4. 互营菌属(Syntrophus)
2. 互营杆菌科(Syntrophobacteraceae)
1. (Desulfacinum) 2. (Desulfoglaeba) 3. (Desulforhabdus) 4. (Desulfovirga)
5. 互营杆菌属(Syntrophobacter) 6. (Thermodesulforhabdus)
[编辑] ε-变形菌纲(Epsilonproteobacteria) 1. 弯曲菌目(Campylobacterales)
1. 弯曲菌科(Campylobacteraceae)
1. 弓形杆菌属(Arcobacter) 2. 弯曲菌属(Campylobacter) 3. (Dehalospirillum)
4. 硫磺单胞菌属(Sulfurospirillum)
2. 螺杆菌科(Helicobacteraceae)
1. 螺杆菌属(Helicobacter) 2. (Sulfuricurvum) 3. (Sulfurimonas) 4. (Sulfurovum) 5. (Thiovulum)
6. 沃林氏菌属(Wolinella)
3. 氢单胞菌科(Hydrogenimonadaceae)
1. 氢单胞菌属(Hydrogenimonas)
2. (Nautiliales)
1. (Nautiliaceae)
1. (Caminibacter) 2. (Lebetimonas) 3. (Nautilia)
4. (Nitratifractor) 5. (Nitratiruptor) 6. (Thioreductor)
[编辑] γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria) 1. 酸硫杆状菌目(Acidithiobacillales)
1. 酸硫杆状菌科(Acidithiobacillaceae)
1. 酸硫杆状菌属(Acidithiobacillus)
2. 热硫杆状菌科(Thermithiobacillaceae)
1. 热硫杆状菌属(Thermithiobacillus)
2. 气单胞菌目(Aeromonadales)
1. 气单胞菌科(Aeromonadaceae)
1. 气单胞菌属(Aeromonas) 2. (Oceanimonas) 3. (Oceanisphaera) 4. (Tolumonas) 5. (Zobellella)
2. 琥珀酸弧菌科(Succinivibrionaceae)
1. 厌氧螺菌属(Anaerobiospirillum) 2. 反刍杆菌属(Ruminobacter) 3. 琥珀酸单胞菌属(Succinimonas) 4. 琥珀酸弧菌属(Succinivibrio)
3. 交替单胞菌目(Alteromonadales)
1. 交替单胞菌科(Alteromonadaceae)
1. (Aestuariibacter) 2. (Agarivorans) 3. (Alishewanella)
4. 交替单胞菌属(Alteromonas) 5. (Glaciecola)
6. (Marinimicrobium)
7. 海杆菌属(Marinobacter) 8. 海细菌属(Marinobacterium) 9. 产微球茎菌属(Microbulbifer) 10. (Saccharophagus) 11. (Salinimonas)
2. (Colwelliaceae)
1. (Colwellia)
2. (Thalassomonas)
3. (Ferrimonadaceae)
1. (Ferrimonas) 2. (Paraferrimonas)
4. (Idiomarinaceae)
1. (Idiomarina)
2. (Pseudidiomarina)
5. (Moritellaceae)
1. (Moritella)
6. 假交替单胞菌科(Pseudoalteromonadaceae)
1. (Algicola)
2. 假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas)
7. 冷单胞菌科(Psychromonadaceae)
1. 冷单胞菌属(Psychromonas)
8. 希万氏菌科(Shewanellaceae)
1. 希万氏菌属(Shewanella)
9. 科未定
1. (Teredinibacter)
2. (Endobugula)*
4. 心杆菌目(Cardiobacteriales)
1. 心杆菌科(Cardiobacteriaceae)
1. 心杆菌属(Cardiobacterium) 2. (Dichelobacter) 3. (Suttonella)
5. 着色菌目(Chromatiales)
1. 着色菌科(Chromatiaceae)
1. (Allochromatium) 2. (Amoebobacter)
3. 着色菌属(Chromatium)
4. 盐着色菌属(Halochromatium) 5. (Isochromatium) 6. (Lamprobacter) 7. (Lamprocystis) 8. (Marichromatium)
9. 亚硝化球菌属(Nitrosococcus) 10. 芬尼氏菌属(Pfennigia)
11. 棍着色菌属(Rhabdochromatium) 12. (Rheinheimera)
