滇西北横断山高山峡谷相间的地貌到本亚区内已逐渐舒展，基本上是谷间高原和山原，区内热量、水分条件都具有高原亚热带北部的气候特色，年均温15℃，年温差10-12℃，年降水量1000～1500毫米。
主要生态系统类型是由高山栲、石栎和樟科树种组成的常绿阔叶林和云南松林，旱冬瓜林分布亦较广，怒江峡谷等河谷内，海拔约1300米以下多见干热河谷稀树灌丛草地。经济林木以茶树的种植最为著名，茶园面积大，茶质优良，是省内较集中的茶区；漾濞、永平县是省内核桃的主要产地之一。
按生态服务功能的重要性和生态环境敏感性的一致性进一步分为4个生态功能区。 17．滇东北中山河谷湿润常绿阔叶林生态亚区（Ⅳ1）
包括彝良、威信、永善、水富、绥江县等，面积9870平方公里，占全省国土面积的2.58%。
地势南高北低，是四川盆地西南部向云南高原东北部过渡的大斜坡。气候与四川盆地西南部相似，但因地貌复杂而局部差异较多，垂直变化明显。年降水量1200毫米左右，主要集中在夏秋两季，年日照百分率为25%左右，冬暖夏热，终年湿润，热量充足。
河谷内及两侧海拔较低的部分，生态系统类型与四川盆地西南部相类似，沿金沙江和横江的低丘和台阶地，原生植被破坏殆尽，因气温较高，加之河谷内焚风作用较强，表土冲刷较严重，生境较为干燥。本区是云南省人口最为密集的区域之一，人多地少的现象十分突出，由于开发较早，生态环境极为恶劣
按生态服务功能的重要性和生态环境敏感性的一致性进一步分为2个生态功能区。 18．镇雄岩溶高原湿润常绿阔叶林生态亚区（Ⅳ2）
以镇雄县为主，包括彝良南部地区，总面积为4255平方公里，占全省国土面积的1.11% 岩溶地貌发育，气候与贵州省西北部份地区相似，冬半年阴冷多雪、多雾，夏半年亦多受北来冷空气影响而温凉多雨，全年雨日很多，多为牛毛细雨，日照少。年均温为11.4℃，年降水量900毫米左右，但湿度较高，年平均相对湿度达84%，蒸发弱，终年较潮湿而无明显的干季。森林保存很少，人为活动强烈，生态环境破坏严重。
本区仅一个生态功能区。
19．德钦、香格里拉高山高原寒温性针叶林，高寒灌丛草甸生态亚区（Ⅴ1） 包括德钦、维西、香格里拉县的大部分及贡山县的部分地区，面积1.63万平方公里，占全省国土面积的4.26%。
本区是青藏高原的东南缘，气候寒冷，是全省人口密度最少的区域，生态环境质量相对较好。本区是三江并流地区的核心地带，是生物多样性和高山峡谷景观集中分布的区域，也是我省的主要林区之一。
按生态服务功能的重要性和生态环境敏感性的一致性进一步分为2个生态功能区。 云南省生态功能区的二级区（生态亚区）的空间分布见《云南省生态功能二级分区图》 （三）生态功能区
云南省生态功能区划中65个生态功能区的概况见表1。空间分布见图3《云南省生态功能三级分区图》。
表1 云南省生态功能区划简表 生态功能分区单元 生态区 生态亚区 生态功能区 Ⅰ1-1澜沧江下游低山宽谷农业生态功能区 所在区域与面积 景洪、勐海县的南部地区，勐腊县的西部地区，面积5690.40平方公里 主要生态特征 大部分地区为海拔1000米以下的低山宽谷，坡度平缓。热量和雨量充沛，地带性植被为热带季节雨林和季雨林，地带性土壤为砖红壤 主要生态 生态环主要生态系统环境问题 境敏感性 服务功能 旅游业造成的环境污染和热带景观破坏 保护措施与发展方向 生境极为敏感 Ⅰ季风热带北缘热带雨林生态区 Ⅰ1 西双版纳南部低山盆地季节雨Ⅰ1-2南林生态亚区 腊河低山河谷生物多样性保护生态功能区 Ⅰ2-1南Ⅰ2 西双版拉河、南纳北部低山朗河低山盆地季节雨河谷农业林生态亚区 生态功能区 以热带经济作物为主的生态农业和以热带风光为主的生态旅游 防止水土流失和土地退化；注意保护特有的热带景观和民族文化风情，防止由于旅游带来的生态环境破坏 勐腊县南部地区，面积为4479.26平方公里 以山间盆地地貌，生态系统类型以季节雨林为主。典型土壤类型为暗色砖旅游业造红壤，局部有棕色石灰土成的环境与红色石灰土。河漫滩，污染等 沟谷底部及局部低洼地有沼泽土及草甸土分布 低山河谷地貌为主，年降水量在1400-1600毫米之间。主要河流有南拉河、南朗河。地处热带北缘与亚热带南部的交错地带，生态系统类型较多 土地利用不合理带来的景观破碎化和自然资源的破坏 生物多样性保护的关键地区和敏感地区。