从思想政治教育心理学形成和发展过程来看，与思想政治教育学科发展历史一样，它也呈现出发展迅速且不断深化的过程，取得了巨大成绩，作为一门课程、一个相对明确的研究领域、一个学科的地位已经确立。但我们也应该看到，思想政治教育心理学的研究基础还比较薄弱，还没有达到一个成熟学科应有的水平。
1.学科定位的问题
由于思想政治教育心理学是心理学与思想政治教育学的交叉学科，如何确立其学科定位，就成为思想政治教育心理学学科发展的一个基本问题，而定位问题直接影响到学科知识结构的构建和学科归属。在思想政治教育心理学发展的初期阶段，不同学科学者汇聚在思想政治教育心理学的旗帜下，虽然他们对思想政治教育心理学的定位和理解各不相同，但把思想政治教育心理学看成是心理学在思想政治教育中的运用，运用心理学的基本理论和方法，对思想政治教育过程中的心理现象和规律进行研究是其共同的思想主脉，思想政治教育心理学研究主要停留在对心理学理论的“简单移植”、“理论拼接”阶段，自身的学科体系特色不鲜明不突出。到思想政治教育心理学发展中期，一批学者从思想政治教育本体论的角度出发，讨论思想政治教育心理学的问题，初步形成了基于思想政治教育学科视角的思想政治教育心理学知识体系，但是，从已经形成的绝大多数思想政治教育心理学教材和论文来看，思想政治教育心理学从总体上并没有脱离应用心理学或心理学在思想政治教育中的应用的框架。正如有研究者所指出的：“对思想政治教学心理学应有的学科体系和内容体系，还存在较多分歧性看法，仍处于探索之中。”[10]在思想政治教育心理学发展的晚近阶段，虽然思想政治教育心理学的各应用领域有了深入发展，但对其作为一个整体的学科课程体系的探讨则越来越薄弱，相关研究领域的核心作者也没有很好地培育起来，思想政治教育心理学作为一个独立学科的地位受到挑战。2012年教育部公布的《普通高等学校本科专业目录和专业介绍》中，思想政治教育专业的核心课程为：思想政治教育学原理与方法、科学社会主义、政治经济学、马克思主义哲学、中国哲学史、西方哲学史、心理学、伦理学、教育学、中国共产党思想政治教育史等。[11]思想政治教育心理学并没有被列为专业核心课程，表明思想政治教育心理学作为一门学科课程的稳定性存在危机。
其实，思想政治教育心理学的学科问题看似是学科归属的问题，但实质上是学科发展取向的问题，它到底属于心理学，还是属于思想政治教育学，问题并不重要，也许两者的结合正是思想政治教育心理学的优势。事实上，学科仅仅是一种研究的视角，关键在于解决问题和以问题为中心。然而，在思想政治教育心理学建设中，研究者们过多地纠结于它的学科属性问题，而忽视了它在思想政治教育学科中的真正的功能定位，使得学科定位问题一直存在。
2.学科知识结构问题
与思想政治教育心理学学科定位相对应，思想政治教育心理学知识结构的构建也是制约学科发展的重要因素。心理学是一门以自然科学研究方法为价值导向的自然科学、社会科学和思维科学相结合的综合性学科，经过一百多年的发展，心理学已经形成了具有庞大的学科体系、系统的研究方法和多样研究视角的综合性应用学科。思想政治教育心理现象和心理规律虽然涉及心理学研究的方方面面，但作为一门课程的知识体系设计，在宏大的心理学体系面前显得十分不对称，因此，在思想政治教育心理学知识体系的构建过程中，尽管研究者们努力摆脱心理学的束缚，注入更多的思想政治教育内涵，但从学科知识水平来看，只能是处于心理学应用层面。从目前来看，思想政治教育心理学的学科知识来源于基础心理学、发展心理学、教育心理学、社会心理学、人格心理学、咨询心理学等领域，由于庞大的心理学研究成果要在思想政治教育心理学中体现，使得它在体系构建过程中存在很大的困难，造成学科结构的不完整或以偏概全的倾向。
3.学科知识的来源问题
任何学科知识均源自科学研究，思想政治教育心理学也不例外，也就是说，思想政治教育学科的知识应来源于对思想政治教育过程的心理现象的研究。但在思想政治教育心理学研究领域，知识主要源自心理学研究成果，并且更多源自对西方心理学理论的介绍和引进。缺乏自主研究，缺乏对思想政治教育心理现象和心理规律的研究，是思想政治教育心理学难以得到可持续发展的根本原因，这也就造成思想政治教育心理学难以形成核心作者队伍。比如，有研究者利用文献计量学的方法，对1980~2008年期间中国知网数据库收录的“思想政治教育心理学”论文进行分析，结果发现，发表有关思想政治教育心理学论文的作者分布情况是：发表论文仅1篇的作者有444人，占作者总数的97.8%；发表论文在2篇及以上的作者仅占作者总数的2.20%，仅为6人。这说明思想政治教育心理学研究队伍并不稳定，尤其是核心作者并未形成，缺乏长程、持续、深入的研究。[12]知识来源的缺乏、核心作者的缺乏，使思想政治教育心理学研究处于低水平重复状态。
4.研究方法的问题
如前所述，心理学是以自然科学研究方法为基础而形成的综合性的应用学科。但从思想政治教育心理学研究方法的现状来看，目前的研究成果主要采用文献研究、理论构建研究、历史研究、比较研究等研究方法，研究的总体思维方式属于传统思辨哲学研究范式。在思想政治教育心理学教材的编写过程中，较普遍的编写方式是对心理学的理论和方法的介绍与应用，对思想政治教育过程的心理现象进行理论分析，进而进行基础理论体系构建，缺乏对思想政治教育心理过程进行实验、实证研究的积极成果。这表明思想政治教育心理学整体研究的科学性还明显不足。
三、思想政治教育心理学研究的发展趋势
经过30年的思想政治教育专业建设，思想政治教育心理学又处于一个新的历史发展起点。思想政治教育心理学应充分明确学科定位，务实地开展本土化研究，逐渐积累经验，形成队伍，促进思想政治教育心理学的持续健康发展，为思想政治教育学科发展提供坚实的心理学基础。
1.进一步明确思想政治教育心理学的基础性地位
思想政治教育心理学在思想政治教育学科中的基础性地位，是由思想政治教育学科的研究对象确定的。思想政治教育学是以人的思想品德形成和发展规律及实施教育规律作为研究对象的学科。在思想政治教育学科研究过程中，无论是把思想政治教育研究对象看成是一个规律即思想政治教育规律，还是两个规律即人的思想品德形成发展规律和思想政治教育的规律，或者“把人们思想品德形成发展的规律和对人们进行思想政治教育的规律作为自己的研究对象”，[13]人的思想品德发展规律都是思想政治教育学科的基本研究对象。人的思想品德形成和发展规律既是思想政治教育研究的对象，同时也是开展思想政治教育活动的基础。人的思想品德形成和发展规律是思想政治教育心理学研究的主要领域，它为思想政治教育提供基础。从这个意义上看，思想政治教育心理学研究并不是简单地运用心理学知识来提高思想政治教育效果，也不仅仅包括思想政治教育过程中心理现象的研究，它在整个思想政治教育学科中居于基础和核心地位。