究信息交汇的枢纽，成为交流的组织者和建议者。在这一过程中要注意观察每一个学生在品德、能力、个性方面的发展，给予适时的鼓励和指导，帮助他们建立自信并进一步提高学习积极性。教师的指导切忌将学生的研究引向已有的结论，而是提供信息、启发思路、补充知识、介绍方法和线索，引导学生质疑、探究和创新。
在此过程中教师要监控课题的进展，指导学生选择最佳的研究方法、快捷有效地获取有价值的课题信息，及时了解学生在研究中出现的问题，有针对性地进行指导等。
另外，教师必须通过多种方式争取家长和社会有关方面的关心、理解和参与，与学生一起开发对实施研究性学习有价值的校外教育资源，为学生开展研究性学习提供良好的条件。教师要指导学生写好研究日记，及时记载研究情况，真实记录个人体验，为以后进行总结和评价提供依据。
实施阶段可能出现的一些问题及对策如下所列。
1．研究“一时热”，过程中不能坚持
针对学生不能长期坚持的对策有三：一是真正将过程性评价做到位，明确告诉学生，要“结题”，过程中必须努力，从评价上给学生一个导向；二是加强指导教师对课题指导的监督，要求各课题组定期提交阶段研究报告，并经常与课题组保持沟通，了解课题的最新进展情况；三是不断激励，在检查学生进度的同时，要巧妙地对学生已做的工作进行肯定，鼓励其继续下一步的研究。
2．工作“走形式”，研究不到位
遇到这种情况，指导教师一定要充分重视，一方面要强调科学研究的严肃性，不允许有任何不严谨或虚假的结论，另一方面，加强对学生科研方法的指导，把课题研究逐步引向深入。
3．组长“挑大梁”，团队合作差