WB试验常见问题解答(6)

2019-04-16 17:12

答:【1】所谓的1×就是说是应用时应该应用的浓度。所以应用的时候,都应该配成1×的。 【2】配成5×或10×就是为了方便,免得每次都要配的麻烦。

【3】下面是1×电泳液的配制方法,你的是5*的。正好是5倍的关系,你的配方是正确的。 电泳液缓冲液(25mmol/L Tris,0.25mol/L甘氨酸,0.1% SDS) Tris(MW121.14) 3.03g 甘氨酸(MW75.07) 18.77g SDS 1g

蒸馏水至 1000ml

溶解后室温保存,次溶液可重复使用3~5次。

【40】版上精华区、归档区的帖子我也都看过了。对于western显色荧光淬灭的解释都是蛋白浓度、一抗或者二抗浓度过高的缘故。我也曾试过我二抗浓度降到推荐的最低,可是还是不行。下面我把我的具体情况给大家说一下,希望同仁们多多帮助,不吝赐教!

我是提取细胞裂解液上样,最初的时候因为要检测的蛋白表达量低所以上样60ug,用的的PIERCE的荧光显色,开始1:2000稀释二抗,显色结果很好,荧光也非常亮,非常持久,stripping 3次以后还是能得到持久的荧光显色。但是不知道从什么时候开始,莫明的就出现了荧光很快淬灭的现象。就是加上显色底物以后,荧光就迟也在2分钟内消失。我在版上和PIERCE的说明书上仔细的学习过了,都是说二抗的浓度高,后来我就把二抗降到说明书推荐的1:5000,在暗室中观察加上显色底物荧光非常暗,但还是会很快消失。后来我又把上样时的蛋白总量减半但还是不能解决问题。 我的问题有这么几个:

1. 以前1:2000的二抗浓度,荧光有量又持久,而现在二抗降的再低都不行,这是为什么呢? 2. 荧光消失以后再补加显色底物,荧光亮一下,消失的更快,而且把底片在膜上一压,荧光就马上淬灭,这又是为什么呢?

3. 我还发现如果一张膜杂一个抗体时淬灭,stripping后杂别的抗体都会淬灭

现在都快疯了,和以前做实验的步骤方法都没有差别,但现在一曝光就淬灭,恳求大家帮帮忙啊!! 答:很多情况都会导致荧光淬灭,可能每个人的情况并不相同。

【1】用保鲜膜包好的带荧光的膜,千万不要放到金属表面,碰到金属表面,荧光会迅速的淬灭。因为有些桌子是金属的,所以放到上面会导致荧光迅速淬灭。这是亲身经历的。有些战友提到用镊子碰到膜会导致荧光淬灭,可能是因为镊子是金属的缘故。

【2】不注意的时候,把ECL的A和B混合了,以后再用,也会导致荧光淬灭。各溶液使用后,请盖紧瓶盖,以防失效。特别是B液,含有氧化剂,比较容易被还原而失效。

【3】荧光可能对一些物质敏感,导致荧光淬灭。所以,尽量使和荧光接触的物品都是干净的。我以前都是用保鲜包裹膜,然后曝光,但是保鲜膜太薄,容易卷起来,我就用较厚的塑料袋,但是发现荧光一接触塑料袋就迅速淬灭,我估计可能是因为后塑料袋上不干净,有些导致淬灭的物

质。后来继续应用保鲜膜,就没有出现类似情况了。

【4】荧光淬灭和蛋白抗体等也有原因。我以前就碰到过,我的是5个条带,发生淬灭的时候,有快有慢,不是5个条带一起淬灭。尽管后来都淬灭了。所以,估计和蛋白抗体等也有关系,但可能并不是主要的原因。

【41】我因为做western blot 总是没结果,就严格按照cell signa的说明书进行操作,将多抗用5%的BSA稀释成10ml后4度冰箱孵育过夜,但是依然无结果。我将稀释后的 抗体准备重复使用,但是原来未稀释前在-20度时抗体不结冰,现在稀释后则结冰,这样用时反复冻融会不会影响结果。还是抗体在稀释后应放4度保存? 另外我想问一下这样的抗体一般可用几次。

