生物统计软件(5)

2019-09-02 15:05

由定制各数据轴的特性,并能进行数据的各种统计分析。进行一般的生物类数据处理作图,功能足以。 Simstat 一个易于使用的智能统计软件尤其适合对统计知识了解不多的人使用,它具有一个“专家系统”,引导你对数据进行统计分析。可与SigmaPlot结合生成高质量数据图。

CurveExpert ELISA标准曲线拟合、及其它各种有关的实验数 据分析,都可以应用CurveExpert进行数据分析。它使用非常方便, 可以说是实验数据处理的圣手,并且可以生成漂亮的曲线应用到论文之中。 十二、文献管理

reference Manager 10.0 可以在线通过查找关键词搜索PubMed和609个Z39.50数据库中的专业资料,同时保存查找的资料为本地文件。资料内容和记录分上下两个屏幕,如有全文或想连接网络时敲键盘就可以到相应的全文文章和摘要。可以直接在WORD中查找资料,并插入引用。在文章中对引用的文献可以格式化,引用的参考资料格式有很强的用户自定义功能,可以符合各种杂志对引用格式的要求,引用时不用多窗口切换.

Endnote6.0 专业参考文献查询软件,可在线查找Ineternet上的各种文献数据库,将查找到的资料保

存入本地数据库,并自动生成格式化的参考文献清单插入各种文字处理软件。

作者: cuiwk 发布日期: 2006-9-21 十三、进化树分析

Phylip 最为通用的进化树分析软件。主要包括五个方面的功能软件:i,DNA和蛋白质序列数据的分析软件。ii,序列数据转变成距离数据后,对距离数据分析的软件。 iii,对基因频率和连续的元素分析的软件。iv,把序列的每个碱基/氨基酸独立看待(碱基/氨基酸只有0和1的状态)时,对序列进行分析的软件。v,按照DOLLO简约性算法对序列进行分析的软件。vi,绘制和修改进化树的软件。

PUZZLE 核酸序列、蛋白序列相似性分析及进化树构建工具。根据序列数据的最大相似性构建进化树,一个软件,并且对树进行bootstrap评估。可对大量数据进行快速分析构建,程序还包含数个统计测试。 Paup 一种功能强大的商业版系统进化分析软件,据称价值一万大洋。

分子生物学软件简要功能介绍

1.三维分子类

RASMOL:观看生物分子3D微观立体结构

RasTop:为RasMol 2.7.1的图形用户界面软件

CHIME:直接在浏览器中观看3D分子

MolMol:将pdb等格式的蛋白文件通过微调,存成普通的图形文件

raswin.exe.gz:rasmol(win)2.7.0.1 rasmol新版本及汉化版本

CrystInfo:用来快速、容易地构建、观察与检查晶体3D结构

PDViewer:PDB格式文件的查看程序

Weblab Viewlite:三维分子浏览工具及大量分子文件例子

Weblab ViewerPro:三维分子浏览工具

ICMLite:三维分子浏览工具,有一些其他软件没有的功能

VMD:三维分子浏览工具,可以进行动态显示

CN3D:3D分子结构观察软件

WPDB:PDB文件检索显示分析软件

DTMM:三维分子模型显示、编辑与构建程序

Mole:高性能的大分子三维图形显示计算工具

gopenmol:显示并分析分子结构及其特性

POV-Rayv:生成三维图像工具软件

MolPOV:将PDB文件转化为POV格式文件的软件

Mol2Mol:分子文件格式转换软件

PovChem:将PDB文件转化为POV格式的文件

Ortep-3 for Windows:生成分子的热椭圆形点图

PLATON:通用结晶学软件工具

Mage:读取并演示Kinemage格式文件的专用软件

Prekin :将PDB格式文件转换为Kinemage格式文件

Swiss-Pdb Viewer:PDB文件显示与分析软件

DINAMO:蛋白序列排队比较编辑与三维模型构建工具

PCMoleeule2 Lite:查看PDB格式文件的免费软件

StrukEd :化学分子编辑与三维模型生成软件

JMVC:使用JAVA技术编写的三维分子查看器

ReView:读取及分析XYZ格式三维分子文件


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