2、主体税种缺失，基础税源薄弱，税收成本居高不下
一方面，由于区乡经济基础薄弱和收入结构上的不合理，随着农业税的全面取消，区乡自有财力增长的空间进一步缩小。加之体制和历史原因，留给区级的税收大多是规模小、税源散、稳定性差、征管难度大、成本高的小额税种。据统计，2006年，全区各类登记纳税户中提供税收5万元以上的纳税户 141家，实现税收13190万元，占全区工商税收的67.6％，而占全区纳税户总数90％以上的纳税户，所缴税款不足总收入的40％，群体税源比较薄弱。另外，随着下岗人员再就业政策的落实和个体经营户起征点的提高，有3700多户登记纳税人退出征收范围，年减收350万元。全面取消农业税后，乡镇税源呈逐渐萎缩的趋势。近几年全区财政收入增量的80％以上由区直承担，乡镇财政收入占全区财政收入的比例逐年下降，2006年18个乡镇场街提供的工商税收仅占全区工商税收的四分之一，大部分乡镇仅靠预算内收入难以维持正常运转。虽然区乡两级全力以赴培植新的经济增长点，但由于地域环境所限及主客观因素制约，收入来源单一，主体税种缺失，可用财力十分有限，在很大程度上只得依靠税收返还、转移支付和向上争取资金来勉强维持职能运转，区级财政经常处于“等米下锅”的尴尬境地。另一方面，财政管理体制与税收征管体制的不协调，造成地方税收征收成本过高。由于区级政府税收体系不完善，收入自主权小，不仅增加了征收成本，同时也产生了许多矛盾。据统计，仅工商税收就以征管业务费、代征手续费、稽查业务费、超收奖励等名义支付给征收或代征部门达10％以上的费用，如加上征管人员的正常经费，税收成本占税收总额的比重一般都在20％以上。为完成本级预算，基层不得不付出高额成本，甚至花钱“买税”、借钱垫税，严重影响了政府行为。
3、发展根基不牢，债务负担沉重，财政潜在风险较大
农村税费改革前，区级财政的债务缺口可以通过预算外资金或自筹资金的渠道进行弥补，而预算外资金或自筹资金的缺口又可以通过集资、摊派或收费的方式予以解决。税费改革后，取消了“三提五统”和面向农民的集资、摊派及各项收费，从而区乡政府积淀的大量历史性债务缺口难以弥合。早在***成立时，本已承担了原县级孝感市的债务。如为建设开发区和承办第二届全国农运会，原县级孝感市向银行借款3亿余元、原县级孝感市“亿元县(市)财源建设资金”借款1542万元、“普九”建设形成的债务1.3亿元、解决农金会问题向省财政借款5400万元、“城市防洪外国政府贷款”6500万元等等。资料显示，截至2006年 底，***累计应承担的直接债务及或有债务总额为8.73亿元，相当于当年地方一般预算收入的7倍。其中区级债务占71.2％、乡镇债务占28.8％。债务总额已经达到相当惊人的程度。历年的债务积累，加上数额庞大的粮食亏损挂账和专项配套等，平均每个乡镇负债1400万元债务的严峻现实必然波及到原本就不宽松的区级财政，加大潜在风险，并严重侵蚀财政的根基。当勉强维持政府运转的基层财力在不得不用以偿还债务的情况下，必然挤占预算用来保工资、保运转、保稳定的资金，甚至诱发专项资金的挪用、违规和错位，严重影响县域经济发展，制约基层财政职能发挥。随着政策性增资、基础教育支出、公共卫生、农村基础设施建设、社会保障等资金的不断增加，使得区级财政缺口不断加大，财政风险不断增加。近年来，区乡在防范债务风险方面投入了大量的资金和精力，但与此同时，政府的债务风险却仍在不断累积，上级预算扣款、行政诉讼追债、债主上门逼债等尴尬局面屡屡出现，不仅扭曲了政府形象，而且严重影响了区乡社会稳定和财政的稳固平衡。
4、支出管理软化，社保投入不足，供养包袱积重难返
1993年地改市时，原县级孝感市的离退休人员全部留在了***，加之按政策安置的大中专毕业生和复退军人基本上都由区级安置，导致财政供养人员急剧增加。近年来，虽经多方努力加大区乡机构改革和精简人员力度，到2006年底，全区财政供养人数仍高达20453人，财政供养系数为2.41。五年来，区级财政供养人口虽逐年有所减少，但几乎每年的新增财力都用于逐步兑现中央和省出台的津补贴等“人头经费”。但因财力所限，中省出台的增资政策仍不能及时和全额兑现，拖欠额度较大。同时，近年来中央不断出台的一些政策性调资、增资政策，也是加大区级财力缺口的重要因素。此外，地改市时原县级孝感市的多家骨干企业特别是大型的“三线”调迁企业如066厂、238厂、4404厂等均上划市级，原有的直属国有集体的中小企业留给***。留下的这些企业近几年迫于市场竞争压力，纷纷破产倒闭，造成大量企业人员下岗失业，大大加重了***社会保障的支付压力。由于财力拮据，一方面，区乡在基础建设和公共投入上力不从心，另一方面，通过条条下达的资金配套指标不断增加，相当一部分法定支出都要求按规定比例逐年增长，甚至实行”一票否决”，粮食企业亏损挂账贴息、城镇居民最低收入保障补助、医疗改革补助等大量政策性资金需要区级财政兜底。同时工资性支出、行政性支出、政策性支出和社会保障支出不断上升，客观上导致区级财政对上级财力倾斜的过度依赖，财政平衡的责任随之弱化，甚至形成”倒逼”机制，从而不利于区乡因地制宜调节经济、组织收入和配置资源。