BOO项目在处理环节的补贴价格一般是100~120元/吨（部分早期建设项目可能高达200多元/吨），收运环节补贴价格一般是很多城市的餐厨垃圾收费制度还停留在纸面。
但另一方面，国内餐厨垃圾处理项目的建设和运行基本靠政府补贴。BOT、BOO项目在处理环节的补贴价格一般是100~120元80~115元/吨。以2014年投运的某餐厨垃圾处理项目（设计处理规模200吨/日）为例，特许经营协议中规定餐厨垃圾处理补贴为120元/吨，按每日最低120吨的基准量补贴，超出部分据实结算，由此估算年补贴费用约526~876万元，这还不包括收运环节的补贴。 按照污染者付费的原则，餐厨垃圾收费应当是合理的环保行为。与生活垃圾不同， 餐厨垃圾的产生主体基数相对较小、责任相对明晰、管理相对容易，因此，餐厨垃圾收费制度应该得到比生活垃圾收费制度更有效的执行，这既是提高餐厨垃圾产生单位环保意识的需要，也是理顺餐厨垃圾管理体系、保障餐厨垃圾处理项目可持续发展的需要。 5、存在问题
（1）目前采用的厌氧发酵产沼气技术存在商业经济性差的问题，该问题已严重制约餐厨垃圾处理项目正常发展。主要原因是资源化收入几乎难以实现，项目完全依靠政府补贴。
（2）农业部十三五规划主要任务指标中有一项是减少化肥的使用量，因此餐厨垃圾制肥得到农业部支持，但有专家认为餐厨垃圾肥料中含有大量盐、抗生素，会导致农产品抗生素含量超标，土壤盐含量专家导致土壤板结，成为未来发展的不定因素。