如果是在室温下孵育的抗体可不可以重复用,上次我用此抗体,连原来做出来的都未出结果。 答:【1】的确有的一抗可以反复应用很多次的,有的用几次就不好用了。主要跟抗体的特性、质量等有关,跟储存等情况也有关。所以,一种一抗稀释液用多长时间,一般只有用了才知道。 【2】当然用一次也可以的,我就是用一次。每次的用量是400微升~1毫升。效果也是很好的。我就是用塑料袋做成小袋子,然后把膜放到里面,然后把一抗稀释液放到里面。然后用封膜机把口封上。这样一抗稀释液就可以把膜全包上了。

【3】二抗也可以这样用,也是很省的,不用重复应用的。

【42】求助各位战友,转膜完用丽舂红染色有条带,但是一抗二抗孵育后ECL显影照相没条带,急

答:【1】目的条带没出来,首先确定样品里有没有这种蛋白,含量如何? 【2】可以加大上样量,或/并提高蛋白浓度。

【3】蛋白不要放太长的时间,防止蛋白降解。(提取蛋白时,裂解蛋白时不要忘了放蛋白酶抑制剂)

【4】加大一抗的浓度,就是降低稀释比例。 【5】增加一抗的孵育时间。

【6】(曝光后白板一张,不存在背景过强的问题),可以增加二抗的浓度,增加二抗的孵育时间。

【7】可以增加膜放在ECL中的时间。增加曝光时间。

【8】另外注意二抗的HRP 活性太强,将底物消耗光的可能。前面的方法都用了,还不行的话,就要注意这一点了。可以降低二抗浓度,或者更换二抗

【43】最近打算做ECL发光(以前用DAB显色),但是没见过师兄师姐用过,关于显影定影问题,有很多都不懂,望各位老师帮帮忙.

1.据说显影定影液要避光低温保存,是不是避光后(铝箔纸包住瓶子)放4度冰箱,还是室温就可以?(现在天气开始转热了,不知道室温是否可以)

2.产品说明书上说显影液约1个月可能就失效,定影液大概是2个月.请问我一次大概配多少mL溶液比较好?(我买的是粉剂,直接加水就可以用).是不是只要显影液定影液能浸泡过胶片就可以? 3.盛装显影液和定影液的容器有没有特殊要求?我打算用普通的玻璃瓶装,外面包一层铝箔纸,可以吗?

4.请问整个实验过程大概要用几升的显影定影液?我买了显影定影粉各一包(各可以配成一升溶液),不知道够不够用?如果是两个月内天天做,大概要用多少? 过几天就要开始做显影定影了,麻烦各位老师帮帮忙,非常感谢

答:1.据说显影定影液要避光低温保存,是不是避光后(铝箔纸包住瓶子)放4度冰箱,还是室温就可以?(现在天气开始转热了,不知道室温是否可以)

【1】放室温可以的,当然,放在4度冰箱就更好了。用铝箔纸包住当然可以,其实用那种有颜色(棕色)的玻璃瓶装也可以的。

2.产品说明书上说显影液约1个月可能就失效,定影液大概是2个月.请问我一次大概配多少mL溶液比较好?(我买的是粉剂,直接加水就可以用).是不是只要显影液定影液能浸泡过胶片就可以? 【2】你说的很对,就是能把胶片淹没就好了,所以要看你胶片的大小和盛放胶片的容器的大小。我显影和定影液各自配了500毫升。显影液和定影液用久了,曝光的效果就不好了,逐渐混浊,有杂质。所以,最好用一个月就换一下。

3.盛装显影液和定影液的容器有没有特殊要求?我打算用普通的玻璃瓶装,外面包一层铝箔纸,可以吗?

【3】没有特殊要求,你说的完全可以。当然,前面已经说了。可以用带染色的玻璃瓶(起避光的作用)装。

4.请问整个实验过程大概要用几升的显影定影液?我买了显影定影粉各一包(各可以配成一升溶液),不知道够不够用?如果是两个月内天天做,大概要用多少?

【4】哈,这要看你胶片的大小和盛放胶片的盒子的大小。如果放500毫升液体就能把胶片淹没的话,如果两个月做完的话,正好够用。

【44】各位大虾,本人现在做一低分子6.5KDa大小的蛋白,其有复合物25KDa(二硫键结合)。复合物本人使用非还原loding buffer已经做出了,证明抗体应该没有问题。

而6.5KDa的蛋白,我使用tricine系统,还原的loding buffer,且加热了。用浓缩胶4%,分离胶10%+16%的方法,0.2um的PVDF膜,转膜为湿转,30V,60min,70min,80min都试过,预染Marker最小为10KDa,膜上出现了,胶上还剩下一点。但是敷育抗体后没有做出。仪器为Bio Rad 的1.5 cm的mini胶。

请各位指导一下到底是什么,不胜感激!