生境高度敏感 以热带雨林和热带珍稀物种为主的生物多样保护 限制外来物种的引种，限制经济开发活动，发展以热带景区为主的生态旅游，结合国际大通道的建设，发展边贸经济，恢复热带雨林 勐海县北部、澜沧和西盟县南部地区，孟连县，面积7645.04平方公里 生态农业和以土壤侵蚀茶叶生产为主高度敏感 的生态经济林。 合理利用土地资源、发展以热带经济作物为主的生态农业，保护农业环境、推行清洁生产，防止水土流失和面源污染 生态功能分区单元 生态区 生态亚区 生态功能区 Ⅰ2-2澜沧江下游低山宽谷生物多样性保护生态功能区 Ⅰ2-3勐腊江城低山丘陵水土保持生态功能区 所在区域与面积 景洪市的北部地区，与勐海、宁洱县的部分交接区域，面积为3960.92平方公里 勐腊县北部地区，江城县大部分地区，面积为3310.28平方公里 主要生态特征 低山宽谷地貌为主。年降雨量1500～2000毫米左右。生态系统类型以热带雨林和亚热带季风常绿阔叶林为主。土壤以砖红壤和赤红壤为主 低山丘陵地貌为主。云南省三大多雨区之一，年降雨量可达到2000毫米以上。地带性植被主要是季风常绿阔叶林， 土壤类型以赤红壤为主 主要生态 生态环主要生态系统环境问题 境敏感性 服务功能 热带地区经济作物种植带来的环境影响和生境破坏 土地利用合理的带来的水土流失和土地退化 热带与亚热带生态交错区，生境高度敏感和极高度敏感 保护措施与发展方向 以亚洲象和山地雨林为主的生物多样性保护。 加强保护区建设和管理、控制经济开发规模，保护生态系统的完整性、防止生境破坏和生境破碎化以及旅游带来的环境影响 西双版纳东北土壤侵蚀调整土地利用结构，加大封山育林力部低山丘陵地高度敏感 度，提高森林覆盖率，防止水土流失 区的水土保持 Ⅰ3 滇西南中山宽谷半常绿季雨林生态亚区 Ⅰ3-1大盈江、南畹河下游中山丘陵农业生态功能区 瑞丽、潞西，陇川，盈江、梁河以及龙陵县的南部地区，面积9332.67平方公里 为中山丘陵地貌为主，年降水量1400-1700毫米，地带性植被类型为季风常绿阔叶林。地带性土壤类型为赤红壤、红壤 旅游业和不合理的热区开发带来的生态破坏 生境高度敏感和极为敏感、土壤侵蚀极为敏感 发展生态农业和以蔗糖为主热带作物、以澳洲坚果和柠檬为主的热带经济林 保护农业生态环境，防止水土流失和旅游和边境贸易带来的环境污染，推行清洁生产，加强国际大通道的建设 生态功能分区单元 生态区 生态亚区 生态功能区 Ⅰ3-2南汀河岩溶低山河谷林业与水土保持生态功能区 所在区域与面积 耿马、沧源、镇康县的东部地区，面积4309.84平方公里 主要生态特征 以低山河谷地貌为主，年均温为19－21.5℃。地带性植被主要是季风常绿阔叶林和热带山地季雨林。地带性土壤主要是赤红壤 西段为峡谷中山地貌；东部为低谷和中山。年降水量达1500-1800毫米浓雾，地带性植被东部是热带湿润雨林、季雨林和山地苔藓常绿阔叶林，西部是季风常绿阔叶林 主要生态 生态环主要生态系统环境问题 境敏感性 服务功能 土地过度垦殖带来的土壤侵蚀和石漠化 土壤侵蚀高度敏感，石漠化高度敏感 保护措施与发展方向 云南西南岩溶地区的土壤流失和石漠化防治 调整农业结构，发展以热带木本经济作物为主的生态农业和生态林业，严禁陡坡耕种，预防石漠化 Ⅰ4滇南中山峡谷湿润雨林生态亚区 Ⅰ4-1红河下游低山河谷生物多样性保护生态功能区 富宁、麻栗坡、马关、河口、金平、绿春县的南部、江城县的东部地区，面积10493.89平方公里 生境破碎化和生物多样性减少 生境高度敏感、部分地区石漠化中度敏感 东部保护以热带湿润雨林、季雨林和山地苔藓常绿阔叶林为主的生态系统，西部保护尚存珍稀濒危物种 东部地区保护热带雨林、严格限制种植经济林，防止生境的破碎化。西部地区保护珍稀濒危物种，加强农田生态系统的保护和建设，关注矿产资源开发的合理性，防止出现石漠化 Ⅱ高原亚热带南部常绿阔叶林生Ⅱ1 梁河、龙陵中山山原季风常绿阔叶林生态亚区 Ⅱ1-1大盈江、龙川江上游水土保持生态功能区 盈江、梁河、龙陵县的北部地区，腾冲县南部，面积4821.50平方公里 大部分为中山峡谷地貌，年均温为18.3℃，年降水量为1300毫米左右。主要植被类型为季风常绿阔叶林、大面积为次生植被 土地不合理利用带来的土壤大盈江、龙川土壤侵蚀侵蚀、泥江上游的水土高度敏感 石流、滑保持 坡等地质灾害突出 山地多留水源林，巩固和扩大小黑山自然保护区的建设，河谷地带调整土地利用方式