教程—RasMol使用详解(2)

2020-02-22 11:59

打开之后即在显示主窗口中显示了PTEN的结构,如下图:

特别提示:在已经打开一个pdb文档的情况下,要想打开另一个,必须先关闭前一个。点击File,选择Close,才能打开后一个,否则后一个无法显示,如下图:

五、Rasmol各项指令及演示 1.Display菜单

下面以一个小分子有机物尿素为例。打开尿素的pdb文档出现下图:

一般打开的文档Rasmol会以默认的显示方式wireframe,显示出原子之间的键,若想以其他方式观看该物质的结构,可在Display中选择。包括下图所示的几种:

如下图选择Sticks模式则原子连键会以圆柱显示:

选择Spacefill模式则可以实心球体来显示分子的立体结构:

选择Ball&Stick模式则以球-棒表示分子,原子以球表示,连键以棒表示:

由于尿素分子为小分子,所以用于显示大分子的Backbone,Ribbons,Strands和Cartoons模式无法显示,我们以一种大分子alpha螺旋为例来说明。打开alpha螺旋文档并选择Backbone模式,则可看到分子的主链以圆柱模式显示:

选择Ribbons模式,用丝带表示其结构:

选择Strands模式,用绳丝带表示其结构:


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