④可产生大片段外源单链DNA(可得到较长的外源DNA之单链序列)由于载体足够小,故可得到长达10kb的外源DNA的单链序列。
3.若干常用的噬菌粒载体
用来自不同丝状噬菌体的基因间隔区插入不同的质粒中,已获得一批噬菌粒。(目前还构建成了一批更加复杂的噬菌粒系统)。若干常用的噬菌粒的基本特征及其寄主菌株列于下表之中。
常用噬菌粒特征一览表
质 粒
pEMBL(From pUC8 pBR322
pRSA101(From?VX
基因间隔区
f1 M13 M13
辅助病毒
IR1, f1的一种抗干扰变异
株
野生型M13噬菌体 一种对于带M13基因间隔区的质粒所引起的干扰具有抗性的M13变异株 M13 K07,其基因II发生突变,相应产物对克隆于pUC119/pUC118的基因间隔区的作用优于对自身间隔区的作用。 M13K07
寄主菌株 71/18 KK2186 XS127 XS101 MV1184
pUC118/pUC119(From pUC18/pUC19
M13
pBluescript f1 XL1-Blue
* pBluescript是一种常用的噬菌粒,它的全名称应是pBluescript M13(+/-),或者是分开写成pBluescript M13+、pBluescript M13-;它们是一对带有f1噬菌体DNA复制起点的载体。该起点以互为相反的方向插入到含有T3和T7噬菌体启动子的一个来自pUC19质粒的载体当中。
4.PBluescript噬菌粒载体 (1)体外转录载体:
定义:将T3、T7或SP60噬菌体的启动子,组入到噬菌粒载体
多克隆位点区(MCS)的两侧,便构成了一类新型的噬菌粒载体,叫体外转录载体。
a. 有一类噬菌体(如T3、T7及沙门氏菌的SP6等)
具有编码自身RNA聚合酶基因
此类phage RNA聚合酶基因的转录活性是由寄主RNA聚合酶控制的。
b. 但是,噬菌体晚期蛋白质“或是子代噬菌体的结
构组份,则是由噬菌体基因编码的。
此类噬菌体基因的转录活性是由噬菌体自身的RNA聚合酶控制的。
c. 噬菌体RNA聚合酶的活性效应具有高度的专一
性,只能转录具有噬菌体待定启动子的基因。而且每一种此类噬菌体的RNA聚合酶所识别的自身启动子也是高度特异的。
由于上述这三种原因,所以将T3、T7或SP6噬菌体的启动子
序列组入到噬菌体载体的多克隆位点区(MCS)的两侧,便构成了一类新型的噬菌粒载体,特称为体外转录载体(in vitro transcription vectors)。
在体外系统中,加入适当的噬菌体RNA聚合酶,就可使相应的噬菌体启动子发生功能作用,从而使插入在多克隆位点中的外源DNA发生转录作用。*
*即加T3 RNA聚合酶,就会启动T3启动子进行转录;加入T7 RNA聚合酶就会启动T7启动子进行转录。 (2)pBluescript噬菌粒载体的结构特征 名称的来源与沿革:
“pBluescript”是一专用商品名称,系指由Stratagene公
司发展的一类从pUC载体派生出来的噬菌粒载体。 此类载体正名为:pBluescript M13(+/-) 以后改名为:pBS(+/-)
现在叫做:pBluescript KS(+/-)或pBluescript SK(+/-) 符名注释:
*1.SK表示多克隆位点区的一种取向,即lacZ基因是按照SacI→KpnI方向转录的。
*2.KS表示多克隆位点区的另一种取向,即lacZ基因是按照KpnI→SacI方向转录的。
*3.(+/-)表示单链噬菌体f1复制起点的两种相反取向。 pBluescript噬菌粒载体的结构特征:
pBluescript噬菌粒是从pUC19派生而来的分子量为3204bp的噬菌粒载体。它带有如下主要组成部分:
*1.1个ColE1质粒的复制起点——产生双链DNA *2.1个氨苄青霉素抗性基因——供作转化子克隆的选择记号
*3.1个来自pUC19的多克隆位点区——用以克隆外源基因
*4.围绕多克隆位点区(MCS)两侧的T3和T7启动子——指导外源基因的转录活性
*5.1个lacZ基因——供Xgal-IPTG显然反应,选择重组子
*6.1个M13复制起点——产生单链DNA
pBluescript噬菌粒结构特征:
图5-40 pBluescript SK(+/-)噬菌粒载体的分子结构图
它是从pUC19质粒载体派生而来的。SK表示多克隆位点区的一种取向,即lacZ基因是按照SanI→KpnI的方向转录的;反之,KS则表示多克隆位点区的另一种取向,即lacZ基因是按照KpnI→SacI方向转录的。(+/-)表示单链噬菌体f1复制起点的两种相反的取向。其中,f1(+)起点表示,当pBluescript噬菌粒载体和辅助噬菌体共感染寄主细胞时,能够回收到lacZ基因的有意义链DNA,即?-半乳糖苷酶基因的编码链DNA;而f1(-)起点则表示,当pBluescript噬菌粒载体与辅助噬菌体共感染寄主细胞时,可回收到lacZ基因的无意义链DNA,即?-半乳糖苷酶基因的非编码链DNA。
(3) pBluescript噬菌粒载体的体外转录
*1. pBluescript噬菌粒载体具有双向转录功能的原理。 在该噬菌粒载体的MCS序列区的两侧,分别存在着两个启动子,即T3和T7。因此当某一特定的外源DNA插入在MCS上的任何位点上,便有可能发生两种不同的体外转录反应: