地区，现在只有村寨附近的“龙山”上保存完整，其他大部分地区已开辟为热带作物种植园和农田。
本区是云南省发展橡胶的主要基地之一。热带经济作物、药用植物和香料植物栽培普遍。
按生态服务功能的重要性和生态环境敏感性的一致性进一步分为2个生态功能区。 2．西双版纳北部中山盆地季雨林生态亚区（Ⅰ2）
包括西双版纳州北部以及普洱市的孟连、西盟等县，面积14916平方公里，占全省国土面积的3.89%。
本区是我省西南部山原与边缘山间盆地的过渡部位，地势从北向南倾斜，澜沧江从中部纵贯，年平均气温19～20℃，年降水量1400～1600毫米，热带山地雨林为区内的典型生态系统类型，常与季风常绿阔叶林在同一个海拔高度范围内交错分布。
本区是云南省茶叶的主产区，海拔较低处可种植橡胶等热带作物。
按生态服务功能的重要性和生态环境敏感性的一致性进一步分为3个生态功能区。 3．滇西南中山宽谷半常绿季雨林生态亚区（Ⅰ3）
包括德宏州大部分地区和临沧市最西部，面积13642平方公里，占全省国土面积的3.56 %。
区内山地与河谷平行相间，呈东北－西南走向伸延，年降水量多在1400～1700毫米之间，羯羊河谷在2000毫米以上。是云南省的多雨区之一，年均温为19～20℃，热量充足。
典型生态系统类型为半常绿季雨林，目前仅于南丁河下游和盈江铜壁关自然保护区残存。海拔900米以下的坝区，村寨附近普遍种植经济作物。橡胶在海拔1000米以下品种选择适当，可成片种植。
按生态服务功能的重要性和生态环境敏感性的一致性进一步分为2个生态功能区。 4．滇南中山峡谷湿润雨林生态亚区（Ⅰ4）
包括红河州、文山州的南部和普洱市东南角的江城一带，面积16406平方公里，占全省国土面积的4.28 %。
本区沿云南东南部边缘成狭长的窄带状分布，南与越南相接。区内地貌复杂，西段为哀牢山的南端，地势较高，受到红河及其支流藤条江，南溪河，李仙江等强烈的下切，形成峡谷中山地貌。东部为文山州南部边缘的岩溶高原。元江与南溪河会合处的河口附近，海拔仅76.4米，为省内的最低点，年平均温达22℃以上，≥10℃积温超过8000℃，最冷月均温在15℃以上，最热月均温达27℃左右。全年降水量达1500-1800毫米左右。
东部是省内仅有的湿润雨林分布的区域，含云南龙脑香、毛坡垒，隐翼的湿润雨林分布局限于海拔约500米以下幽闭的深沟谷的潮湿生境中。西部谷地开阔，人口密集，人为活动对自然植被的影响十分严重，原始森林早已荡然无存。
本区是省内生物多样性分布的重点区域之一，鉴于生物多样性在东西分布的差异，东部地区主要保护以热带湿性雨林、季雨林和山地苔藓常绿阔叶林为主的生态系统，而西部地区则是保护在季风常绿阔叶林地区分布的尚存珍稀濒危物种。
本区仅一个生态功能区。
5．梁河、龙陵中山山原季风常绿阔叶林生态亚区（Ⅱ1）
包括梁河，龙陵和盈江县北部，面积4821平方公里，占全省国土面积1.26%。 本区位于怒江以西，以中山峡谷地貌为主。年平均气温为18.3℃，年降水量为1300毫米左右。高黎贡山西坡的龙陵一带，年降水量高达2595毫米，是省内的多雨区之一。
地带性植被为季风常绿阔叶林，但仅在山地有小片保存，云南松林分布广泛。因人为活动频繁，水土流失较严重，该区的气候和地形地貌决定了其为云南西南部的水土流失多发区。
本区仅一个生态功能区。
6．临沧山原季风常绿阔叶林生态亚区（Ⅱ2）
包括昌宁、施甸、云县、永德4县的大部分地区，面积20285平方公里，占全省国土面积的5.3%。
本区为怒江东侧的中山山原，地势崎岖，高山和低河谷之间的垂直差异较大。年平均气温17～19℃，热量充足，年降水量1000～1200毫米。地带性植被为季风常绿阔叶林，现存植被以云南松林分布较为广泛。干热河谷多见稀树灌丛草地，茶园面积较大，是省内重要的茶区，低海拔谷地以甘蔗，棉花为主要经济作物，紫胶产量丰富。
