13. 黄色杆菌科(Xanthobacteraceae)
1. (Ancylobacter) 2. (Azorhizobium) 3. (Labrys)
4. (Pseudolabrys) 5. (Starkeya)
6. 黄色杆菌属(Xanthobacter)
14. 科未定
1. (Sneathiella)
5. 红杆菌目(Rhodobacterales)
1. 生丝单胞菌科(Hyphomonadaceae)
1. (Hirschia)
2. 生丝单胞菌属(Hyphomonas) 3. (Maricaulis) 4. (Oceanicaulis)
5. (Robiginitomaculum)
2. 红杆菌科(Rhodobacteraceae)
1. (Ahrensia) 2. (Albidovulum) 3. (Amaricoccus) 4. (Antarctobacter) 5. (Catellibacterium) 6. (Citreicella) 7. (Citreimonas) 8. (Dinoroseobacter) 9. (Donghicola) 10. (Gemmobacter) 11. (Haematobacter) 12. (Jannaschia)
13. (Ketogulonicigenium) 14. (Labrenzia) 15. (Leisingera) 16. (Loktanella) 17. (Maribius) 18. (Marinovum)
19. (Maritimibacter) 20. (Methylarcula) 21. (Nereida)
22. (Nesiotobacter) 23. (Oceanibulbus)
24. 海洋生菌属(Oceanicola) 25. (Octadecabacter) 26. (Palleronia) 27. (Pannonibacter)
28. 副球菌属(Paracoccus) 29. (Pelagibaca) 30. (Phaeobacter)
31. 假红杆菌属(Pseudorhodobacter) 32. (Pseudovibrio) 33. (Rhodobaca)
34. 红杆菌属(Rhodobacter) 35. (Rhodothalassium)
36. 小红卵菌属(Rhodovulum) 37. (Roseibacterium) 38. (Roseibium) 39. (Roseicyclus)
40. (Roseinatronobacter) 41. (Roseisalinus) 42. (Roseivivax)
43. 玫瑰杆菌属(Roseobacter) 44. (Roseovarius)
45. (Rubellimicrobium) 46. (Rubrimonas) 47. (Ruegeria) 48. (Sagittula) 49. (Salipiger) 50. (Shimia)
51. (Silicibacter) 52. (Staleya) 53. (Stappia)
54. (Sulfitobacter) 55. (Tateyamaria) 56. (Thalassobacter) 57. (Thalassobius) 58. (Thalassococcus) 59. (Thioclava)
60. 硫球形菌属(Thiosphaera) 61. (Wenxinia)
62. 木洞菌属(Woodsholea) 63. 杨氏菌属(Yangia)
6. 红螺菌目(Rhodospirillales)
1. 醋杆菌科(Acetobacteraceae)
1. 醋杆菌属(Acetobacter) 2. (Acidicaldus)
3. 嗜酸菌属(Acidiphilium) 4. 酸球形菌属(Acidisphaera) 5. 酸胞菌属(Acidocella) 6. 酸单胞菌属(Acidomonas)
7. (Asaia) 8. (Belnapia)
9. 脆弱球菌属(Craurococcus)
10. 葡糖醋杆菌属(Gluconacetobacter) 11. 葡糖杆菌属(Gluconobacter) 12. (Granulibacter) 13. (Kozakia)
14. 鼠球菌属(Muricoccus) 15. (Neoasaia)
16. (Paracraurococcus) 17. 红球状菌属(Rhodopila) 18. (Rhodovarius)
19. 玫瑰球菌属(Roseococcus) 20. 玫瑰单胞菌属(Roseomonas) 21. (Rubritepida) 22. (Saccharibacter) 23. (Stella)
24. (Swaminathania) 25. (Teichococcus) 26. (Zavarzinia)
2. 红螺菌科(Rhodospirillaceae)
