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立项领域名称：基于基因组学的微生物遗传学、生理学或病原生物学研究；申请代码：C010201；拟资助2～3项。非领域指导申请的重点项目拟资助2项。 2．植物学学科
立项领域名称：植物适应与进化的机制；申请代码：C020303；拟资助2～3项。非领域指导申请的重点项目拟资助2项。 3．生态学学科
立项领域名称：生态系统服务功能的形成与维持机理；申请代码：C030603；拟资助2～3项。非领域指导申请的重点项目拟资助2项。 4．林学学科
立项领域名称：森林资源高效利用的基础研究；申请代码：C0401；拟资助2～3项。非领域指导申请的重点项目拟资助2项。
5．生物物理、生物化学及分子生物学学科
立项领域名称：生物大分子修饰、调控及结构功能研究；申请代码：C050103；拟资助2～3项。非领域指导申请的重点项目拟资助2项。 6．遗传学与发育生物学学科
立项领域名称：发育过程的信号调控；申请代码：C061006；拟资助2～3项。非领域指导申请的重点项目拟资助2项。 7．细胞生物学学科
立项领域名称：细胞形态形成与运动的分子机制；申请代码：C0707；拟资助2～3项。非领域指导申请的重点项目拟资助2项。 8．免疫学学科
立项领域名称：免疫损伤的分子与细胞机制；申请代码：C0803；拟资助2～3项。非领域指导申请的重点项目拟资助2项。 9．神经科学与心理学学科
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立项领域名称：神经系统与免疫系统相互调节的机制；申请代码：C090202；拟资助2～3项。非领域指导申请的重点项目拟资助2项。 10．生物医学工程学学科
立项领域名称：生物材料、组织和细胞的生物力学研究；申请代码：C100101；拟资助2～3项。非领域指导申请的重点项目拟资助2项。 11．农学学科
立项领域名称：农作物重要生物灾害发生规律的研究；申请代码：C110401；拟资助2～3项。非领域指导申请的重点项目拟资助2项。 12．畜牧兽医水产学学科
立项领域名称：重要养殖鱼类生殖、发育及免疫的基础研究；申请代码：C120305；拟资助2～3项。非领域指导申请的重点项目拟资助2项。 13．动物学学科
立项领域名称：动物对逆境适应的生理机制；申请代码：C0130301；拟资助2～3项。非领域指导申请的重点项目拟资助2项。 14．生理学与病理学学科
立项领域名称：新的内源性生物活性物质的病理生理功能及作用机理；申请代码：C140209；拟资助2～3项。非领域指导申请的重点项目拟资助2项。 15．预防医学与卫生学学科
立项领域名称：重要纳米材料生物安全性的基础研究；申请代码：C1504；拟资助2～3项。非领域指导申请的重点项目拟资助2项。 16．临床医学基础Ⅰ学科
立项领域名称：围手术期脏器保护的基础研究；申请代码：C160203；拟资助2～3项。非领域指导申请的重点项目拟资助2项。 17．临床医学基础Ⅱ学科
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立项领域名称：国人高发恶性肿瘤复发、转移机制及预测的基础研究；申请代码：C171010；拟资助2～3项。非领域指导申请的重点项目拟资助2项。 18．药物学与药理学学科
立项领域名称：活性先导化合物的结构优化与类药性研究；申请代码：C180201；拟资助2～3项。非领域指导申请的重点项目拟资助2项。 19．中医学与中药学学科
立项领域名称：藏象理论与治则治法的基础研究；申请代码：C190104；拟资助2～3项。非领域指导申请的重点项目拟资助2项。
此外，鉴于已往在重点项目申请中出现的问题，2009年度生命科学部特别提醒申请者注意，凡是具有下列情况之一者，将不受理其所申请的项目：
（1）按立项领域申请的重点项目，未在申请书的基本信息表中的“附注说明”一栏中注明“重点项目领域名称”的申请。
（2）按立项领域申请的重点项目，未按要求填写指定的申请代码的申请。 （3）非领域申请的重点项目，又未在“附注说明”一栏中标注“非领域申请”的申请。 （4）非领域申请的重点项目，未按要求提供800字左右的“关于已取得重要创新性进展的情况说明”的申请。
（5）申请重点项目，但未按要求提交5篇代表性论文的论文首页的申请。
（6）与“973”、“863”等国家计划或国家杰出青年基金已资助的研究内容重复的申请。 （7）在“附注说明”一栏中注明重点项目领域名称，但研究内容不属于该领域范围的申请。 （8）尚在国外工作、无法保证大部分时间和精力在国内从事研究工作的申请者的申请。
化学科学部
“十一五”期间化学科学部对重点项目的支持在数量和资助强度上都将有较大的增长和提高，计划资助200个左右重点项目。2009年度化学科学部将在56个研究领域公布重点项目指南、受理申请，总经费在9 000万元左右，资助强度为150万元～250万元/项。鼓励研究基础好的研究小组或团队参与竞争，鼓励强-强合作申请交叉领域重点项目。实际资助的领域数和项目数将少于公布的领域数。项目执行期为4年。
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化学科学一处
1．簇合物的分子组装与功能(B01) 2．多功能分子材料的关键化学问题 (B01)
3．无机固体化学研究领域提出的自由申请重点项目(B01) 4．配位化学研究领域提出的自由申请重点项目(B01) 5．生物无机化学研究领域提出的自由申请重点项目(B01) 6．多孔配合物及性能(B01) 7．复杂样品分离与分析（B05） 8．单分子、单细胞分析（B05） 9．生命体系的成像与原位分析（B05） 10．生物传感技术的分析化学基础（B05） 11．重大疾病预警与诊断新技术、新方法（B05）
12．蛋白质检测及其相互作用的分析新技术、新方法（B05） 13．高通量、多尺度、多参量分析测试新方法、新技术（B05）
化学科学二处
1．调控有机合成反应选择性的新方法（B02）
2．小干扰RNA（siRNA）的化学修饰及其功能（B02） 3．基于生命体系研究的有机化学新反应和新方法（B02） 4．具有生物活性的寡糖的合成（B02） 5．受体分子的多维多层次组装及功能（B02）
6．具有重要医药用途的多肽化学修饰及作用机制（B02） 7．具有重要生物活性的复杂天然产物全合成（B02）
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8．调控重要内源性物质合成与活性的天然产物化学（B02） 9．绿色化学导向的有机反应（B02）
10．农药抗性的分子机制及反抗性农药的合理设计（B02）
化学科学三处
1．化学电源中的关键物理化学问题（B03） 2．催化反应涉及的关键物理化学问题(B03) 3．理论与计算化学的新方法 (B03) 4．结构化学前沿与关键科学问题(B03) 5．光电转换过程的超快光谱（B03）
6．表面、界面行为及功能调控的关键物理化学问题（B03） 7．理论化学在多相催化反应过程中的应用（B03） 8．大气物理化学领域提出的自由申请重点项目（B03） 9．团簇物理化学（B03）
10．纳米粒子的组装效应及其物理化学基础（B03） 11．生物物理化学领域提出的自由申请重点项目（B03）
化学科学四处
1．高分子合成化学方法学(B04) 2．生物大分子间弱相互作用(B04) 3．生物医用高分子(B04)
4．高分子有序微结构与性能(B04) 5．离子聚合或配位聚合新方法(B04) 6．高分子结构表征方法学(B04)
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