13. 热着色菌属(Thermochromatium) 14. 硫碱球菌属(Thioalkalicoccus) 15. 硫橄榄菌属(Thiobaca) 16. 硫匣菌属(Thiocapsa) 17. 硫球菌属(Thiococcus) 18. 硫囊菌属(Thiocystis) 19. 硫网菌属(Thiodictyon)
20. 硫黄球菌属(Thioflavicoccus) 21. 硫盐匣菌属(Thiohalocapsa) 22. (Thiolamprovum) 23. (Thiopedia)
24. 硫红球菌属(Thiorhodococcus) 25. 硫红弧菌属(Thiorhodovibrio) 26. 硫螺菌属(Thiospirillum)
2. 外硫红螺旋菌科(Ectothiorhodospiraceae)
1. 碱湖生菌属(Alkalilimnicola) 2. 碱螺菌属(Alkalispirillum) 3. (Aquisalimonas) 4. (Arhodomonas)
5. (Ectothiorhodosinus)
6. 外硫红螺旋菌属(Ectothiorhodospira) 7. 盐红螺旋菌属(Halorhodospira) 8. (Natronocella)
9. 硝化球菌属(Nitrococcus)
10. 硫碱螺旋菌属(Thioalkalispira) 11. 硫碱弧菌属(Thialkalivibrio) 12. 硫红螺旋菌属(Thiorhodospira)
3. 颗粒状球菌科(Granulosicoccaceae)
1. 颗粒状球菌属(Granulosicoccus)
4. 盐硫杆状菌科(Halothiobacillaceae)
1. 盐硫杆状菌属(Halothiobacillus) 2. (Thiovirga)
6. 肠杆菌目(Enterobacteriales)
1. 肠杆菌科(Enterobacteriaceae)
1. (Arsenophonus) 2. (Brenneria)
3. 布赫纳氏菌属(Buchnera) 4. (Budvicia)
5. 布丘氏菌属(Buttiauxella) 6. (Calymmatobacterium) 7. 西地西菌属(Cedecea)
8. 柠檬酸杆菌属(Citrobacter) 9. (Dickeya)
10. 爱德华氏菌属(Edwardsiella) 11. 肠杆菌属(Enterobacter) 12. 欧文氏菌属(Erwinia)
13. 埃希氏菌属(Escherichia) （包含大肠杆菌） 14. (Ewingella)
15. 哈夫尼菌属(Hafnia)
16. 克雷伯氏菌属(Klebsiella) 17. 克吕沃氏菌属(Kluyvera) 18. (Leclercia) 19. (Leminorella) 20. (Levinea) 21. (Moellerella) 22. (Morganella)
23. (Obesumbacterium) 24. 泛菌属(Pantoea) 25. (Pectobacterium) 26. (Phlomobacter)* 27. (Photorhabdus)
28. 邻单胞菌属(Plesiomonas) 29. (Pragia)
30. 变形杆菌属(Proteus) （注：或译作“变形菌属”，此处把“变
形菌”一词留给Proteobacteria） 31. 普罗维登斯菌属(Providencia) 32. (Rahnella) 33. (Raoultella)
34. 糖杆菌属(Saccharobacter) 35. 沙门氏菌属(Salmonella) 36. (Samsonia)
37. 沙雷氏菌属(Serratia) 38. 志贺氏菌属(Shigella) 39. (Sodalis) 40. (Tatumella) 41. (Thorsellia) 42. (Trabulsiella) 43. (Wigglesworthia)
44. 致病杆菌属(Xenorhabdus)
45. 耶尔辛氏菌属(Yersinia) （包含鼠疫杆菌） 46. (Yokenella)
7. 军团菌目(Legionellales)
1. 柯克斯体科(Coxiellaceae)
1. (Aquicella)
2. 柯克斯体属(Coxiella)
3. 立克次小体属(Rickettsiella)
2. 军团菌科(Legionellaceae)
1. (Fluoribacter)
2. 军团菌属(Legionella) 3. (Sarcobium) 4. (Tatlockia)
8. 甲基球菌目(Methylococcales)
1. 甲基球菌科(Methylococcaceae)
1. 甲基杆菌属(Methylobacter) 2. 甲基暖菌属(Methylocaldum) 3. 甲基球菌属(Methylococcus) 4. 甲基盐菌属(Methylohalobius) 5. 甲基微菌属(Methylomicrobium) 6. 甲基单胞菌属(Methylomonas)
7. 甲基八叠球菌属(Methylosarcina) 8. (Methylosoma)
9. 甲基球形菌属(Methylosphaera) 10. 甲基热菌属(Methylothermus)
9. 海洋螺菌目(Oceanospirillales)
1. 食碱菌科(Alcanivoraceae)
1. 食碱菌属(Alcanivorax) 2. (Fundibacter) 3. (Kangiella)
2. 河氏菌科(Hahellaceae)
1. (Endozoicomonas) 2. 河氏菌属(Hahella) 3. (Halospina)