1. 固氮螺菌属(Azospirillum) 2. (Conglomeromonas) 3. (Defluviicoccus) 4. (Inquilinus)
5. 磁螺菌属(Magnetospirillum) 6. (Phaeospirillum) 7. (Rhodocista)
8. 红螺旋菌属(Rhodospira) 9. 红螺菌属(Rhodospirillum) 10. 红弧菌属(Rhodovibrio) 11. 玫瑰螺旋菌属(Roseospira) 12. (Skermanella)
13. (Telmatospirillum) 14. (Thalassospira) 15. (Tistrella)
7. 立克次体目(Rickettsiales)
1. 无形体科(Anaplasmataceae)
1. (Aegyptianella) 2. 无形体属(Anaplasma) 3. (Cowdria)
4. 埃里希体属(Ehrlichia)
5. 新立克次体属(Neorickettsia) 6. 沃巴赫体属(Wolbachia)
7. (Xenohaliotis)*
2. 全孢菌科(Holosporaceae)
1. 全孢菌属(Holospora)
3. 立克次体科(Rickettsiaceae)
1. (Orientia)
2. 立克次体属(Rickettsia)
4. SAR 11群*
1. 远洋杆菌属(Pelagibacter)*
5. 科未定
1. (Lyticum) 2. (Odyssella)*
3. (Pseudocaedibacter) 4. (Symbiotes) 5. (Tectibacter)
8. 鞘脂单胞菌目(Sphingomonadales)
1. 赤杆菌科(Erythrobacteraceae)
1. (Altererythrobacter) 2. 赤杆菌属(Erythrobacter) 3. 赤微菌属(Erythromicrobium) 4. 紫杆菌属(Porphyrobacter)
2. 鞘脂单胞菌科(Sphingomonadaceae)
1. 芽单胞菌属(Blastomonas)
2. 柠檬酸微菌属(Citromicrobium)* 3. 赤单胞菌属(Erythromonas) 4. 新鞘脂菌属(Novosphingobium) 5. (Sandaracinobacter) 6. (Sandaracinorhabdus） 7. 鞘脂菌属(Sphingobium)
8. 鞘脂单胞菌属(Sphingomonas) 9. (Sphingopyxis) 10. (Sphingosinicella)
11. 发酵单胞菌属(Zymomonas)
9. 目未定
1. (Albimonas)
2. (Caenispirillum) 3. (Insolitispirillum) 4. (Novispirillum)
[编辑] β-变形菌纲(Betaproteobacteria) 1. 伯克氏菌目(Burkholderiales)
1. 产碱菌科(Alcaligenaceae)
1. 无色杆菌属(Achromobacter)
2. (Advenella)
3. 产碱菌属(Alcaligenes) 4. (Azohydromonas)
5. 博德氏菌属(Bordetella) 6. (Brackiella) 7. (Castellaniela)
8. 德克斯氏菌属(Derxia) 9. (Kerstersia) 10. (Oligella) 11. (Pelistega)
12. (Pigmentiphaga) 13. (Pusillimonas) 14. (Sutterella) 15. (Taylorella)
16. (Tetrathiobacter)
2. 伯克氏菌科(Burkholderiaceae)
1. 伯克氏菌属(Burkholderia) 2. (Chitinimonas) 3. (Cupriavidus) 4. (Lautropia) 5. (Limnobacter) 6. (Pandoraea) 7. (Paucimonas)
8. (Polynucleobacter) 9. 青枯菌属(Ralstonia) 10. (Thermothrix)
11. 沃特氏菌属(Wautersia)
3. 丛毛单胞菌科(Comamonadaceae)
1. 食酸菌属(Acidovorax) 2. (Alcycliphilus) 3. (Brachymonas) 4. (Caenibacterium) 5. (Caldimonas)
6. 丛毛单胞菌属(Comamonas) 7. (Curvibacter)
8. 代尔夫特菌属(Delftia) 9. (Diaphorobacter) 10. (Giesbergeria)
11. 噬氢菌属(Hydrogenophaga) 12. (Hylemonella) 13. (Lampropedia) 14. (Macromonas) 15. (Malikia) 16. (Ottowia)