利用资源、解决环境污染等方面起着重要的作用；新技术的发展与应用推动了有机反应机理研究的深入，反过来又促进了有机化学的发展。
通过多年科学基金的持续资助，我国有机化学的基础研究在金属有机化学、物理有机化学、生物有机化学、天然有机化学和不对称合成等研究领域都取得了重要进展。从学科发展的角度来看，近年来物理有机化学、元素有机化学和有机分析化学等领域的申请项目比较少，与材料科学和生命科学的交叉学科研究也有待加强。具体来讲，在复杂天然产物全合成研究领域中，应鼓励开展我国自己发现的、具有独特结构的天然产物全合成，基于仿生合成和生物合成的天然产物全合成，同时应注意运用自己发展的合成方法学。在医药和农药创制领域，鼓励开展基于作用靶标的药物分子设计、合成和生物活性研究，并加强生物学和有机化学的结合。有机功能材料应注重分子设计、高效合成和分子组装。超分子化学、分子识别和自组装研究应关注动态过程研究和新体系的建立。鼓励开展高效、高选择性的原创性催化剂的研究及其应用。鼓励开展基于天然产物的化学生物学研究。
有机化学应在重视新方法、新理论研究的同时，要努力吸取相关学科和交叉学科的最新研究成果，推动本学科均衡协调健康地发展，要努力发现国家需求、经济发展中的相关科学问题，做出自己的贡献。
化学科学三处
化学科学三处资助的范围包括：物理化学和理论化学。
物理化学与理论化学是化学科学的理论基础,其研究内容不断丰富和拓展：从单分子、分子聚集体到凝聚态，从分子间弱相互作用到化学键形成，从简单体系到复杂体系；借助物理化学手段和理论方法，获取从基态到激发态、从稳态到瞬态的分子结构以及动态变化的信息。物理化学的研究呈现出如下态势：宏观与微观相结合、体相与表（界）面相结合、静态与动态相结合，理论与实验相结合、并进一步深入到对化学反应和物质结构控制的研究；物理化学和理论化学与能
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源、环境、生命、材料、信息等领域基础科学相交叉，积极推动许多新的学科生长点的产生；物理化学在化学和相关科学的发展中发挥越来越重要的作用。
物理化学应该发挥学科优势，聚焦于科学发展前沿，面向国家需求，加强创新性、系统性和前瞻性的研究，发展物理化学的新概念、新理论和新方法，鼓励更广泛地与其他学科领域的交叉。注重有可能成为新生长点的基础研究，重视具有重大理论意义和重要应用前景的基础研究。鼓励从事其他相关学科的研究者在本学科申请交叉项目，申请时应注意突出与物理化学相关的科学问题。
化学科学四处
化学科学四处资助的范围包括高分子科学和环境化学两个学科的研究领域。 高分子科学学科
高分子科学是研究高分子的形成、化学结构与链结构、聚集态结构、性能与功能、加工及应用的学科门类，研究对象包括合成高分子、生物大分子和超分子聚合物等。
在高分子化学领域，一是研究新单体、新催化和引发体系，发展合成高分子的各种聚合方法学；二是产物结构、分子质量及其分布等可控的聚合反应及大分子的生物合成方法研究；三是高分子参与的化学过程，四是功能高分子，对具有电、光、磁特性，生物医用、能量转换、吸附与分离、催化与试剂、传感和分子识别等相关的功能高分子开展研究，要注重超分子聚合物、超支化高分子等各种新结构和高分子立体化学研究。
在高分子物理领域，主要方向是提出高分子凝聚态物理新概念，深入研究聚合物结构及其动态演变，加深对聚合物结晶、液晶和玻璃化等转变过程的认识，注重从单链高分子聚集态到成型过程聚集态的研究；关注对受限空间高分子结构、表面与界面结构与性能、高分子纳米微结构与尺度效应、形态、结构与性能的关系及分子间相互作用研究；加强对高分子溶液和聚合物流变学的研究；发展高分子理论和计算模拟方法。
近年对聚合反应方法学、结构表征方法学、超分子聚合物、烯烃易位聚合和离子聚合等方向申请项目偏少。今后申请者在选题时应重视学科发展前沿，但也不要一味跟踪申请热门课题而忽视高分子科学中未解决的基本问题和暂时冷门的方向，应善于从高分子工业中抽提出所存在的重要的基本科学问题；申请书应从基本科学问题出发，重视科学价值，题目不宜过宽。
