吕梁学院本科毕业论文（设计）
（2） 选择Formula（图2-1中所圈部分），输入反应物的分子式C9H12O1Cl2N2Pt1, 得到了三种类似的分子，通过挑选发现编号QEWZIC(如图2-2)；为所需分子，用Mercury软件将结构导出，后导入到GaussView中；
图2-2反应物的结构
（3） 打开GaussView界面，如图2-3，点击File，打开从CCDC晶体数据库中得到的反应物结构文件QEWZIC(后面QEWZIC均标记为R),反应物R结构如下图2-4所示；
图2-3 GaussView界面
- 7 -
吕梁学院本科毕业论文（设计）
图2-4 反应物R结构图
（4） 经查询，由于CCDC中没有产物等的结构，因此需要在反应物R结构基础上来搭建已知产物的结构。选择Element Fragment（图2-3中所圈部分），会弹出如图2-5的元素周期表，在其中选择所需的原子，下边就会显示对应原子及其常用结构。对于有的简单分子，可以不选择原子，直接选择选择图2-5最下面一行中最后一项对应结构即可，如水分子，点氧原子，然后可以直接选择图2-5最下一行中最后一项即可生成；
图2-5 元素周期表
- 8 -
吕梁学院本科毕业论文（设计）
（5）选择Modify Bond（图2-6），选住要用键连接的两个原子，在弹出的窗口中（图2-7）选择所需键的类型并合理调整键长；
图2-6 GaussView界面Modify Bond
图2-7 键型选择及键长调整
（6）如此操作，按已知结构将多余的原子去掉，将需要的原子连接起来，并调整键角，分子结构就搭建好了。
（7）各分子结构搭建模型如图（2-8~ 2-10)：
图2-8 第一步水解产物P1-1 图2-9 第一步水解产物P1-2
- 9 -
吕梁学院本科毕业论文（设计）
图2-10 第二步水解产物P2
2.2 结构优化
结构优化，其目的为预测分子体系的稳定构型，以能量计算为基础寻找势能面上的能量极小值点，极小值点对应于体系的稳定结构。就单一分子，极小值点对应不同的构象或异构体；在反应体系中，极小值点对应反应物、产物或中间体。
2.2.1 反应物、产物结构优化
（1）在GaussView界面打开需要优化的分子，选择Calculate下拉菜单中的Gaussian Calculation Setup；
（2）在弹出的窗口中Job Type中选择Optimization（图2-11），然后选择Method，可根据需要更改计算方法及基组（Basis Set）。本文是在基态（Ground State）下，分别利用B3LYP法和PBE1PBE法对分子进行优化，基组则选择了铂用改进的SDD基组，其它原子用 6-311++G(3df，3pd) 基组（图2-12）。溶剂化选择Solvation，然后点击Default模型，选择Water(图2-13)；
- 10 -
吕梁学院本科毕业论文（设计）
图2-11 选择Job Type
图2-12 方法和基组选择
图2-13 溶剂化模型选择
（3）输入Title作为输入文件的名称，点击左下角Submit提交，保存后开始计算。依此步骤，对各个分子进行了优化。
2.2.2 中间体结构猜想及优化
由于两步水解反应相似，故重点讨论第一步水解各稳定点的几何构型。对第一步 水解反应，顺铂和反铂的Cl和N上的H分别与水的H和O以氢键结合成反应中间体。
- 11 -