第一阶段：学习培训（2005年12月7日——2006年1月6日）
1.搞好思想发动。农村基层党支部（总支）要采取多种形式，通过召开宣传动员会、作形势报告、播放党员电教片等形式，广泛进行思想发动，向农村党员讲清开展先进性教育活动的重要性和必要性、各级党委的部署和要求、本乡镇和本支部的具体安排、对党员和党组织的具体要求。对因各种原因没有参加动员大会的党员，要采取上门动员、电话动员等多种方式进行补充动员，使每个党员充分认识开展先进性教育活动的重大意义，增强参与先进性教育活动的自觉性和积极性。
2.认真组织学习。各村党支部要结合实际，充分利用党员活动阵地，以《中国共产党章程》为学习重点，把党的十六届五中全会精神作为重要内容，学习吴光林、张仁民和市公安局禁毒支队的先进事迹，把学习《云南省第三批保持共产党员先进性教育活动学习读本》与适当学习政策法规、市场经济知识、农村实用技术结合起来，采取集中领学、分散自学、党员互学、结队助学、上门送学、流动讲学、电教辅学、活动促学、建卡督学等9种形式抓好学习。各支部要组织开展“五个一”活动，即：重温一次入党誓词、上一堂党课（含形势教育）、组织一次致富经验交流或实用技术培训、开展一次力所能及的为困难党员和群众送温暖活动、观看一次党员电教片。学习中，要进一步落实副科以上党员领导干部为基层讲党课制度。村“两委”班子的党员干部必须做好学习笔记、撰写心得体会文章，其他党员由党支部结合实际提出具体要求，不搞一刀切。指导组和村党支部（总支）要对读书笔记和心得体会文章分别进行检查和审阅。
3.开展保持共产党员先进性具体要求大讨论。各党支部要积极组织和引导广大党员，对照党章，围绕建设社会主义新农村的历史任务，按照胡锦涛总书记提出的“六个坚持”的标准，结合“云岭先锋”工程“五带头”、市委“六个有”和农村党员设岗定责要求，立足实际，深入开展“心向党，跟着党”，“当初入党为什么？今后我要干什么？”大讨论，进一步明确新时期农村共产党员保持先进性的具体要求，在此基础之上，结合无职务党员设岗定责，确定各自发挥作用的岗位。
第二阶段：分析评议（2006年1月7日——2006年2月6日）
1.广泛征求意见。在认真学习的基础上，党支部要通过召开座谈会、个别谈话、发放征求意见表等形式，广泛征求群众意见，深入查找存在问题，并将征求到的意见按党支部和党员分别进行梳理。梳理的意见可分三类：批评意见、建议意见和肯定意见。梳理意见应坚持原汁原味，但属于人身攻击、发泄私愤的意见不梳理。梳理出的意见要及时向党员和党支部反馈。党支部（总支）和支部负责人的意见由指导组反馈，支部副书记、支部委员、党员村干部的意见由支部书记反馈，党员的意见由支部委员或党小组长反馈。
2.进行党性分析。党支部或党小组要组织党员对照党章和新时期保持共产党员先进性的具体要求，认真总结反思近年来自己在学习、思想、生产和生活等方面的情况，重点查找存在问题。有书写能力的党员要根据自身的实际情况撰写党性分析材料。书写有困难的，在专题组织生活会上作口头陈述和分析，党支部或党小组进行记录。党性分析材料的格式为：第一行居中写标题“党性分析材料”；第二行居中写所在支部及党小组名称、姓名；第三行居中写年、月、日(用小括号)。文章内容包括存在的突出问题及表现、存在问题的原因和今后努力方向。指导组和村党支部（总支）要对党性分析材料进行审阅。
3.开好专题组织生活会。在广泛开展谈心活动的基础上，由党支部或党小组组织召开专题组织生活会。每个党员逐一进行对照检查，进行自我批评，党员之间进行互相评议，开展批评。人数较多或居住较为分散的党支部，经乡镇党委批准，也可以以党小组为单位进行评议，党支部对党员的发言情况要进行认真记录整理。对外出流动党员可采取信函或电话等方式向党支部作一次思想、工作和生活情况汇报。专题组织生活会后，党支部要召开支委会，根据党员的党性分析、专题组织生活会上的评议情况、征求到的意见、查摆出来的问题和党员的一贯表现，以书面形式正式提出对每个党员的评议意见，并进行反馈。评议意见包括三个方面的内容：一是本人思想、学习、工作和作风等方面的表现情况；二是存在的主要问题；三是今后的努力方向。支部召开的专题组织生活会5天前要向乡镇党委报告，指导组负责对各村党支部专题组织生活会的把关指导。