分子生物学课程教学讲义 朱玉贤(8)

2019-09-01 09:15

动了转录起始。

若用基因工程的方法,将GAL4 AD和BD分别克隆到不同的载体上,导入同一细胞株中表达,效应基因无法被激活,但可把来自不同转录因子的AD或BD区域连成一个功能基因。 主要实验过程:

a. 选择缺失GAL4编码基因的酵母寄主菌株-SFY526或HF7c; b. 构建带有GAL1 UAS-启动子-lac Z(His3)的转化载体;

c. 把已知的靶蛋白质编码基因克隆到pGBT9的多克隆位点上,把所有cDNA都克隆到

pGAD424载体上,构成cDNA表达文库。

d. 从大肠杆菌中分别提取这两种重组质粒DNA,共转化感受态酿酒酵母菌株。

e. 将共转化的酵母菌株涂布于缺少Leu,Trp和His的培养基上,筛选表达相互作用的杂种

蛋白的阳性菌落。 E.基因的图位克隆法

Map-based cloning是分离未知性状目的基因的一种好方法。从理论上说,所有具有某种表现型的基因都可以通过该方法克隆得到。首先,将目的基因定位到某个染色体的特定位点,并在其两侧确定紧密连锁的RFLP或RAPD分子标记。二、利用与目的基因最紧密连锁的一对分子标记作探针,通过染色体步移技术将位于这两个标记之间的基因片段

href=\克隆\克隆并分离出来。三、根据基因功能互作原理鉴定目的基因。

通过对许多不同的生态型及大量限制性内切酶和杂交探针的分析,找出与目的基因距离最近的RFLP标记。在RFLP作图中,连锁距离是根据重组率来计算的,1cm(厘米)相当于

1%

class=\

href=\基因组\基因组中,1cm≈1000kb;拟南芥菜中,1cm≈290kb;小麦中, 1cm≈3500kb。

四、 DNA的Microarray

只要事先除去高度及中等重复序列,任何DNA都可以被用于Microarray。最简单的例子是用机械手把极微量(nanoliters)的DNA点到玻片或其它载体上,照射UV light使之永久固定,用不同细胞周期发育阶段的cDNA作探针系统性地研究细胞中任意时期特异表达的基因;若把某一生物体内全部全部已知基因分别点到DNA微列阵或者基因芯片上,再用不同发育阶段的cDNA与之杂交,就能了解某些基因对特定生长发育阶段的重要性;基因

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芯片还可用于进行基因诊断,可建立正常人特定组织、器官的基因,给出标准杂交信号图。用可疑病人的cDNA做探针与之杂交,检查哪些基因的表达受抑制或激活。

第六讲 原核基因表达调控

原核生物和单细胞真核生物直接暴露在变幻莫测的环境中,食物供应毫无保障,只有能根据环境条件的改变合成各种不同的蛋白质,使代谢过程适应环境的变化,才能维持自身的生存和繁衍。自然选择倾向于保留高效率的生命过程。在一个每30min增殖一倍的109细菌群体中,若有一个细菌变成了29.5min增殖一倍,大约经过80天的连续生长后,这个群体中的99.9%都将具有29.5min增殖一倍的生长速度。

一个大肠杆菌细胞中约有2500-3000个基因。估计正常情况下,可带有107个蛋白质,平均每个基因产生3000多个蛋白质分子。但大肠杆菌中一般带有15,000-30,000个核糖体,有50余种核糖体结合蛋白,数量也很惊人。此外,负责糖酵解系统的蛋白质数量也很大。而象半乳糖苷酶等诱导酶,其含量可少至每细胞仅1-5个分子。

一个体系在需要时被打开,不需要时被关闭。这种\开-关\(on-off)活性是通过调节转录来建立的,也就是说mRNA的合成是可以被调节的。当我们说一个系统处于\状态时,也有本底水平的基因表达,常常是每世代每个细胞只合成1或2个mRNA分子。所谓\关\实际的意思是基因表达量特别低,很难甚至无法检测。

