最后一种Cartoons模式主要用于表示大分子的某些特殊结构，如α螺旋、β折叠等，该模式是我们教科书上图片常常采用的格式。
2．Colours菜单
Rasmol在此菜单下可以选择多种颜色模式，以human amylase为例。在Monochrome模式只是用单色显示分子结构，如下图：
CPK模式是表示立体分子最常用、最传统的颜色模式，该模式配色以原子为基本单位：
Shapely模式每一种氨基酸或核酸的残基都有一个特定的颜色来表示，如下图：
Group模式是根据氨基酸与核酸残基在分子链中的位置进行上色，每条链从蓝色、绿色、黄色、橙色到红色，如果一条链含有大量异族分子，则颜色变化不一定从蓝色显示到红色，如下图：
Chain模式对蛋白质与核酸的每一根大分子链均以单独的颜色显示，在显示蛋白质亚基和DNA双链结构非常有用，如下图：
Temperature模式表示不同原子在分子中的不同温度值，衡量给定原子的热运行性。数值越高越偏于暖色（红），否则越偏于冷色（蓝）。如下图：
Structure模式主要用来表示蛋白质二级结构，α螺旋表示为深红色，β折叠表示为黄色，转角表示为淡蓝色，其他残基为白色。如下图：
User模式适用用户储存在pdb文件中的颜色方案显示三维分子。 3．Options菜单
此菜单中的一些选项如Hydrogens和Hetro Atoms均为默认选中的，前者选中时程序的任何操作均对氢原子有效，后者选中时对大分子中的异族原子均显示。我们以DNA为例：
Options中的Slab Mode设定了一个与显示屏垂直的Z轴，自动形成一个垂直于Z周的不可见平面，此平面以外的分子结构不显示。如下图：