交替单胞菌目(Alteromonadales) 交替单胞菌科(Alteromonadaceae) 交替单胞菌属(Alteromonas) (Aestuariibacter) (Alishewanella) (Colwellia) (Ferrimonas) (Glaciecola) (Idiomarina) (Marinobacter) (Marinobacterium) (Microbulbifer) (Moritella) (Pseudoalteromonas) (Psychromonas) (Shewanella) (Thalassomonas) 科未定
(Teredinibacter) 弧菌目(Vibrionales) 弧菌科(Vibrionaceae) 弧菌属(Vibrio) (Allomonas) (Catenococcus) (Enterovibrio) (Grimontia) (Listonella) (Photobacterium) (Salinivibrio)
气单胞菌目(Aeromonadales) 气单胞菌科(Aeromonadaceae)
气单胞菌属(Aeromonas) (Oceanimonas) (Oceanisphaera) (Tolumonas)
(Succinivibrionaceae) (Succinivibrio) (Anaerobiospirillum) (Ruminobacter) (Succinimonas)
肠杆菌目(Enterobacteriales) 肠杆菌科(Enterobacteriaceae)
埃希氏菌属(Escherichia) （包含大肠杆菌） (Alterococcus) (Arsenophonus) (Brenneria) (Buchnera) (Budvicia) (Buttiauxella) (Calymmatobacterium) (Cedecea) (Citrobacter) (Edwardsiella) 肠杆菌属(Enterobacter) (Erwinia) (Ewingella) (Hafnia)
克雷伯氏菌属(Klebsiella) (Kluyvera) (Leclercia) (Leminorella) (Moellerella)
(Morganella) (Obesumbacterium) (Pantoea) (Pectobacterium) (Phlomobacter) (Photorhabdus) (Plesiomonas) (Pragia)
变形杆菌属(Proteus) （注：或译作“变形菌属”，此处把“变形菌”一词留给Proteobacteria） (Providencia) (Rahnella) (Raoultella) (Saccharobacter) 沙门氏菌属(Salmonella) (Samsonia) (Serratia)
志贺氏菌属(Shigella) (Sodalis) (Tatumella) (Trabulsiella) (Wigglesworthia) (Xenorhabdus)
耶尔辛氏菌属(Yersinia) （包含鼠疫杆菌） (Yokenella)
巴斯德氏菌目(Pasteurellales) 巴斯德氏菌科(Pasteurellaceae) 巴斯德氏菌属(Pasteurella) 放线杆菌属(Actinobacillus) (Gallibacterium) 嗜血菌属(Haemophilus)
(Lonepinella) (Mannheimia) (Phocoenobacter)
δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria) 硫还原菌目(Desulfurellales) 硫还原菌科(Desulfurellaceae) 硫还原菌属(Desulfurella) (Hippea)
脱硫弧菌目(Desulfovibrionales) 脱硫弧菌科(Desulfovibrionaceae) 脱硫弧菌属(Desulfovibrio) (Bilophila) (Lawsonia)
(Desulfomicrobiaceae) (Desulfomicrobium) (Desulfohalobiaceae) (Desulfohalobium) (Desulfomonas) (Desulfonatronovibrio) (Desulfothermus) (Desulfonatronaceae) (Desulfonatronum)
脱硫杆菌目(Desulfobacterales) 脱硫杆菌科(Desulfobacteraceae) 脱硫杆菌属(Desulfobacter) (Desulfatibacillum) (Desulfobacterium) (Desulfobacula) (Desulfobotulus) (Desulfocella)
(Desulfococcus) (Desulfofaba) (Desulfofrigus) (Desulfomusa) (Desulfonema) (Desulforegula) (Desulfosarcina) (Desulfospira) (Desulfotignum) (Desulfobulbaceae) (Desulfobulbus) (Desulfocapsa) (Desulfofustis) (Desulforhopalus) (Desulfotalea) (Nitrospinaceae) (Nitrospina)
脱硫盒菌目(Desulfarculales) 脱硫盒菌科(Desulfarculaceae) 脱硫盒菌属(Desulfarculus) 除硫单胞菌目(Desulfuromonales) 除硫单胞菌科(Desulfuromonaceae) 除硫单胞菌属(Desulfuromonas) (Desulfuromusa) (Molonomonas) (Pelobacter)
地杆菌科(Geobacteraceae) 地杆菌属(Geobacter) (Trichlorobacter)
互营杆菌目(Syntrophobacterales) 互营杆菌科(Syntrophobacteraceae)