小片段和一条大片段时,启动子是以正义连接到载体上,而若得到约602bp片段和另一条大片段时,说明是反义载体。结果表明,即得到了正义(1号)和反义(2号)两个载体。
2.3.5 克隆的启动子序列测定:
为了进一步验证所克隆的启动子片段的正确性,将正义连接的载体送到公司进行了序列测定。
Query 1 TATTTGTTAAACATTTTTTATTATGAGTGGAACATAACAAATTTAGGAGTTGAAACTTTT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1391 TATTTGTTAAACCTTTTTTATTATGAGTGGAACATAACAAATTTAGGAGTTGAAACTTTT 1332
Query 61 atttaaaGAGTGGTATAATTTTTAAAACAAAATCCGAAACTCGTCTTAATCTTGATTAAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1331 ATTTAAAGAGTGGTATAATTTTTAAAACAAAATCCGAAACTCGTCTTAATCTTGATTAAA 1272
Query 121 AGGCaaaaataatttttaaataaaatttatttcattttatatataatctaataacataat 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| Sbjct 1271 AGGCAAAAATAATTTTTAAATAAAATTTATTTCATTTTATATACATTCTAATAACATAAT 1212
Query 181 tttatttttcccaagaatttgtatttatgaattacatattttatatGTTGAAAGGTGAAA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1211 TTTATTTATCCCAAGAATTTGTATTTATGAATTACATATTTTATATGTTGGAAGGTGAAA 1152
Query 241 ACACTCGTCCCATCTCCCATCCTTCCatttatttactaatttttttaataattaaattta 300 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1151 ACACTCGTCCCATCTCCCATCCTTCCATTTATTTACTAATTTTTTTAATAATTAAATTTA 1092
Query 301 AGTTCTTTGAAAGGAACTAGGAAGCTCAAGTGGCTCAGCGAACACATGAGCATAGAAAAG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1091 AGTTCTTTGAAAGGGACTAGGAAGCTCAAGTGGCTCAACGAACACATGAGCATAGAAAAG 1033
Query 361 CGTTCTTACAACCTTGAACTCGATAATATCAGGCaaaaaatggaaattaattacaaaaat 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1032 CGTTCTTACAACCTTGAACTCGATAATATCAGGCAAAAAATGGAAATTAATTACAAAAAT 973
Query 421 aaattgaaatggaaaattcaaaGGTGTTTttattattattattattTTCTTTTCTTAAAA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 972 AAATTGAAATGGAAAATTCAAAGGTGTTTTTATTATTATTATTATTTTCTTTTCTTAAAA 913
Query 481 TCTTGAGGGTATAGAATTGGTAAAAAGGTAAAATCGGGTTTGGCTGGTGGGTCGTGTATG 540 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
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Sbjct 912 TCTTGAGGGTATAGAATTGGTAAAAAGGT-AAATCGGGTTTGGCTGGTGGGTCGTGTATG 853
Query 541 TCTCGGAGGAGACTGGCTAGTGGATGATACACAATTCATAATCTCTGACAGAGATAATGA 600 ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 852 TCTTGGAGGAGACTGGCTAGTGGGTGATACACAATTCATCATCTCTGACAGAGATAATGA 793
Query 601 CAAGTCTTTTCTT--CTC-T---CTT-TC-GCTTATCACATTCAAAATTATCATCAATGA 652 ||||||||| ||| ||| | ||| || | |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 792 CAAGTCTTTGCTTCCCTCTTGCGCTTATCAG-TTATCACATTCAAAATTATCATCAATGA 734