鼓励高分子科学与化学其他领域、信息技术、生命科学、物理学、材料学和食品科学等学科的交叉研究，注重吸收物理学新思想、新理论和新的实验技术，丰富软物质物理理论、发展新的电子学和光子学聚合物；善于从天然高分子和生物大分子研究中寻找高分子科学发展的新切入点和生长点，在合成高分子与生物大分子之间的空白区寻找发展空间，重视仿生高分子、超分子结构、大分子组装与有序结构调控的研究，发展高分子化学生物学。
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环境化学学科
环境化学学科涉及环境分析化学、环境污染化学、污染控制化学、污染生态化学、环境理论化学、区域环境化学和化学污染与健康等研究领域。环境化学在与相关学科的综合交叉中迅速发展，对推动基础科学研究和解决国家重大环境问题均发挥着越来越重要的作用。
环境化学主要研究化学物质特别是污染物在环境介质中的存在、迁移转化、归趋、效应和控制的化学原理和方法。近年来项目申请数逐年增加，研究内容从微观机理到宏观规律不断深入，主要包括：新型污染物的鉴别；污染物分析新原理、新方法和新技术；污染物的多介质环境化学行为及微观机理，区域环境质量演变过程与机制；大气污染控制、污染水体和土壤的修复技术与原理，固体废弃物处理及资源化技术方法与原理；复合污染过程、机制及生态效应，纳米材料在污染控制中的应用及其安全性；化学污染物对环境与人体健康的影响；污染物的结构-效应、剂量-效应关系及预测模型等。化学污染物的环境过程及生物有效性、低剂量暴露及复合效应等基础环境科学问题应进一步加强研究。
化学科学五处
化学科学五处的资助范围包括化学工程与工业化学领域的基础研究。
化学工程与工业化学是研究物质在物理、化学和生物转化过程中的流动、传递、反应及其相互关系的科学，其主要任务是认识物质转化过程中流动、传递、反应的规律及其对目标产品性能的影响，研究有效进行物质转化的工艺、流程和设备，建立其工业化设计、放大和调控的理论和方法，并重点关注化学工程与技术领域独特的新理论、新概念、新方法及在工业中的创造性应用。 近年来，从复杂的化工系统研究中提炼出关键的共性科学问题，逐步形成系统理论和关键技术，已成为化学工程与工业化学学科基础研究的主流，该领域的研究内涵也出现了许多新的变化，主要表现在：从总体性质测量和关联转向对结构、界面与多尺度问题的研究、观测和模拟，并注重结构的优化与调控、过程的强化和放大的科学规律；注重研究化工过程的绿色化、集约化的理论和方法；从对常规系统的研究拓宽到非常规、极端过程的研究；从化学加工过程拓展到化学产品工程等。
本学科重点支持以社会需求和国家目标为导向、以增强国家综合实力和创新能力为目标的化学工程与工业化学的基础理论、关键实用技术以及与可持续发展有关的节能、降耗的工程科学问题研究，着重考虑：化工高新科学技术和化工学科领域中前沿课题的研究，注意多学科交叉，特别关注从交叉学科发展中提炼出的化学工程问题，在科学思想和技术手段上有所发展和创新；涉及国民经济中量大、面广和国计民生相关的关键化工技术研究，加强化工基础方面的系统研究和积累，从中寻找规律性的认识，完善与发展学科自身的基础理论，发挥基础研究的导向作用。
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重点项目
重点项目是国家自然科学基金研究项目系列中的另一个重要类型，其定位是在促进学科均衡协调和可持续发展的基础上，根据国家自然科学基金优先发展领域，通过指南引导，更集中地瞄准国际前沿，整合创新资源，孕育重点突破。重点项目主要支持科技工作者结合国家需求，针对我国已有较好基础和积累的重要研究领域、对学科发展具有重要推动作用的领域或新学科生长点开展深入、系统的创新性研究工作。
为实现重点突破的目标，重点项目进一步强调有限目标、有限规模和重点突出的原则，重视学科交叉与渗透，强调利用现有重点科学基地的条件。重点项目基本上按照五年规划进行整体布局，每年确定受理申请的研究领域、发布指南引导申请。研究期限一般为4年。申请重点项目的基本要求，请参照前面的申请须知和限项规定相关部分，重点项目申请书要按照重点项目撰写提纲撰写。申请代码1须选择《指南》中的指定申请代码（每个研究领域后面括号内的字母和数字，特殊说明的除外）。
