化进程提速开展。
7月4日，中共云南省省委书记白恩培、省委副书记杨崇汇、省委秘书长杨崇勇一行视察云南白药集团，鼓励云南白药这个著名企业继续努力，当好云南药业的排头兵。
7月16日，国家副主席胡锦涛到云南白药集团视察工作，参观了胶囊全自动生产线和气雾剂全自动生产线，并到公司会议室听取了关于云南白药近年来发展情况的汇报，当听到2002年是白药诞世一百周年时，他拿起面前的一盒白药胶囊高兴地说：“云南白药是金字招牌。”，并希望白药“百尺竿头再进一步，新一代的白药人应该再创辉煌，把白药集团真正创办成国内一流的医药企业，而且能够把云南白药真正打入到国际市场，能够有更强更大的国际竞争力。”。
8月，云南白药气雾剂（双效）研制获云南省政府科学技术进步三等奖（本项目获奖人员为：王明辉、李健吾、许钟英、何国民、杨昌红、李劲、韦建荣）。
年9月，公司取得国家药品监督管理局颁发的云南白药痔疮膏四类新药证书和宫血宁胶囊增加适应症的五类新药证书。
10月21日，云南白药大药房有限公司成立，注册资本4000万元，是云南白药集团旗下第二大具有法人资格的医药流通型企业，实施全过程的信息化管理，致力于构建完善的市场终端网络服务体系。
10月，天紫红药厂改制为云南白药集团天紫红药业有限公司。
11月22日，中共云南省委书记白恩培到云南白药集团武定基地视察工作，要求做好“科研、经营、行政领导”的三个结合，用科研做龙头，加强运作，使基地的发展不仅对云南白药集团，也将对整个云南药业的发展起到一定的拉动作用。
11月，云南省医药保健品进出口公司向国家工商总局商标局办理了“茶花牌”商标的注销手续，“茶花牌”云南白药将永久退出海外市场，云南白药实现了品牌的全球统一。
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12月10日，云南白药集团总部办公地点由昆明市西坝路51号搬迁至昆明市二环西路222号（昆明市国家高新技术产业开发区）。
12月19日，云南白药百年庆典暨2002年云药国际科技论坛在云南白药集团总部大楼举行。云南白药自1902年创制问世至今，走过了风雨辉煌的整整一个世纪，为无数世人造福，并以其神奇的疗效享誉五洲四海。
2002年，公司经营班子坚持“做强企业、做透产业、做百年企业”的发展思路，围绕公司董事会所确定的“一个核心、四个经济增长点”的发展战略，在做强母体、提升优势、强化核心竞争力的基础上，全力打造云南白药集团天然药物产业链工程。一年来，公司经营业绩保持高速增长，主营业务收入、实现利税、实现净利润、资产收益等各项经济指标均创历史最好水平；与此同时，通过省医药和天紫红的改组改造、武定基地项目和连锁大药房的建设，以及相关合资合作项目的推进，云南白药全新产业布局初具雏形，集团新的经济增长点初现端倪。这些成绩的取得，不仅为云南白药已经走过的100年划上一个圆满的句号，更重要的是，为云南白药又一个百年的持续、健康发展奠定了极为坚实的基础。
2003年
云南白药集团制造中心正式全面推行新的管理模式——内部订单制。 3月，云南白药集团“云丰”商标和“公司徽记”在老挝注册。
3月29日，云南省副省长牛绍尧视察云南白药集团武定基地，指出有白药这种龙头企业的带动，云南建设小康社会的步子将一定会很快。
4月，越南共产党中央委员会总书记农德孟一行应胡锦涛主席的邀请来华进行工作访问期间，在中共云南省委书记白恩培同志的陪同下到云南白药集团参观访问。
5月31日，中共中央政治局常委、中央纪检委书记吴官正在中共云南省委书记白恩培、省长徐荣凯等陪同下视察云南白药集团。
5月 ，“云丰”商标在美国成功注册。
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年8月7日—8日，中共云南省委副书记王学仁率民政、农业、水利等有关部门负责人到云南白药集团武定基地视察。
8月，云南白药集团与江苏无锡新技术产业开发区签订合作协议，投资2000万元建立云南白药集团无锡药业有限公司，使其成为云南白药透皮技术贴剂系列产品基地。
8月18日，国务院副总理曾培炎在中共云南省委书记白恩培、省长徐荣凯陪同下视察云南白药集团。
8月24日，邵氏兄弟（香港）有限公司主席兼执行董事、96岁高龄的邵逸夫先生在在国家教育部领导、云南省副省长李汉柏的陪同下，参观云南白药集团。
9月，云南白药集团公司的“云南白药”（5类）、“云丰”（5类）、“七花”（5类）商标被认定为2003年首批云南省著名商标。
9月，云南白药牙膏研制成功，并正式引入市场，标志着云南白药开始进入个人护理产品领域。