答:分子量有些小,不太容易出结果。最好每一步都做的更加仔细、更加到位。

【1】分子量小,电泳的时候不要时间太长。下面的兰色跑到胶的1/3左右一般就可以了。跑的久了,小分子量的蛋白很容易跑散了。

【2】如果没有把握,可以一步一步来。先用考马斯兰染一下胶,证明胶上有。然后可以用丽春红染色(这步熟了以后最好不要做,因为这会对以后的结果有影响。)。 【3】转膜还是以电流算好一些吧。一般都是衡流吧。最好电流小一些。

【4】看你写的,可以看到10KD的Marker,但是膜上和胶上都有,说明还是不放心。正常应该全部转到膜上才好,估计你也是担心小分子的转过头了。所以,你现在首先要确定目的蛋白转到膜上了。其实,不用丽春红染色,用眼直接看,比用丽春红染色的还要清楚。方法是,但转膜完成后,把膜拿出来,在膜逐渐干燥的过程中,膜会逐渐变成白染色。当膜刚变成白染色的时候,上面就会出现一些湿的、未干的条带,这些条带就是蛋白条带。当然,再过一会,这些条带也会变白的,所以,要一直看着。

【5】综合一下,最好一步一步来,每一步的条件摸准。先保证胶上有,然后湿保证膜上有,然后再曝光。这样就可以做到结果没出来的时候,心中有数,到底是哪里出了问题。

【45】92kd的蛋白应选什么浓度的分离胶和浓缩胶啊 答:【1】分离胶的浓度和最佳分离范围:

(1)SDS-PAGE分离胶浓度 --- 最佳分离范围 (KD)

6%胶 ---- --------50-150 8%胶 ---- --------30-90 10%胶 ------------20-80 12%胶 ------------10-40

(2)分离胶浓度(%) --- 线性分离范围(KD) 15 ----- ------ --12-43 10 ---- ---------16-68 7.5 ------------36-94 5.0 ---- ------- -57-212

【2】浓缩胶一般都是选4%或者5% 下面是5%胶的配制方法:

成分 ----- 配制不同体积SDS-PAGE浓缩胶所需各成分的体积(毫升) 5%胶 - - 2 - - 3 - - 4 - - 6 - - 8 - - 10

蒸馏水 - - 1.4 - - 2.1 - - 2.7 - - 4.1 - - 5.5 - - 6.8

30?r-Bis(29:1) - - 0.33 - - 0.5 - - 0.67 - - 1.0 - - 1.3 - - 1.7 1M Tris, pH8.8 - - 0.25 - - 0.38 - - 0.5 - - 0.75 - - 1.0 - - 1.25 10%SDS -- 0.02 -- 0.03 - - 0.04 -- 0.06 - - 0.08 - - 0.1 10%过硫酸铵 - - 0.02 -- 0.03 - - 0.04 - - 0.06 --- 0.08 - - 0.1 TEMED - - 0.002 -- 0.003 -- 0.004 - - 0.006- - 0.008 - - 0.01

【46】beta-actin 为43kd ,用的是湿转,200MA 1h, NC膜,可以成功将蛋白转到膜上,今天用的是pvdf膜,0.22um孔径,同样是湿转 200MA 1h,结果转膜后丽春红染膜未见条带,请高手指点!不胜感激!

答:1.转PVDF膜时,首先膜要先用甲醇浸泡,浸泡时间一般是1-20分钟,我用的是5分钟,甲醇浸泡后用转移液浸泡,浸泡时间我用的是比较长,我一般是用两小时,就是早早的就把转移液放到盘子里,海绵,滤纸也都放到里面.把PVDF膜泡透是比较重要的一步.

2.转移液要经常换新的,一般认为转移液可以用3-5次,但是我都是用两次就换新的,感觉次数多了.就不好用了,容易导致转膜的时候转不上,或者使膜上的蛋白条带发生弯曲,偏移,分散.

3.转膜的时候容易产热,所以转移槽里面最好加冰槽.我是里面加兵槽,外面用冰围起来(把转移的装置放在塑料脸盆中).这样的转移效果比较好.我用的是MILIPORE 的PVDF膜 ,我用的转移时间是300毫安半小时.当然膜不同,转移装置不同,所用的转移时间也可能不同.

4.还有很重要的一点就是,当膜上染色没染出来时,暴光的时候也可能出现条带,只是条带可能比较弱,暴光时间要长一点.


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