2008年度国家自然科学基金重点项目受理申请1 875项，批准资助425项，资助经费77 973万元，平均资助强度183.47万元/项。2009年度重点项目将按照“十一五”规划的部署，拟资助重点项目406项左右，资助总经费约75 000万元，平均资助强度基本与2008年持平。
2008年度重点项目资助情况
金额单位：万元
批准资助 科学部 申请项数 资助金额项数 金额 占全委比例（%） 合 计 数理科学部 化学科学部 生命科学部 地球科学部 工程与材料科学部 信息科学部 管理科学部 1 875 158 174 714 323 291 139 76 425 54 51 121 62 76 45 16 77 973 10 808 10 213 21 042 10 250 14 930 9 000 1 730
100 13.86 13.10 26.99 13.15 19.15 11.54 2.22 单项平均 资助金额 183.47 200.15 200.25 173.9 165.32 196.45 200 108.13 22.67 34.18 29.31 16.95 19.20 26.12 32.37 21.05 资助率 （%） 电13248459157
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生命科学部
生命科学部针对过去重点项目立项与申请过程中存在的一些问题，如立项周期长、范围窄、定向性强、与其他基金资助项目衔接不够等，试行重点项目以立项领域宏观指导申请为主和非领域申请为辅的两种申请模式。请申请者详细阅读本章列出的学部2009年重点项目申请要求、注意事项和资助计划。按立项领域宏观指导申请的重点项目要求准确填写立项领域后面所标出的对应的申请代码；非领域申请的重点项目可自主选择与研究内容相对应的申请代码填写。按立项领域宏观指导申请和非领域申请的两类重点项目要求如下：
（1）按立项领域申请的重点项目：请参照生命科学部公布的2009年重点项目立项领域，确定研究题目，撰写申请书。在申请书的基本信息表中的“附注说明”一栏中要写明所申请的领域名称。
（2）非领域申请的重点项目：对于申请者在已往承担基金项目或其他研究中取得重要进展，如有重要科学意义的新发现、新的理论假说、新技术方法等，急需进一步高强度资助继续深入研究者，可不受重点项目立项领域的限制，直接申请重点项目（称为非领域申请的重点项目）。申请此类重点项目者，要在申请书的基本信息表中的“附注说明”一栏中写明“非领域申请”字样。此外，非领域申请的重点项目除了按常规要求撰写申请书外，还需要在申请书正文部分的最后增加一项800字左右的“关于已取得重要创新性进展的情况说明”，在此说明中着重阐述与本次申请密切相关的重要创新性进展的实质性内容、相关研究结果以及在国际重要学术期刊发表论文情况等。对于本次申请所依据的“已取得重要进展”的代表性论文，要求必须是申请者近期发表的第一作者或责任作者论文。
（3）凡申请重点项目者（包括按立项领域申请或非领域申请），要求在提交的纸质申请书后附5篇与本次申请内容相关的代表性论文的论文首页。
2009年生命科学部计划安排重点项目经费2.0亿元，计划资助117项。平均资助强度为170万元/项。其中，按立项领域指导申请的重点项目约占资助项目数的60%，非领域申请的重点项目约占资助项目数的40%。计划资助的117项重点项目中，95项平均分配到学部的19个学科中，22项用于学部的宏观调控。请申请者申请时根据自己的研究需要，提出合理、准确的经费预算。重点项目的研究期限为4年。需要说明的是，为了便于管理，学部对2009年按立项领域招标的重点项目指定了申请代码，但被指定的申请代码并不包含所招标的立项领域的全部内容，请申请者不要受指定申请代码影响，在申请时根据立项领域的相关内容确定自己的研究题目。 2009年生命科学部各学科重点项目立项领域及学部指定的申请代码如下： 1．微生物学学科
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