按生态服务功能的重要性和生态环境敏感性的一致性进一步分为3个生态功能区。 7．澜沧江、把边江中游中山山原季风常绿阔叶林、暖性针叶林生态亚区（Ⅱ3） 包括普洱市除江城县南部、西盟县南部、景东县北部和孟连县以外的全部区域，面积38979平方公里，占全省国土面积的10.18 %。
南北走向的大小河流把本区的高原面分割为中山山原与河谷相间的地貌。年均温17～19℃，年降水量的分布趋势为从南向北减少，季风常绿阔叶林多残存地分布于局部坡面及浅沟地带，墨江通关以南，思茅松林广泛分布。
由于长期人为活动影响，高原面上原生森林保存较少，盆地内大部分土地已耕垦成为农田。河谷中紫胶虫寄生树较多，是我国发展紫胶的重要基地，具有发展生态大农业和生态城镇的良好区位优势。
按生态服务功能的重要性和生态环境敏感性的一致性进一步分为5个生态功能区。 8．蒙自、元江岩溶高原峡谷暖性针叶林生态亚区（Ⅱ4）
包括红河州大部分地区、玉溪市南部地区以及文山州西部的平远街等地，面积24764平方公里，占全省国土面积的6.47%。
本区是滇东南高原陷落盆地较发达的地段。年降水量在800-1000毫米左右，年均温18.50℃，河谷内的元江盆地，年均温高达23.9℃，≥10℃积温达8800℃，是我国大陆上热量最丰富的地区。
红河河谷海拔1000米以下，有干热河谷稀树灌木草丛广泛分布，海拔1000米以上云南松林分布较广，蒙自、建水、开远等盆地周围，天然植被受到破坏后，缓坡地段主要是多刺灌丛，甘蔗种植较多，开远、元江等县是省内重要的蔗糖基地。
按生态服务功能的重要性和生态环境敏感性的一致性进一步分为4个生态功能区。 9．文山岩溶山原季风常绿阔叶林生态亚区（Ⅱ5）
本区占据滇东南南盘江与红河水系之间分水岭的偏南部分，包括文山、麻栗坡、富宁县的大部分地区以及砚山、广南县的南部，面积16406平方公里，占全省国土面积的4.28%。
本区为岩溶山原地貌，地势起伏不大，年降水量为1200毫米左右，文山、砚山等县偏西部分雨量较少。年均温14℃左右，夏季气温高，热量水分的季节配合逐渐带有我国东部季风区域的特色。
植被的垂直分异不明显，基质条件对植被分布的制约作用突出。在泥岩，砂页岩基质上以刺栲，木莲为标志的季风常绿阔叶林发育较好，而石灰岩山地则为以短序桢楠，滇润楠为主的常绿阔叶林分布。岩溶发育的山坡因缺水少土，大都为石灰岩灌木草丛，是石漠化较为严重的地区。
按生态服务功能的重要性和生态环境敏感性的一致性进一步分3个生态功能区。 10．滇中高原谷盆半湿润常绿阔叶林、暖性针叶林生态亚区（Ⅲ1）
包括昆明市、玉溪市北部、楚雄州大部分地区、曲靖市南部和文山州的北部地区，面积 89204平方公里，占全省国土面积的23.29%。
本区是省内最大的生态亚区。地势为较为平整的丘陵状高原，气候终年温和，冬无严寒，夏无酷暑，干湿季分明。年平均气温在15℃左右，年降水量800～1000毫米。是以滇
青冈、黄毛青冈、高山栲、元江栲为主的半湿润常绿阔叶林类型的典型分布地区，云南松林分布广泛，是现存的主要森林类型。
区内高原湖泊较多，有滇池、洱海、抚仙湖、阳宗海、星云湖等，湖面高程在1700-2000米之间，多为断陷成因而呈南北向伸延，面积数十到数百平方公里不等。这些高原湖泊的流域区是云南省政治、经济、文化的中心和环境污染最为严重的地区。
按生态服务功能的重要性和生态环境敏感性的一致性进一步分为15个生态功能区。 11．滇中北中山峡谷暖性针叶林生态亚区（Ⅲ2）
包括华坪、永胜、永仁、大姚县大部分地区和宾川县以北地区，面积25664平方公里，占全省国土面积的6.70%。
地貌以中山峡谷为主。是省内最突出的少雨干旱地区之一，年降水量仅为800毫米左右，红色砂页层分布较多，抗侵蚀能力较低，土壤冲刷较重，保水能力差。