科学家把这个从DNA到蛋白质的过程称为基因表达(gene expression),对这个过程的调节就称为基因表达调控(gene regulation或gene control)。要了解动、植物生长发育的规律、形态结构特征和生物学功能,就必须弄清楚基因表达调控的时间和空间概念,掌握了基因表达调控的秘密,我们手中就有了一把揭示生物学奥妙的金钥匙。 基因表达调控主要表现在以下几个方面: ① 转录水平上的调控(transcriptional regulation);

② mRNA加工成熟水平上的调控(differential processing of RNA transcript); ③ 翻译水平上的调控(differential translation of mRNA).

原核生物中,营养状况(nutritionalstatus)和环境因素(environmental factor)对基因表达起着举足轻重的影响。在真核生物尤其是高等真核生物中,激素水平(hormone level)和发育阶段(developmental stage)是基因表达调控的最主要手段,营养和环境因素的影响力大为下降。

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一、 乳糖操纵子的调控模式

大肠杆菌乳糖操纵子(lactose operon)包括3个结构基因:Z、Y和A,以及启动子、控制子和阻遏子等。转录时,RNA聚合酶首先与启动区(promoter,P)结合,通过操纵区(operator,O)向右转录。转录从O区的中间开始,按Z→Y→A方向进行,每次转录出来的一条mRNA上都带有这3个基因。转录的调控是启动区和操纵区进行的。

Z编码β-半乳糖苷酶;Y编码β-半乳糖苷透过酶;A编码β-半乳糖苷乙酰基转移酶。β-半乳糖苷酶是一种β-半乳糖苷键的专一性酶,除能将乳糖水解成葡萄糖和半乳糖外,还能水解其他β-半乳糖苷(如苯基半乳糖苷)。β-半乳糖苷透过酶的作用是使外界的β-半乳糖苷(如乳糖)能透过大肠杆菌细胞壁和原生质膜进入细胞内。β-半乳糖苷乙酰基转移酶的作用是把乙酰辅酶A上的乙酰基转到β-半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖。 1. 酶的诱导-lac体系受调控的证据

在不含乳糖及β-半乳糖苷的培养基中,lac+基因型每个大肠杆功细胞内大约只有1-2个酶分子。如果在培养基中加入乳糖,酶的浓度很快达到细胞总蛋白量的6%或7%,每个细胞中可有超过105个酶分子。

科学家把大肠杆菌细胞放在加有放射性35S标记的氨基酸但没有任何半乳糖诱导物的培养基中繁殖几代,然后再将这些带有放射活性的细菌转移到不含35S、无放射性的培养基中,随着培养基中诱导物的加入,β-半乳糖苷酶便开始合成。分离β-半乳糖苷酶,发现这种酶无35S标记。说明酶的合成不是由前体转化而来的,而是加入诱导物后新合成的。

已经分离在有诱导物或没有诱导物的情况下都能产生lacmRNA的突变体,这种失去调节能力的突变体称为永久型突变体,为分两类:I型和O型。 I型:野生型为I+,突变型为I- O型:野生型为O+,突变型为Oc。

I+→I-或O+→Oc后,Z、Y、A结构基因均表现为永久表达,所以I基因被称为调节基因(regulatory gene)。研究发现,I基因是一个产生阻遏物的调节基因,其产物使体系关闭。I-突变体由于不能产生阻遏物,使细胞成为lac永久表达型。I-/I+局部二倍体由于带有一个正常阻遏物,使细胞中的lac仍然被抑制。

遗传学图谱分析指出,Oc突变位于I与Z之间,所以,lac体系的4个基因的序列为IOZY。通过这些观察,Jacob和Monod推断Oc突变代表DNA链上的一个位点或一个非编码区域,而不是一个基因,因为可编码的基因具有互补性,而Oc没有这一特性。O决定相邻Z基因的产物是诱导型合成还是永久型合成,O区域称为操纵基因。

