图5-41 pBS(+)噬菌粒载体的多克隆位点区之插入DNA片段的体外转录作用 (a)pBS(+)多克隆位点的结构,示限制性位点顺序;(b)T3启动子指导的体外转录,合成出(-)链的RNA转录本,其重组体分子被SmaI切割线性化;(c)T7启动子指导的体外转录,合成出(+)链的RNA转录本,其重组体分子被XbaI切割线性化。
MCS中限制酶位点的顺序:
自T3启动子至T7启动子的顺序是:
T3-Sph1-Pst1-SalI-XbaI-BamHI-SmaI-KpnI-SacI-EcoRI-T7 a.(-)链RNA转录本的合成
从MCS中限制酶位点顺序可知,自T3启动子起动的转录反应,使外源插入DNA中的(-)链转录成mRNA,叫做(-)链RNA转录本(见上图b)。 b.(+)链RNA转录本的合成
自T7启动子起动的转录作用,使外源插入DNA分子中的(+)链转录成mRNA分子,叫做(+)链RNA转录本(见上图c)。
(4) pBluescript噬菌粒载体的用途
pBluescript噬菌粒载体在基因工程及分子生物学研究中用途
广泛,主要的有如下几点:
a. 制备同位素标记的DNA杂交分子探针:
—— 基因文库或cDNA文库筛选;Southern杂
交及Northern。
b. 制备克隆基因的转录本 c. 合成克隆基因编码的蛋白质
5.pUC118和pUC119噬菌粒载体
(1)pUC118和pUC119噬菌粒的分子结构
① 这一对噬菌粒载体是由质粒pUC18和pUC19和野生型噬菌体M13的基因间隔区(IG)重组而成。
② 在M13的IG间隔区(长476bp)具有M13的复制起点。 ③ pUC118和pUC119两个噬菌粒载体除了MCS区序列取向彼此相反之外,两者的分子结构完全相同。
图5-36 pUC118和pUC119噬菌粒载体的分子结构
(2)pUC118和pUC119的复制模式 a.质粒复制型
当其寄主细胞没有感染上辅助噬菌体M13的情况下,这两个噬菌粒载体(pUC118和pUC119)的复制是受来自ColE1质粒的复制起点控制的,即按照双链质粒DNA一样复制,称质粒复制型。 b.噬菌体复制型
当寄主细胞受到辅助噬菌体M13感染之后,噬菌粒载体pUC118和pUC119便会按照M13噬菌体的滚环模型进行复制。此时它们是受位于pUC质粒上的M13噬菌体之复制起点控制的,此种复制称为噬菌体复制型。
当噬菌粒载体按照噬菌体复制模型进行复制时,所产生的单链载体RNA分子,同样也可以被包装进由辅助噬菌体提供的外壳蛋白质,形成的噬菌体颗粒随后便被挤压出寄主细胞。 c.辅助噬菌体(helper phage)
*1.协助相关的克隆载体,并与之一道进入寄主细胞,并为克隆载体的复制提供所需核酸酶及其它蛋白质(如包装用的外壳蛋白质),这样的噬菌体称辅助噬菌体。
*2.最常见的辅助噬菌体是M13的一种派生菌株M13K07。辅助噬菌体是一类自身DNA复制效率极低的突变体。既然如此,它们自身又是如何遗传的呢?——当寄主细胞不存在pUC118和pUC119的情况下,辅助噬菌体表达的复制蛋白质,可以同突变的复制起点结合,尽管复制效率有限,但仍可产生出足够数量的M13K07噬菌体,保证了遗传的稳定性。
图5-37 pUC118和pUC119噬菌粒载体的两种复制模型 (a) 在无辅助噬菌体的条件下,按双链质粒DNA的复制模型复制; (b) 在有辅助噬菌体条件下,按单链噬菌体DNA的滚环复制模型复制。
(3)pUC118和pUC119的优点
a. 具有cccDNA,可克隆10kb外源DNA,容易操作; b. 编码ampr基因,供作选择记号;
c. 具高拷贝数(500/cell),故只需少量的培养物,便可制备到大
量的外源DNA;
d. 存在多克隆位点,便于基因克隆与插入;
e. 可以按照xgal-IPTG组织化学显色反应试验,筛选重组体分子;
f. 插入的外源基因可也?-半乳糖苷酶形成融合蛋白质的形式进行表达;
g. 含有一个质粒复制起点,在没有辅助噬菌体的情况下,可产生出大量的双链DNA分子;
h. 含有一个M13噬菌体复制起点,在具辅助噬菌体的条件下,可合成出大量的单链DNA,形成噬菌体颗粒;
i. 在pUC118和pUC119两个载体中,MCS的序列取向彼此相反,故两者可分别转录克隆基因的正链和负链,形成(+)链RNA和(-)链RNA;
j. 无需亚克隆便可直接对克隆的DNA进行核苷酸序列测定; (4) pUC118和pUC119噬菌粒载体的克隆程序 a.体外重组:克隆的外源DNA同载体分子连接
↓
b.转化:将连接混合物转化具lacZ△15的E.coli之Amps表型