Query 653 TACAACACCCCTTTTAACCACAAAAGTTAAAAATGAGAGGCCTATTGGCTATACATTTCA 712 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 733 TACAACACCCCTTTTAACCACAAAAGTTAAAAATGAGAGGCCTATTGGCTATACATTTCA 674
Query 713 AATTGTACCATCATCATCATGGGGTCGATATTAATGCAAATGGGAGGAGATTCCACATAA 772 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 673 AATTGTACCATCATCATCATGGGGTCGATATTAATGCAAATGGGAGGAGATTCCACATAA 614
Query 773 AAATTTGTATGAAATATGTGCattaaaattaattttaaaatacatactaaatttacaaaa 832 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 613 AAATTTGTATGAAATATGTGCATTAAAATTAATTTTAAAATACATACTAAATTTACAAAA 554
Query 833 ataatttgagaataattcaaaaattattttctaatattttgtaaaacaaatGCTAGtttg 892 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 553 ATAATTTGAGAATAATTCAAGAATTATTTTCTAATATTTTGTAAAACAAATGCTAGTTTG 494
Query 893 aaaatctaaaatatttttaccttattttttatatttttaaatatgttttaaaaataaatt 952 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 493 AAAATCTAAAATATTTTTACCTTATTTTTTATATTTTTAAATATGTTTTAAAAATAAATT 434
Query 953 ttatatgtagtattttagttttaattatttttcatatttatataattattttttaaaaca 1012 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 433 TTATATGTAGTATTTTAGTTTTAATTATTTTTCATATTTATATAATTATTTTTTAAAACA 374
Query 1013 atgttcaaaaaataaaacaagtcaaaataatttaaaaaaaattattttttaattattaaa 1072 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 373 ATGTTCAAAAAATAAAACAAGTCAAAATAATTAAAAAAAAATTATTTTTTAATTATTAAA 314
Query 1073 tatatatattttaaaattttattttaaaaaatgaaaaactgtttttgaaaaCACTCACCA 1132 ||||||| | | ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 313 TATATATGT---A---TTTTA----AAAAA-TCAAAAACCGTTTTTGAAAACACTCACCA 265
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Query 1133 GGAGTAGCATAGAAATTCAATTTACTATTACATTGGGTTTTGTAGACCCTTTGAGGGTTG 1192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 264 GGAGTAGCATAGAAATTCAATTTAGTATTACATTGGGTTTTGTAGACCCTTTGAGGGTTG 205
Query 1193 AACAGGTAATATCCCCTAAAAAGAGAGAAGACAAACCAATATAATATTACAGCTATATGG 1252 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 204 AACAGGTAATATCCCCTAAAAAGAGAGAAGACAAACCAATATAATATTACAGCTATATGG 145
Query 1253 AAGACTTGGAAATTTCCTAGAAAGTGGATTTGTAAatatatatatatata--CTAATACT 1310 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 144 AAGACTTGGAAATTTCCTAGAAAGTGGATCTGTAAATATATATATATATATACTAATACT 85