地带性植被主要是半湿润常绿阔叶林，尚存的天然林仅见于人烟稀少、交通不便的偏僻地区及寺庙附近，现存植被主要是云南松林和松栎混交林分布，干热河谷植被发达，山地硬叶常绿栎类林分布广泛。
本区是金沙江在云南的主要干流区，人为活动密集，生态环境破坏严重，尤以干热河谷和水土流失问题较为突出。
按生态服务功能的重要性和生态环境敏感性的一致性进一步分为5个生态功能区。 12．滇中西北高中山暖性针叶林，寒温性针叶林生态亚区（Ⅲ3）
包括玉龙县和宁蒗县，以及剑川、鹤庆、洱源县的北部等地区，面积 19519平方公里，占全省国土面积的5.10%。
本区地势由西北向东南倾斜。金沙江自塔城附近从青藏高原的东南缘进人本区后，在石鼓附近转折取北北东流向、到川滇交界的三江口，汇合北来的无量河后，又转向取南北向南流，形成连续的大转折峡谷。玉龙雪山和哈巴雪山雄峙在金沙江的虎跳峡两侧，高山深谷相间，非常险峻，东部年降水量在900～1000毫米，偏西部分则年降水量700-800毫米。
成片的常绿阔叶林在坝区及附近山地已很难见到，云南松林在山地区分布很广，玉龙雪山、哈巴雪山等极高山地，发育有极为发达的植被垂直系列，从山麓的亚热带类型直到高山冻荒漠植被都有出现。本区是水源涵养、生物多样性保护和生态旅游的重要区域。
按生态服务功能的重要性和生态环境敏感性的一致性进一步分为4个生态功能区。 13．滇东北高中山暖性针叶林、亚高山草甸生态亚区（Ⅲ4）
包括昭通市西南部大部分地区以及会泽县、宣威县和东川区的北部等地，面积20154平方公里，占全省国土面积的5.26%。
地貌以高原和山地为主，起伏较为和缓，西侧连接金沙江河谷，气候偏干冷凉，年降水量750～1000毫米，干湿季分明，气候有向我国东部亚热带过渡的色彩。因长期人为破坏，森林保存很少。现有植被主要是云南松林，荒山坡地以禾草草丛和有刺灌丛为主，牛栏江谷地有干热河谷植被，西部的药山植被垂直系列发达，但现存植被主要属次生类型，海拔3300米以上，有辽阔的亚高山草场，利于放牧，温带性的落叶果木品质较好。
本区是省内人口密集地区之一，由于开发较早，生态破坏较为严重。
按生态服务功能的重要性和生态环境敏感性的一致性进一步分为5个生态功能区。 14．澜沧江高中山峡谷暖性针叶林、寒温性针叶林生态亚区（Ⅲ5）
包括维西县大部分地区、兰坪县和大理州的西部，面积14222平方公里，占全省国土面积的3.71%。
地貌属滇西北横断山纵谷区的一部分，高山纵谷相间并列，年温差较大。降水量900～1000毫米，主要生态系统类型为半湿润常绿阔叶林，现有森林植被以云南松林面积最广，海拔3600米以上逐渐过渡为杜鹃灌丛和高山草甸。本区地处澜沧江和金沙江的分水岭地带，含有丰富的矿产资源，高山峡谷区的水源涵养和水土保持极为重要。
按生态服务功能的重要性和生态环境敏感性的一致性进一步分为2个生态功能区。 15．高黎贡山、碧罗雪山高中山峡谷常绿阔叶林生态亚区（Ⅲ6）
本区东界位于怒江与澜沧江之间的分水岭，西面连接中缅边界以西的恩梅开江谷地东侧山地，包括泸水、福贡、贡山三县，面积8978平方公里，占全省国土面积的2.34%。
本区是横断山脉纵谷区的最西部分，西有高黎贡山，东有怒山，怒江峡谷深嵌其间，地势起伏十分剧烈，不同海拔的气温垂直差异十分明显，年降雨量在怒江河谷以东1200～1500毫米，怒江河谷以西的中缅边界达到3000 毫米以上，是省内多雨区之一。
生态系统类型丰富，植被垂直分布明显，具有云南中、西部植被与东喜马拉雅南翼山地中上部之间的过渡性特点，是生物多样性保护的关键地区。
本区仅一个生态功能区。
16．滇西中山山原半湿润常绿阔叶林、暖性针叶林生态亚区（Ⅲ7）
包括腾冲、昌宁县和隆阳区，以及漾濞、永平县等的大部分地区，面积20334平方公里，占全省国土面积的5.31%。