中国科学技术大学博士论文
布伦克虫疠霉 Pandora delphacis (Hori)
*ARSEF459
飞虱虫疠霉
Pandora dipterigena (Thaxter)
*ARSEF397
双翅虫疠霉
Pandora kondoiensis (Milner)
*ARSEF825
近藤虫疠霉
Pandora neoaphidis (Remaud. & Henn.)
ARSEF5403
新蚜虫疠霉
Schizangiella serpentis Humber (sp.
*ARSEF203
nov., unpubl.)蛇裂梗霉
Strongwellsea castrans Batko & Weiser
绝育斯魏霉
Zoophthora anglica (Petch)
*ARSEF396
英吉利虫瘟霉
Zoophthora occidentalis (Thaxter)
*ARSEF3073
西虫瘟霉
Zoophthora radicans (Brefeld) (2)
KVL610
根虫瘟霉
Zoophthora radicans (Brefeld) (1)
F853
根虫瘟霉
(Lepidoptera: Plutellidae) Nephotettix cincticeps
AF368521
(Homoptera: Cicadellidae) (Diptera: Nematocera)
AF368522
Acythosiphon kondoi
AF351133 (Homoptera: Aphididae)
Sitobion avenae
AF052405
(Hemiptera) Crotalus horridus
AF368523 (Squamata: Viperidae)
Delia radicum
AF052404
(Diptera) Agriotes sputator
AF368524 (Coleoptera: Elateridae) Acythosiphon pisum (Homoptera: Aphididae) Epinotia aporema
AF052404
(Lepidopera)
?
D61381 AF368525 注:带有星号的菌株,为本次所研究;带有下划线的序列登录号为我们在GenBank中所注册
二、方法
(一)萨氏葡萄糖蛋黄牛奶培养基的制作
将3个新鲜的鸡蛋放入200ml 70%酒精(内加2ml丙酮)液中浸泡2h,灭菌。称取葡萄糖11.9g,蛋白胨4.5g,琼脂8.9g,加入水480ml,加热至沸腾,再用二层纱布过滤,倒入三角瓶中,加塞,在1.5Kg/cm2压力下灭菌15min,灭菌后放在60℃水浴锅中,制得萨氏葡萄糖琼脂培养基(SDA),同时取新鲜牛奶51ml在1.0Kg/cm2压力下灭菌20min。在超净工作台中将灭菌的鸡蛋上的酒精,在酒精灯上烧净,无菌地将蛋打开,将其蛋清倒掉,蛋黄倒入灭菌的烧杯中,再和已降至
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60℃的SDA培养基、牛奶混合,用灭菌玻璃棒充分搅匀,再倒皿,凝固后加入同皿大小的灭菌玻璃纸。放置4℃冰箱备用。
(二)菌体培养
将供试菌株的菌丝,接至萨氏葡萄糖蛋黄牛奶培养基之上,置于光照培养箱中培养14天(18℃),从玻璃纸上剥离菌体,冷冻真空干燥,备用。
(三)溶液配制
1、DNA提取液
100mM Tris-HCl(PH9.0) 40mM EDTA(PH8.0) 2、10% SDS
10g SDS定容至100ml(注意:在气温较低的环境中,会有部分SDS析出, 使用前将溶液在50℃水浴锅中将其完全溶解。) 3、3M NaAc(PH5.2)
4、10mg/ml Rnase(Dnase-free):用前100℃10min灭活Dnase 5、氯化苄(分子式PhCH2Cl):北京化学试剂厂分析纯原液。 6、1×CTAB DNA提取液(参考Doyle,1991;Sambrook,1989)
1%(W/V)CTAB 10mM Tris-HCl(PH8.0) 20mM Na2EDTA 1.4M NaCl 7、TE缓冲液
10mM Tris
1mM EDTA(PH8.0) 8、5×TBE电泳缓冲液
0.45M Tris 0.45M硼酸
20ml 0.5M EDTA(PH8.0)加水定容至1000ml 9、0.5M EDTA(PH8.0)
18.612g EDTA-Na2加水70ml,用10N的NaOH调PH值至8.0后,定容至
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100ml。
10、上样缓冲液(Loading buffer)(6×)
0.25%溴酚兰
40%(W/V)蔗糖水溶液 11、溴化乙锭贮液(EB)(10mg/ml)
1g溴化乙锭
100ml水 室温闭光保存 12、氯仿:异戊醇(24:1) 13、80%乙醇
14、LB培养基(Luria-Bertani培养基)
配制每升培养基,应在950ml去离子水加入: 细菌培养用胰化蛋白胨(bacto-trytone) 10g 细菌培养用酵母提取物(bacto-yeast extract) 5g NaCl 10g
摇动容器直至溶质完全溶解,用5mol/L NaOH(约0.2ml)调节PH7.0,加入去离子水至总体积为1L,在15 lbf/in2(1.034×105Pa)高压下蒸气灭菌20min。 15、SOB培养基
