湖泊其生物大致与淡水湖相同，盐度较大的湖泊，淡水生物很难生存。当水量继续蒸发减少，咸水湖可以变干，转化为盐沼，至此湖泊全部消亡。
（一）湖盆的演化
1.湖岸的变形 湖盆未充水前，在一定的外力作用下具有相对稳定的坡度。当作用的外营力不发生改变时，岸坡基本上是稳定的。湖盆蓄水后，岸边土壤浸水，土壤中含水量增加，破坏了原先相对稳定的平衡条件，必然引起湖岸变形。
受湖水浸泡，结构受到破坏的湖岸土层，在波浪、湖流的冲击作用下发生崩塌、滑塌的变形。岸壁滑塌物质往往一部分停积在岸边，另一部分随湖流挟走，在波浪长期的作用下，原岸线逐渐后退，该处形成侵蚀浅滩，波浪搬运的物质在岸脚堆积，继续向湖心方向发展形成淤积浅滩。当浅滩发展到足以消耗传至岸边波浪的全部能量时，湖岸便演化成相对稳定的形态。一般说，稳定的湖岸可由岸崖或岸壁、湖滨、岸边浅滩（包括侵蚀浅滩和淤积浅滩）及浅滩外缘斜坡等组成。
2.湖底的沉积 湖底的演化主要是由湖底的沉积作用引起的。湖底的沉积物主要有外界输入和内部形成两个来源。外界输入的沉积物质主要是流域上的泥沙、尘土、盐类及其它元素，经径流或风力挟携入湖；内部形成的沉积物中，有湖岸崩塌的产物、因化学作用从湖水分解出来的盐类，以及湖中水生生物死亡后的残体等。所有这些入湖或湖内的物质、生物，均会由于力学作用、化学作用和生物作用而引起沉积，故湖底的沉积物又可分为机械沉积、化学沉积和生物沉积3种。泥沙淤积即属于机械沉积，流域上水土流失严重往往加剧了湖泊的泥沙沉积。例如，长江上游近些年来水土流失加剧，其中下游洞庭、鄱阳、洪泽、巢湖及太湖5大淡水湖泊的泥沙沉积也日趋严重。据统计，每年泥沙淤积量达1.7×108吨。如前所述，泥沙沉积湖底，使湖泊面积、容积日益缩小，从而调蓄功能也逐渐下降。
由于湖区不同部位动力特性的差异，泥沙在湖区的沉积有明显的分选性。粗粒沉积分布在河流入湖河口附近，较细的沉积在口前湖滨，更细的随湖流至湖中部沉积。泥沙在湖底沉积过程中，也会发生交合作用，即发生理化与生化两种复杂的过程。在交合过程中，水底生物及河底上层土壤中的细菌起着重要的过滤、搅拌、分解作用，随着湖底沉积过程的发展，湖底起伏逐渐变平，当湖泊变浅时，深水部分产生的淤泥往往被浅水沉积物重新覆盖。