Rasmol使用详解
一、简介
Rasmol 2.7是计算化学与分子图形学以及信息产业的同步高速发展的成果，使一个普通的科研工作人员，在自己的个人电脑上，就可以从Internet上的各种免费数据库中，下载所需观察与研究的分子坐标文件，进而通过Rasmol 2.7以各种模式、各种角度，甚至按照自己的意愿旋转着，观察此分子神秘的微观三维立体结构，进而了解化合物分子结构和各种微观性质与宏观性质之间的定量关系。Rasmol 的作者是Glaxo&Wellcome公司（世界第一大制药公司）研发中心的科学家Roger Sayle，它于1922年发明了此软件,可观看如蛋白质、核酸和微分子以及制作出版质量的图片。
二、软件特点
Rasmol 2.7最大的特点是界面简单，基本操作简单，运行非常迅速，对机器的要求较低，对小的有机分子与大分子，如蛋白质、DNA或RNA, 均能适用，且显示模式非常丰富。而且它程序短小，功能强大。尚无在功能上出其右者。其显示窗口（如下图）可以很简单通过选择相应的菜单来显示分子的三维结构。
用命令行窗口（如下图），通过输入命令可以执行和显示复杂和要求极高的三维图形。
三、下载Rasmol
Rasmol的最新版本可到该网站下载（http://www.openRasmol.org）。在Software Distributions可见到如下图所示部分：
点击图中指示条目可出现下图：
点击圆圈处即可下载最新版的适合广大windows操作系统用户的Rasmol 2.7.2.1.1。现提供该软件的下载链接与此处，方便用户立即下载。点击下载
四、使用Rasmol
双击名为raswin的图标即可启动Rasmol。启动的Rasmol分为前面介绍过的两部分：显示主窗口和行命令窗口。
Rasmol能打开pdb类型的文件，所需pdb文件可在该网站下载。（http://www.rcsb.org/pdb）可在如下图所示的搜索框中输入所要查找的物质名称：
点击search即可查到所需物质的pdb文档。我们以PTEN蛋白为例：输入PTEN,点search查找，可得到如下搜索页。
点击图中箭头所示处即可打开如下页面：
点击圆圈处即可下载该蛋白的pdb文档。
要打开刚才下载的文档，先选择File，再选择Open。如下图：
然后在弹出的选择框中选择刚才保存的名为1d5r的文档，如下图：