基因工程实验报告
学院:生命学院
班级:生技092
学号:
姓名:
基因工程实验技术
目录
实验一、动物组织RNA提取
实验二、RT-PCR扩增目的基因cDNA 实验三、核酸琼脂糖电泳分析 实验四、质粒的提取
实验五、表达载体和目的片断的酶切 实验六、载体和外源DNA的连接 实验七、感受态细胞的制备及转化 实验八、重组质粒筛选、鉴定及转化 实验九、目的基因诱导表达 实验十、Western Blotting 检测 附录1 DNA的纯化与回收 附录2 培养基制备和细菌培养 附录3 小鼠β-actin基因序列 附录4 表达载体pGEX 4T-1图谱
小鼠β-actin基因的克隆与表达
实验流程图
小鼠肝脏 总RNA提取 RT-PCR扩增 ?- actin 基因 片段胶回收 表达载体构建 表达菌株转化 诱导表达
Western 杂交
小鼠β-actin基因的克隆与表达
1 动物组织mRNA提取
(Trizol法)
1.1试验原理:
RNA是基因表达的中间产物,存在于细胞质与核中。对RNA进行操作在分子生物
学中占有重要地位。获得高纯度和完整的RNA 是很多分子生物学实验所必需的,如Northern杂交、cDNA合成及体外翻译等实验的成败,在很大程度上取决于RNA的质量。由于细胞内的大部分RNA是以核蛋白复合体的形式存在,所以在提取RNA时要利用高浓度的蛋白质变性剂,迅速破坏细胞结构,使核蛋白与RNA分离,释放出RNA。再通过酚、氯仿等有机溶剂处理、离心,使RNA与其他细胞组分分离,得到纯化的总RNA。在提取的过程中要抑制内源和外源的RNase活性,保护RNA分子不被降解。因此提取必须在无RNase的环境中进行。可使用RNase抑制剂,如DEPC是RNase的强抑制剂,常用来抑制外源RNase活性。提取缓冲液中一般含SDS、酚、氯仿、胍盐等蛋白质变性剂,也能抑制RNase活性。并有助于除去非核酸成分。
1.2材料
小鼠肝脏或肌肉组织。
1.3 仪器设备
高速冷冻离心机、低温冰箱、核酸电泳设备、液氮罐、研钵、剪刀、镊子、电泳仪系统、凝胶成像系统等
1.4试剂配制及器具处理
1、0.1%的DEPC H2O(DEPC:焦碳酸二乙酯)
2、器具处理:试剂瓶、量筒、研钵、大小枪头和1.5ml和0.2ml 的EP管等用纱布包裹,在0.1%的DEPC H2O中浸泡过夜(37℃),高压灭菌,80℃烘干备用。剪刀、镊子和药匙等160℃烘烤6h以上。
3、无RNA酶灭菌水(DEPC H2O):用将高温烘烤的玻璃瓶装重蒸馏水,按0.01%(体积/体积)加入的DEPC处理过夜,拧松瓶盖,高压灭菌。80℃烘4h以上。 4、Trizol
5、75%乙醇:用新打开的无水乙醇和DEPC处理过的水配制75%乙醇(用高温灭菌器皿配制),然后装入高温烘烤的玻璃瓶中,存放于低温冰箱。 6、氯仿 7、异丙醇
8、 TAE缓冲液(50×):用时需稀释50倍 9、 点样缓冲液Loading buffer(10×):0.25%溴酚蓝,40%甘油
10、 溴乙啶染色液(EB):10mg/ml溴乙啶。注意:EB具致癌作用。 11、 琼脂糖
1.5 操作步骤
1.5.1 Trizol法提取总RNA
① 先在研钵中加入液氮,再将组织剪成小块在液氮中磨成粉末,用液氮预冷的药匙取50~100mg组织粉末加入已盛有1ml的Trizol液的EP管中(注意组织粉末总体积不能超过所用Trizol体积的10%),充分混合均匀。
② 室温放置5min,然后加入200μl的氯仿,盖紧EP管并剧烈摇荡15秒钟。
③ 12000rpm离心10min,取上层水相于一新的EP管中(千万不要将中间的沉淀层和下层液混入,否则重新离心分离),加入500μl异丙醇,温和颠倒混匀。室温放置10min,12000rpm离心10min。
④ 小心地弃去上清液,加入1ml的75%乙醇,涡旋混匀,4℃下12000rpm离心5min。 ⑤ 重复步骤④。
⑥ 弃去上清液(尽量将残余液体除去),室温或真空干燥5~10min(注意不要干燥过分,否则会降低RNA的溶解度)。用30μl DEPC处理过的水将RNA溶解,必要时可55℃~60℃水浴 10min。RNA可进行mRNA分离,或贮存于70%乙醇并保存于-70℃。
[注]
① 整个操作要带口罩及一次性手套,并尽可能在低温下操作。
② 加氯仿前的匀浆液可在-70℃保存一个月以上,RNA沉淀在70%乙醇中可在4℃保存一周,-20℃保存一年。
试剂作用:
Trizol: Trizol 试剂是由苯酚和硫氰酸胍配制而成的单相的快速抽提总RNA的试剂,在匀
浆和裂解过程中,能在破碎细胞、降解细胞其它成分的同时保持RNA的完整性。在氯仿抽提、离心分离后,RNA处于水相中,将水相转管后用异丙醇沉淀RNA。用这种方法得到的总RNA中蛋白质和DNA污染很少,可以用来做Northern,RT-PCR,分离mRNA,体外翻译和分子克隆等。
DEPC:DEPC是RNA酶的强烈抑制剂,凡是不能用高温烘烤的材料如塑料容器等皆可用
0.1%的焦碳酸二乙酯(DEPC)水溶液处理,再用蒸馏水冲净。DEPC是RNA酶的化学修饰剂,它和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环反应而抑制酶活性。DEPC与氨水溶液混合会产生致癌物,因而使用时需小心。试验所用试剂也可用DEPC处理,加入DEPC至0.1%浓度,然后剧烈振荡10分钟,再煮沸15分钟或高压灭菌以消除残存的DEPC,否则DEPC也能和腺嘌呤作用而破坏mRNA活性。但DEPC能与胺和巯基反应,因而含Tris和DTT的试剂不能用DEPC处理。Tris溶液可用DEPC处理的水配制然后高压灭菌。配制的溶液如不能高压灭菌,可用DEPC处理水配制,并尽可能用未曾开封的试剂。
氯仿: 氯仿是分子量比较大的有机溶剂,在提取RNA时,氯仿可以有效的使有机相和无
机相迅速分离。DNA提取过程 有机相中主要是酚和蛋白结合,从而使得蛋白和DNA脱离,DNA进入水相。但是在RNA的提取过程就要避免蛋白和DNA脱离,否则DNA会释放到水相。不管有酚也好,没有酚也好,氯仿本身也对蛋白有变性