10月28日，日本外务省新闻采访团参观访问云南白药集团。
10月，云南白药、云南白药胶囊、云南白药气雾剂、云南白药膏、云南白药创可贴（使用“云南白药”商标）及宫血宁胶囊（使用“云丰”商标）等六个产品进入2003年云南省名牌产品名单。
10月29日，国家食品药品监督管理局副局长任德权在云南调研期间，专程到云南白药集团检查指导工作。
11月10日，世界知识产权组织（WIPO）传统知识官员Shakeel Thomas BHATTL先生、国家知识产权局国际合作司乔德喜司长、云南省知识产权局许惠然局长一行到云南白药集团考察知识产权保护状况。
年11月，公司“宝相花＋云南白药”商标在香港成功注册。
12月，《中国医药报》报道，在2003年1—9月全国3000多家医药工业企业利
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润总额排序中，云南白药集团排名第30名。
2004年
1月，云南白药集团技术质量部被人事部、国家知识产权局授予“全国专利系统先进集体”。
1月，云南白药集团产品热毒清片被列为国家二级中药保护品种。
2月，云南白药集团王明辉总裁被中国质量协会、中华全国总工会、共青团中央、全国用户满意工程联合推进办公室等四家单位联合授予“全国用户满意杰出管理者”称号。
3月，云南白药集团产品利儿康口服液被列为国家二级中药保护品种。 3月，云南白药集团被国家标准化管理委员会授予“优秀商品条码系统成员”荣誉称号。
4月，云南白药集团李健吾同志荣获第二届“新世纪巾帼发明家提名奖”。 4月，云南白药集团被云南省政府授予“云南省职工经济技术创新先进单位”光荣称号。
5月，云南白药陈列馆被共青团云南省委、少先队云南省工作委员会命名为“云南省青少年爱国主义教育基地” 。
5月，云南白药集团举办了“用现代科技再造云南白药新辉煌”全国重点媒介交流会，邀请了40余位来自《经济日报》、《中国经营报》、《北京青年报》、《国际金融报》等全国各大宣传媒体的的记者，通过成果发布、现场互动采访的方式使媒体直接性地了解云南白药近年来在深入开发研究领域所取得的成果。
5月云南白药气雾剂被国家体育总局社会体育指导中心指定为2004年首届全国大力士精英赛运动员指定药品。
5月，云南白药集团受到国家统计局表彰，获“全国工业企业联网直报全国先进单位”称号。
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6月，在2004年第六届“中证·亚商中国最具发展潜力上市公司50强”评选活动中，云南白药名列第21位，是云南省唯一入选的单位。
7月，云南白药集团通过了合剂、口服液两条生产线的国家GMP认证，至此，公司共有胶囊剂、颗粒剂、散剂、片剂、酊剂、气雾剂、口服液、合剂等八个剂型生产线通过国家GMP认证。
7月4日，中央政治局常委、全国人大委员长吴邦国同志在滇考察期间，到云南白药集团技术能手、全国劳动模范徐志刚家中亲切慰问。
7月20日，诺贝尔获得者勃劳克博士（1970年获诺贝尔和平奖）和米歇尔博士（1988年获诺贝尔化学奖）在科技部有关领导的陪同下，到云南白药集团进行实地调研和学术交流。两位学者对云南白药所蕴含的中医药文化精粹表现出浓厚的兴趣，他们高度评价说“云南白药是中国中药的杰出代表，在充分利用科技手段从天然植物中提取有效成分生产健康产品上，云南白药走在了前头，而且大有前景。”。
10月，云南白药集团向云南希望工程捐助40万元并启动“云南白药助百名大学生”爱心资助活动，将百年品牌的社会责任和公德心付诸于实际行动。
10月，云南白药集团荣获“2004年度全国企业文化优秀奖”，王明辉总裁荣获“2004年度企业文化优秀奖成果主要创造者”，党委书记戚太云和副总裁杨昌红荣获“2004年度企业文化优秀奖成果参与创造奖”。
10月，云南白药集团文山三七种植基地高水准通过国家GAP认证。云南白药集团文山三七种植基地不仅严格按照国家GAP的要求进行建设管理，还创新性的应用了基地+农场的运作方式，在全国首家将GMP的要求应用在GAP建设上。GAP认证的顺利通过，使云南白药集团向全面构建从GAP、GMP到GSP的天然产业链。
11月，在全国工商联主办“中国企业发展安全高峰论坛”组委会、财经时报等机构共同推出的“中国最具生命力企业”评选活动中，云南白药集团入选百强，排名第39位，获得2004年中国最具生命力百强企业称号。
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