廣古菌門(Euryarchaeota)
甲烷桿菌綱(Methanobacteria) 甲烷桿菌目(Methanobacteriales) 甲烷桿菌科(Methanobacteriaceae) 甲烷桿菌屬(Methanobacterium) 甲烷短桿菌屬(Methanobrevibacter) 甲烷球形菌屬(Methanosphaera) 甲烷熱菌科(Methanothermaceae) 甲烷熱菌屬(Methanothermus)
甲烷球菌綱(Methanococci) 甲烷球菌目(Methanococcales) 甲烷球菌科(Methanococcaceae) 甲烷球菌屬(Methanococcus) 甲烷熱球菌屬(Methanothermococcus) 甲烷暖球菌科(Methanocaldococcaceae) 甲烷暖球菌屬(Methanocaldococcus) 甲烷炎菌屬(Methanotorris)
甲烷微菌綱(Methanomicrobia) 甲烷微菌目(Methanomirobiales) 甲烷微菌科(Methanomicrobiaceae) 甲烷微菌屬(Methanomicrobium) 甲烷囊菌屬(Methanoculleus) 甲烷泡菌屬(Methanofollis) 產甲烷菌屬(Methanogenium) 甲烷裂葉菌屬(Methanolacinia) 甲烷盤菌屬(Methanoplanus) 甲烷粒菌科(Methanocorpusculaceae)