19. (Epilithonimonas) 20. (Flaviramulus)
21. 黄杆菌属(Flavobacterium) 22. (Formosa)
23. 泥滩杆菌属(Gaetbulibacter) 24. 泥滩微菌属(Gaetbulimicrobium) 25. (Galbibacter) 26. (Gelidibacter) 27. (Gillisia) 28. (Gilvibacter)
29. 革兰菌属(Gramella) 30. (Kaistella) 31. (Kordia)
32. (Krokinobacter) 33. (Lacinutrix)
34. 列文虎克菌属(Leeuwenhoekiella) 35. (Lutibacter) 36. (Maribacter) 37. (Mariniflexile) 38. (Marixanthomonas) 39. (Mesonia) 40. (Muricauda) 41. (Myroides) 42. (Nonlabens) 43. (Olleya)
44. (Ornithobacterium) 45. (Persicivirga) 46. (Pibocella)
47. 极地杆菌属(Polaribacter) 48. 冷弯菌属(Psychroflexus) 49. (Psychroserpens) 50. (Riemerella) 51. (Robiginitalea) 52. (Salegentibacter) 53. (Sandarakinotalea) 54. (Sediminibacter) 55. (Sediminicola) 56. 世宗菌属(Sejongia) 57. (Stanierella)
58. (Stenothermobacter) 59. (Subsaxibacter) 60. (Subsaximicrobium) 61. (Tamlana)
62. (Tenacibaculum)
63. (Ulvibacter) 64. (Vitellibacter) 65. (Wautersiella) 66. (Weeksella)
67. (Winogradskyella) 68. 丽水菌属(Yeosuana) 69. (Zeaxanthinibacter) 70. 周氏菌属(Zhouia) 71. (Zobellia)
72. 王祖农菌属(Zunongwangia)
[编辑] 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria) 1. 鞘脂杆菌目(Sphingobacteriales)
1. 泉发菌科(Crenotrichaceae)
1. (Balneola)
2. (Chitinophaga)
3. 泉发菌属(Crenothrix) 4. (Rhodothermus) 5. (Salinibacter) 6. (Terrimonas) 7. (Toxothrix)
2. (Flammeovirgaceae)
1. (Flammeovirga) 2. (Flexithrix) 3. (Perexilibacter) 4. (Persicobacter) 5. (Rapidithrix) 6. (Sediminitomix) 7. (Thermonema)
3. 屈挠杆菌科(Flexibacteraceae)
1. (Adhaeribacter) 2. (Aquiflexum) 3. (Arcicella) 4. (Belliella)
5. (Chimaereicella) 6. (Cyclobacterium)
7. 噬胞菌属(Cytophaga) （注：目前多称此属为“噬纤维菌属”，
此处依拉丁文） 8. (Dyadobacter) 9. (Echinicola) 10. (Effluviibacter) 11. (Emticicia)
12. (Fabibacter) 13. (Flectobacillus)
14. 屈挠杆菌属(Flexibacter) 15. (Hongiella) 16. (Hymenobacter) 17. (Larkinella) 18. (Leadbetterella) 19. (Marinicola) 20. (Meniscus) 21. (Microscilla) 22. (Niastella) 23. (Persicitalea) 24. (Reichenbachiella) 25. (Rhodonellum) 26. (Roseivirga) 27. (Runella) 28. (Spirosoma)
29. 生孢噬胞菌属(Sporocytophaga)
4. 腐螺旋菌科(Saprospiraceae)
1. (Aureispira)
2. (Haliscomenobacter) 3. (Lewinella)
4. 腐螺旋菌属(Saprospira)
5. 鞘脂杆菌科(Sphingobacteriaceae)
1. (Mucilaginibacter) 2. (Olivibacter) 3. (Parapedobacter) 4. (Pedobacter)
5. (Pseudosphingobacterium) 6. 鞘脂杆菌属(Sphingobacterium)
6. 科未定
1. (Niabella)
[编辑] 纲未定 1. 2. 3. 4.
(Flavisolibacter) (Fulvivirga) (Prolixibacter) (Segetibacter)
[编辑] 衣原体门(Chlamydiae) [编辑] 衣原体纲(Chlamydiae) 1. 衣原体目(Chlamydiales)
1. 衣原体科(Chlamydiaceae)
1. 衣原体属(Chlamydia) 2. 嗜衣体属(Chlamydophila)
2. 副衣原体属(Parachlamydiaceae)
1. 新衣原体属(Neochlamydia) 2. 副衣原体属(Parachlamydia)
3. 芯卡体科(Simkaniaceae)
1. 芯卡体属(Simkania) （注：人名缩写简称，此处用音译） 2. 棍衣原体属(Rhabdochlamydia)*
4. 华诊体科(Waddliaceae)
1. 华诊体属(Waddlia) （注：WADDL为“华盛顿动物病诊断实验室”
缩写）
[编辑] 绿菌门(Chlorobi) [编辑] 绿菌纲(Chlorobia) 1. 绿菌目(Chlorobiales)
1. 绿菌科(Chlorobiaceae)
1. 臂绿菌属(Ancalochloris) 2. 绿棒菌属(Chlorobaculum) 3. 绿菌属(Chlorobium)
4. 绿爬菌属(Chloroherpeton) 5. 暗网菌属(Pelodictyon)
6. 突柄绿菌属(Prosthecochloris)
[编辑] 绿弯菌门(Chloroflexi) [编辑] 厌氧绳菌纲(Anaerolineae) 1. 厌氧绳菌目(Anaerolineales)
1. 厌氧绳菌科(Anaerolineaceae)
1. 厌氧绳菌属(Anaerolinea) 2. (Bellilinea)
3. 纤绳菌属(Leptolinea) 4. (Levilinea)
5. 长绳菌属(Longilinea)
[编辑] 暖绳菌纲(Caldilineae) 1. 暖绳菌目(Caldilineales)
1. 暖绳菌科(Caldilineaceae)
1. 暖绳菌属(Caldilinea)
[编辑] 绿弯菌纲(Chloroflexi) 1. 绿弯菌目(Chloroflexales)
1. 绿弯菌科(Chloroflexaceae)
1. 绿弯菌属(Chloroflexus) 2. 绿线菌属(Chloronema) 3. 太阳发菌属(Heliothrix) 4. 玫瑰弯菌属(Roseiflexus)
2. 颤绿菌科(Oscillochloridaceae)
1. 颤绿菌属(Oscillochloris)
2. 爬管菌目(Herpetosiphonales)
1. 爬管菌科(Herpetosiphonaceae)
1. 爬管菌属(Herpetosiphon)
[编辑] 产金菌门(Chrysiogenetes) [编辑] 产金菌纲(Chrysiogenetes) 1. 产金菌目(Chrysiogenales)
1. 产金菌科(Chrysiogenaceae)
1. 产金菌属(Chrysiogenes)
[编辑] 蓝藻门(Cyanobacteria) [编辑] 蓝藻纲(Cyanobacteria) 注：目前有三套蓝藻分类系统，分别为NCBI、Bergey's手册及Cavalier-Smith（2002年，仅分至目)。 本文采用的Bergey's手册中蓝藻内的分类，不论目科属，均为形态分类，其中目在手册中为“Subsection”而非“Order”，目、科均未列名称，此处目名称为习惯用法，科不列名称；属除Halospirulina和Trichodesmium之外均标为“形态属”(Form Genus)