Query 1311 ATATTTTGGTTTCTTAAATAAGGAGCAACTAGGAACCACATGAA 1354 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 ATATTTTGGTTTCTTAAATAAGGAGCAACTAGGAACCACATGAA 41
图3-6克隆的启动子序列与已知启动子序列的比对图
测序结果表明,所克隆的启动子片段的长度为1354 bp,其序列与基因bank公布的已知序列同源性极高,达到97%,表明已克隆到葡萄CAN基因的启动子。
3、 植物表达载体pBI1391Z- CAN的构建 3.1 试验材料
3.1.1 菌株与载体
农杆菌菌株EHA105、大肠杆菌菌株DH5α为本实验室保存;表达载体为pBIA1391Z质粒pMD19-T- CAN 3.1.2 酶和试剂
限制性内切酶EcoR I、Pst I、1Kb Marker、DL12000Marker、Rif、Kar;T4-DNA Ligase、PCR试剂均购自宝生物工程(大连)有限公司;质粒DNA提取和琼脂糖凝胶回收试剂盒均购自OMEGA生物有限公司。
PCR引物由北京三博远志有限公司合成,宝生物工程(大连)有限公司完成
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测序;其它化学试剂均为国产分析纯。
LB培养基:蛋白胨10g/L,酵母粉5g/L,NaCl 10g/L。 3.1.3 仪器耗材
台式离心机、制冰机、微型旋涡混合仪、恒温摇床、超净工作台、电子天平、pH 计、微波炉、立式自动电热压力蒸汽灭菌器、磁力加热搅拌器、电热恒温鼓风干燥箱、电泳仪、水平凝胶电泳槽、紫外分析仪、恒温金属浴、10mL、50mL离心管、移液枪(1000μL、200μL、20μL、2.5μL)等。
3.2 试验方法
3.2.1植物表达载体pBI1391Z- CAN的构建 (1)大肠杆菌质粒DNA的提取
1)在1.5mL离心管中加入1mL菌液,4℃,12000rpm离心1min,弃上清液。 2)加100μL预冷的溶液I,剧烈振荡后于室温下放置5min。 3)加200μL新配制的溶液II,温和地颠倒数次,放冰上3min。 4)加150μL冰上预冷的溶液III,温和地颠倒数次,冰上放置5min。 5)4℃,12000rpm离心10min,上清液转到新管中。
6)加入等体积冰预冷的苯酚氯仿异戊醇(25:24:1),振匀后于4℃,12000rpm离心5min,上清液转到新管中。重复一次。
7)加入2 倍体积无水乙醇,混匀后于4℃,12000rpm 离心5min,弃上清液。 8)加入1mL70%乙醇洗涤沉淀,离心5min,弃上清。 9)吹干后每管加20μLTE溶解。
(2)用限制性内切酶PstI和EcoRI分别双酶切质粒pBIA1391Z和质粒质粒pMD19-T- CAN酶切体系如下:15μL质粒,2.5μL 10×T buffer,5μL 1%BSA,两种内切酶各1μL,25.5μL ddH2O,总反应体积为50μL。30℃酶切3h,用1%琼脂糖凝胶电泳40min,用DNA 凝胶回收试剂盒纯化回收pBIA1391Z 的大片段,记为片段1,回收pMD19-T- CAN70200 的小片段,记为片段2。 (3)片段1和片段2的连接
连接体系如下:1μL片段1,2μL片段2,1μL 10×T4 DNA ligase buffer,1μL T4 DNAligase,5μL ddH2O。总反应体系为10μL,16℃连接4h。
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(4)将连接产物转入制备好的大肠杆菌感受态细胞中,提取质粒酶切验证。 3.2.2. 植物表达载体pBI1391Z- CAN转入到农杆菌 (1). 农杆菌(EHA105)感受态细胞的制备
1)挑取农杆菌EHA105单菌落,接种于LB液体培养基中,28℃振荡培养两天。 2)取2mL培养好的菌液接种于50mL液体LB培养基中,继续培养至0D值约0.5。 3)将活化好的菌液放在冰上30min,然后4℃,5000rpm,离心10min,弃上清。 4)加入10mL0.15mol/L NaCl悬浮菌体,4℃,5000rpm,离心10min,弃上清。 5)加入1mL 20mmol/L冰冷的CaCl2悬浮,分装在EP管中200uL/管,加入等体积的甘油,置于液氮中速冻lmin,取出于-80℃保存 (2)冻融法转化农杆菌
1)将制备好的农杆菌EHA105感受态细胞放在冰上待其融化。
2)加入1ug表达载体pBI1391Z- CAN质粒DNA,冰浴30min,液氮中冷冻lmin,然后在37℃水浴锅中水浴5min。
3)加入1mL不含抗生素的LB液体培养基,28℃、120rpm,振荡培养3h。 4)3000rpm离心1min浓缩菌液,用100uL LB重悬菌体。
5)将菌体涂布于含有50mg/L Kar和50mg/LRif的固体LB培养基,28℃培养2天。
3.3 结果与分析
3.3.1 表达载体pBI1391Z- CAN的构建
Marker 1
图 3.1表达载体pBI1391Z- CAN70200的酶切鉴定图
左侧为1kb Marker,右侧1号泳道为表达载体pBI1391Z- CAN的双酶切电泳图
1500bp 1000bp 10000bp
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