1 初古菌門(Korarchaeota)* 2 納古菌門(Nanoarchaeota)* 3 泉古菌門(Crenarchaeota) 3.1 熱變形菌綱(Thermoprotei) 4 廣古菌門(Euryarchaeota) 4.1 甲烷桿菌綱(Methanobacteria) 4.2 甲烷球菌綱(Methanococci) 4.3 甲烷微菌綱(Methanomicrobia) 4.4 鹽桿菌綱(Halobacteria) 4.5 熱原體綱(Thermoplasmata) 4.6 熱球菌綱(Thermococci) 4.7 古球狀菌綱(Archaeoglobi) 4.8 甲烷火菌綱(Methanopyri)
初古菌門(Korarchaeota)*
納古菌門(Nanoarchaeota)* 納古菌屬(Nanoarchaeum)*
泉古菌門(Crenarchaeota)
熱變形菌綱(Thermoprotei) 熱變形菌目(Thermoproteales) 熱變形菌科(Thermoproteaceae) 熱變形菌屬(Thermoproteus) 暖枝菌屬(Caldivirga) 火棒菌屬(Pyrobaculum) 熱分支菌屬(Thermocladium) 火山鬃菌屬(Vulcanisaeta)