配制每升培养基,应在950ml去离子水中加入: 细菌每升用胰化蛋白胨(bacto-trytone) 20g 细菌培养用酵母提取物(bacto-yeast extract) 5g NaCl 0.5g
摇动容器使溶质完全溶解,然后加入250mmol/L KCl溶液10ml(在100 ml去离子水中溶解1.86g KCl配制成250mmol/L KCl溶液),用5mol/L NaOH(约0.2ml)调节PH7.0,加入去离子水至总体积为1L,在15 lbf/in2(1.034×105Pa)高压下蒸气灭菌20min。
该溶液在使用前加入5ml经灭菌的2mol/L MgCl2溶液[在90ml去离子水中溶解19g MgCl2,然后加入去离子水至总体积为100ml,在15 lbf/in2(1.034×105Pa)高压下蒸气灭菌20min]和20ml经灭菌1mol/L MgSO4溶液[在180ml去离子水中溶解24.1g MgSO4,然后加入去离子水至总体积为200ml,在15 lbf/in2(1.034×105Pa)高压下蒸气灭菌20min],该培养基在倒皿前使其温度降至60℃左右加入氨苄青霉素1.2ml(50mg/ml)。 16、50mg/ml氨苄青霉素
0.5g氨苄青霉素粉剂溶于10ml灭菌的双蒸水,然后通过0.22?m滤器过滤除
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菌于-20℃保存。 17、1mol/L CaCl2
在200ml纯水中溶解54g CaCl2·6H2O,用0.22?m滤器过滤除菌,分装成1ml小份贮存于-20℃。 18、20mg/ml X-gal
X-gal为5-溴-4-氯-3-吲哚-?-D-半乳糖苷,100mg X-gal溶于5ml二甲基甲酰胺。保存于聚丙烯管中,装有X-gal溶液的试管须用铝箔封裹以防因受光照而被破坏,并应贮存于-20℃,X-gal溶液无须过滤除菌。 19、IPTG溶液
IPTG为异丙基硫代-?-D-半乳糖苷,在4ml蒸馏水中溶解1IPTG后,用蒸馏水定溶至5ml,用0.22?m滤器过滤除菌,分装成1ml小份贮于-20℃。 20、溶液Ⅰ
50mmol/L葡萄糖
25mmol/L Tris-HCl(PH8.0) 10mmol/L EDTA(PH8.0)
溶液Ⅰ可成批配制,每瓶约100ml,在10 lbf/in2(6.895×104Pa)高压下蒸气灭菌15min,贮存于4℃。 21、溶液Ⅱ(现配现用)
0.2mol/L NaOH(临用前用5mol/L贮存液现用现稀释) 1% SDS
22、溶液Ⅲ
5mol/L乙酸钾 60ml 冰乙酸 11.5ml 水 28.5ml
(四)DNA提取(朱衡等,1994)
1、0. 1g菌体加入0.5ml提取液,振荡使之与菌体充分混匀,再加入0.1ml 10% SDS、0.3ml氯化苄,剧烈振荡,使管内混合物成乳状。 2、在50℃保温1h,每隔10min振荡混合一次。
3、加入0.3ml 3M NaAc(PH5.2)混匀,冰水浴15min,6000转4℃离心15min。 4、取上清加入等体积的异丙醇室温沉淀20min。
5、10,000转室温离心15min,沉淀用70%乙醇洗一次,空干15min后,溶于500ml
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TE中。
6、加入5?l 10mg/ml RANase,在37℃水浴锅中保温30min
7、加等体积氯仿异戊醇(24:1)溶液,并剧烈振荡使之形成悬乳状,抽提5- 10min。
8、1300g离心10min,用移液器将上清移至干净的Eppendorf管中。
9、上清液中加入等体积的氯仿-异丙醇,如上操作,再提取一次,移入新管。 10、加入1/10体积的NaAc,再加入等体积冷异丙醇,上下转动,可见有絮状沉 淀析出,放入冰箱至过夜,使DNA沉淀,12,000g离心10min收集沉淀。 11、用1ml 80% 的冷乙醇将沉淀洗涤5min,洗涤两次。
12、除掉乙醇并在空气中空干15min,将DNA溶于50?l TE缓冲液中,-20℃ 保存备用。
13、在0.8%的Agrose胶上检测DNA的质量和浓度。
(五) 18SrDNA基因的特异性PCR扩增
1、PCR反应所需的Taq酶和dNTP分别购置上海生工生物工程公司和Promega
公司。PCR扩增反应:参照Jensen等(1998)扩增虫霉目18SrDNA基因所用引物
nu-SSU-0021-5’(CTGGTTGATTCTGCCAGT)和
nu-SSU-1780-3’
(AATGATCCTTCCGCAGGT),引物由上海Sangon公司合成。
2、按以下次序,将各物质加入一只无菌的0.2ml薄壁离心管中:
10×扩增缓冲液* 5?l dNTP(5?M) 8?l nu-SSU-0021-5'(10?M) 2.5?l nu-SSU-1780-3'(10?M) 2.5?l Taq DNA聚合酶(5U/?l) 0.3?l 模板DNA 2?l 灭菌双蒸水 29.7?l *10×扩增缓冲液:
Tris-HCl 100mM(PH8.3) KCl 500mM MgCl2 20mM Gelatin 0.01%
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