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2. 操纵子模型

Jacob和Monod认为诱导酶(他们当时称为适应酶)现象是个基因调控问题,可以用实验方法进行研究,因此选为突破口,终于通过大量实验及分析,建立了该操纵子的控制模型。 ① Z、Y、A基因的产物由同一条多顺反子的mRNA分子所编码。

② 这个mRNA分子的启动子紧接着O区,而位于I与O之间的启动子区(P),不能单独

起动合成β-半乳糖苷酶和透过酶的生理过程。

③ 操纵基因是DNA上的一小段序列(仅为26bp),是阻遏物的结合位点。 ④当阻遏物与操纵基因结合时,lacmRNA的转录起始受到抑制。

⑤诱导物通过与阻遏物结合,改变它的三维构象,使之不能与操纵基因结合,从而激发

lacmRNA的合成。当有诱导物存在时,操纵基因区没有被阻遏物占据,所以启动子能够顺利起始mRNA的合成。 3. Lac操纵子的本底水平表达

因为诱导物需要穿过细胞膜才能与阻遏物结合,而运转诱导物需要透过酶。在非诱导状态下有少量(1-5个mRNA分子)lac mRNA合成--本底水平永久型合成。 4. 葡萄糖对lac操纵子的影响--代谢物阻遏效应

研究表明,葡萄糖对lac操纵子表达的抑制作用是间接的,因为存在一种大肠杆菌突变株,它正常的糖酵解过程受阻,葡萄糖-6-磷酸不能转化为下一步代谢中间物,该菌株能在有葡萄糖存在的情况下被诱导合成lac mRNA。 5. cAMP与代谢物激活蛋白

当葡萄糖和乳糖同时存在于培养基中时,lac启动子表达受阻,没有β-半乳糖苷酶活性;当葡萄糖消耗完以后(图中箭头处),细胞内cAMP浓度增加,β-半乳糖苷酶活性被诱导,一度停止生长的细胞又恢复分裂。如果将细菌放在缺乏碳源的培养基中,细胞内cAMP浓度就很高;若在含葡萄糖的培养基中培养,细菌中的cAMP浓度就会很低;如果将细菌置于甘油或乳糖等不进行糖酵解的碳源培养基中,细菌中cAMP的浓度也会很高。

研究证实,葡萄糖所引起的代谢物抑制(Catabolite repression)现象的实质是该代谢物

降低了细胞中cAMP的含量.事实上,cAMP-CAP复合物是lac体系的positive regulator,它们不能代替lacI和lacO的功能(negative regulator)。

cAMP-CAP不但能与DNA相结合,造成双螺旋弯曲,易于形成三元转录起始复合物,它还能直接影响RNA聚合酶的活性。Dominant negative(Trans-dominant)lacI-d,只要有这个\环\的亚基存在,lacI+基因产物(阻遏物)无法与O区相结合lac operon得到表达。

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6. lac操纵子DNA的调控区域--P.O.区

lac P(启动子区)从I基因结束到mRNA转录起始位点止,共长82bp(-82~+1)O区就是阻遏物结合区,位于P区后半部分和转录起始区(-7~+28),该区序列有对称性,其对称中心点在+11位。P区的CAMP-CAP结合区(-67~-52)也有对称性,其对称位点在-60~-59之间。

在一个完全被诱导的细胞中,β-半乳糖苷酶、透过酶及乙酰基转移酶的拷贝数比例为1:0.5:0.2,这个比例在一定程度上反映了以β-半乳糖苷作为唯一碳源时细胞的需要。不同的酶在数量上的差异是由于在翻译水平上受到调节所致。

①lac mRNA可能与翻译过程中的核糖体相脱离,从而终止蛋白质链的翻译。这种现象发生

的频率取决于每一个后续的AUG密码子再度起始翻译的概率。 ②在lac mRNA分子内部,A基因比Z基因?

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