生物分类总表
1 古菌域(Archaea)
2 细菌域(Bacteria)
3 真核生物域(Eukarya) 3.1 植物界(Plantae) 3.2 真菌/后生动物组 3.2.1 动物界(Metazoa) 3.2.2 真菌界(Fungi)
3.3 其余真核生物（原生生物和真核藻类）
4 病毒和类病毒
古菌域(Archaea)
包含嗜盐菌、一些超嗜热菌、嗜酸菌等。 参见古菌分类表。
细菌域(Bacteria)
包含蓝藻、放线菌、衣原体、支原体、立克次体等。 参见细菌分类表。 真核生物域(Eukarya)
植物界(Plantae)
包含绿藻、轮藻、苔藓植物、蕨类植物、种子植物等。 参见植物分类表。
真菌/后生动物组
真菌/后生动物组除动物界和真菌外，还包含领鞭毛虫、鱼醉菌等。
动物界(Metazoa) 即“后生动物”。 参见动物分类表。
真菌界(Fungi)
参见真菌分类表，包括子囊菌、担子菌、接合菌、壶菌、Glomeromycota和微孢子虫。
金藻纲(Chrysophyceae) 硅鞭藻纲(Dictyochophyceae) 针胞藻纲(Raphidophyceae) 前毛壶菌纲(Hyphochytriomycetes) 卵菌纲(Oomycetes)
褐藻门(Phaeophyceae)，如海带、巨藻、马尾藻、墨角藻。 硅藻门(Bacillariophyta) 黄藻门(Xanthophyceae) 囊泡虫类(Alveolata)
顶复门(Apicomplexa)，如疟原虫。
纤毛虫类(Ciliophora)，如喇叭虫、中缢虫、榴弹虫、草履虫、四膜虫。 甲藻门(Dinophyceae) 单孢子虫门(Haplosporidia) 丝足虫类(Cercozoa)
根肿菌类(Plasmodiophorida)
粒网足虫类(Granuloreticulosea)，如有孔虫。 叶足纲(Lobosea)，如变形虫（阿米巴）。 黏菌门(Mycetozoa)
灰胞藻纲(Glaucocystophyceae) 红藻门(Rhodophyta)，如石花菜、紫菜。
注：以上真核生物列表不完全，尚包括有其它一些未归类原生生物。 古菌分类表 目錄
1 初古菌門(Korarchaeota)* 2 納古菌門(Nanoarchaeota)* 3 泉古菌門(Crenarchaeota) 3.1 熱變形菌綱(Thermoprotei) 4 廣古菌門(Euryarchaeota) 4.1 甲烷桿菌綱(Methanobacteria) 4.2 甲烷球菌綱(Methanococci) 4.3 甲烷微菌綱(Methanomicrobia) 4.4 鹽桿菌綱(Halobacteria) 4.5 熱原體綱(Thermoplasmata) 4.6 熱球菌綱(Thermococci) 4.7 古球狀菌綱(Archaeoglobi) 4.8 甲烷火菌綱(Methanopyri)
初古菌門(Korarchaeota)*
納古菌門(Nanoarchaeota)* 納古菌屬(Nanoarchaeum)*
泉古菌門(Crenarchaeota)
熱變形菌綱(Thermoprotei) 熱變形菌目(Thermoproteales) 熱變形菌科(Thermoproteaceae) 熱變形菌屬(Thermoproteus) 暖枝菌屬(Caldivirga) 火棒菌屬(Pyrobaculum) 熱分支菌屬(Thermocladium) 火山鬃菌屬(Vulcanisaeta)
熱絲菌科(Thermofilaceae) 熱絲菌屬(Thermofilium) 暖球形菌目(Caldisphaerales) 暖球形菌科(Caldisphaeraceae) 暖球形菌屬(Caldisphaera) 除硫球菌目(Desulfurococcales) 除硫球菌科(Desulfurococcaceae) 除硫球菌屬(Desulfurococcus) 酸葉菌屬(Acidilobus) 氣火菌屬(Aeropyrum) 燃球菌屬(Ignicoccus) 葡萄熱菌屬(Staphylothermus) (Stetteria)
厭硫球菌屬(Sulfophobococcus) 熱盤菌屬(Thermodiscus) 熱球形菌屬(Thermosphaera) 熱網菌科(Pyrodictiaceae) 熱網菌屬(Pyrodictium) 超熱菌屬(Hyperthermus) 火葉菌屬(Pyrolobus) 硫化葉菌目(Sulfolobales) 硫化葉菌科(Sulfolobaceae) 硫化葉菌屬(Sulfolobus) 喜酸菌屬(Acidiamus)
生金球形菌屬(Metallosphaera) 憎葉菌屬(Stygiolobus) 硫磺球形菌屬(Sulfurisphaera) 硫磺球菌屬(Sulfurococcus) 餐古菌目(Cenarchaeales)* 餐古菌科(Cenarchaeaceae)* 餐古菌屬(Cenarchaeum)*
廣古菌門(Euryarchaeota)
甲烷桿菌綱(Methanobacteria) 甲烷桿菌目(Methanobacteriales) 甲烷桿菌科(Methanobacteriaceae) 甲烷桿菌屬(Methanobacterium) 甲烷短桿菌屬(Methanobrevibacter) 甲烷球形菌屬(Methanosphaera) 甲烷熱菌科(Methanothermaceae) 甲烷熱菌屬(Methanothermus)
甲烷球菌綱(Methanococci) 甲烷球菌目(Methanococcales) 甲烷球菌科(Methanococcaceae) 甲烷球菌屬(Methanococcus) 甲烷熱球菌屬(Methanothermococcus) 甲烷暖球菌科(Methanocaldococcaceae) 甲烷暖球菌屬(Methanocaldococcus) 甲烷炎菌屬(Methanotorris)
甲烷微菌綱(Methanomicrobia) 甲烷微菌目(Methanomirobiales) 甲烷微菌科(Methanomicrobiaceae) 甲烷微菌屬(Methanomicrobium) 甲烷囊菌屬(Methanoculleus) 甲烷泡菌屬(Methanofollis) 產甲烷菌屬(Methanogenium) 甲烷裂葉菌屬(Methanolacinia) 甲烷盤菌屬(Methanoplanus) 甲烷粒菌科(Methanocorpusculaceae)