元朝在东北置辽阳行省，其南界抵达辽东半岛南端，东南与高丽接壤。元与高丽边界线东段，一度曾达铁岭（今朝鲜元山南），13世纪末，双城（今朝鲜永兴）以南为高丽收复，此后遂以双城为国界，西段一度以慈悲岭（今朝鲜黄海北道中部）为界山，以后又恢复到元初以鸭绿江南岸一部分辖境分界。东至于海，在黑龙江口奴儿干地置征东元帅府。1286年前还征服了今库页岛上的骨嵬。在北方设置了岭北行省，辖有今外蒙古、俄罗斯西伯利亚中部和中国内蒙古东部、北部和黑龙江部分地区。西南方面统一吐蕃地区（包括今藏、青大部、川西以及不丹、锡金和克什米尔部分地），置吐蕃等处宣慰使司都元帅府、吐蕃等路宣慰使司都元帅府和乌思、藏、纳里速古鲁孙等三路宣慰使司都元帅府，属中央宣政院统辖，使青藏高原第一次成为中原王朝的直属版图。1254年灭大理国，建立云南行省，辖境除今滇及黔、川部分地外，南界还到了缅甸、泰国境内。脱离了中原王朝数百年之久的云贵高原又加入了统一的大家庭。在海疆方面第1次在澎湖列岛设立行政机构巡检司，属晋江县（一说属同安县）管辖。
元朝庭面积最大时，大约有2122.74万平方公里的土地。 元时期是中国历史上版图最为开阔的时期，元朝北到北冰洋，南到南海群岛，东到大海，东北到白令海峡，西到鄂毕河。后期也有1960万平方公里。
明朝：
1368年元顺帝在北伐的明军威逼之下,北遁上都(今内蒙古正蓝旗东闪电河北岸)， 明兵进入大都（今北京市），元作为中原的统治王朝至此结束（残余势力保据漠北，史称北元，1402年后改称鞑靼）。继之而起的明朝直接统治了原来的南宋、大理和西夏、金的大部分地区，对黑龙江、松花江流域和吐蕃地区则采用羁縻统治的方式，漠北仍为蒙古后裔靼鞑、瓦所有。今新疆地区为察合台后裔亦力把里的领土，而介于亦力把里和甘肃之间的嘉峪关以外哈密等卫，则也在明朝的羁縻统治之下，其版图远较元朝为小。
公元1368年，平民朱元璋驱元，称帝，定都江苏南京，建国号
明。元顺帝率余部返回蒙古地区。 公元1369年，朝鲜归降明朝廷。 公元1372年，西藏、琉球群岛归降明朝廷。 公元1388年，全国基本统一。
公元1421年，明帝朱棣（di）定都北京。 公元1436年，越南归降明朝廷。
明前期与元朝相比的疆域大为收缩，不过明继承了元在东北和青藏高原的版图。元朝残余势力退居蒙古草原，分裂为瓦刺和鞑靼两部，对明朝形成了巨大的威胁。
此时明朝统一全国。领土面积最广时，东北到外兴安岭以北阿尔丹加附近，北到长城以北，西北西到哈密，西到克什米尔，西南到缅甸东部，南到南海诸岛，东南包括台湾及其附近岛屿，东至日本海以及太平洋，面积大约有1030万平方公里左右。
公元1553年，葡萄牙人占领澳门。此时明朝的面积有890万平方公里。
公元1616年，明臣女真人努尔哈赤在辽宁新宾老城即汗位，建国号金，史称后金，占有黑龙江、吉林、辽宁等地区。
公元1636年，金汗努尔哈赤子皇太极称帝，将金改为清。蒙古各部归顺清政府。
公元1642年，荷兰人占领台湾。
公元1644年，明驿卒李自成驱明，称帝，定都西安，建国号顺。明
臣吴三桂引清军入关灭顺，定都北京。平民张献忠在四川称帝，定都成都，建国号大西。
明末天下形式：
明350万平公里，清320万平公里，西藏220万平公里，外蒙古100万平公里，大顺100万平公里，大西35万平公里
清朝：
清代的疆域是由3大部分组成的:以狩猎为主的女真区、以畜牧
为主的蒙古区和以农业为主的明朝区。
清代先世是活动在明朝边墙以东的建州女真部落之一。16世纪下半叶开始逐渐扩张，统一了建州女真，又并吞了海西、东海诸部。1616年建国号为金，旋即起兵反明，占领了辽东都司的大部分土地。1636年改国号曰清。1644年明亡于李自成农民军，清军在击败农民军后乘机入据北京城，建立了继承明代的中原王朝。此后在大陆上的南明势力，经历了20年相继被扑灭。又20年至1683年，统治了台湾岛22年奉明正朔的郑氏政权亦被攻破投降，设1府3县于岛上，隶属福建省。于是统一了明朝全部疆土。此时，清朝面积大约有1453万平方公里。
公元1654年，琉球群岛归降清政府。
公元1662年，明遗臣郑成功驱荷兰人，占领台湾。 公元1683年，清军占领台湾。
17世纪20～30年代,漠南蒙古诸部先后归附后金。17世纪下半叶，活动在天山北路的准噶尔强大，1688年袭击漠北的喀尔喀蒙古。喀尔喀部众降清，移牧漠南。1690年准噶尔又进扰漠南，清兵开始反击，准噶尔败退。1696年破准噶尔于漠北，次年喀尔喀蒙古还牧漠北，漠北遂入版图。套西、青海和硕特蒙古于1688、1698年先后降清。1717年准噶尔夺和硕特部所据西藏，1720年清军护送达赖入藏,准部败退,西藏入清。 1755年平定天山北路准噶尔本部， 未几又叛，1757年再次平定。1759年又平定本在准噶尔大小和卓统治下乘准部