腹地范围内跨国企业不断增加，国际国内贸易迅速发展，以供应链管理为基础的无缝运输和商品配送带来新的运输模式的转变，物流操作日趋集中，这就要求能围绕港口形成综合或专业物流中心，降底地区物流成本。深圳港应积极有效地整合内部资源，优化运输环节，积极在港区周围形成物流园区，为物流业发展提供现代化的信息、通信和承运平台，成为深圳市建设亚太地区重要物流中心的重要支撑。
2、建设旅游服务、国际邮轮母港基地
深圳港为服务于和谐深圳、效益深圳和现代化、国际化城市发展需要，强化城市生活服务功能。在满足生产运输需要的前提下，积极实施老码头改造和集约化调整，改善港口形象，打造有特色的人文景观。发展客运旅游功能，拓展邮轮、游艇、游船功能，建设国际邮轮母港，提升城市品味，吸引更多的游客观光，把港口建设成为国际和国内交往的重要窗口。
3、推进保税，自由港进程
目前利用港口开展商贸活动越来越普遍，港口附近或港区内设立保税区或保税码头，港口以保税服务和交易中心的形式越来越多地参与市场活动，介入国内、国际商贸活动的优势，积极向全球货物贸易集散中心和综合物流服务基地发展。因此，深圳港应积极建立港口的商贸及保税功能，逐步向自由港发展。
四、 港口体制及主要港口企业现状 （一）港口体制及政策状况
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深圳港自建港之日起，基本上是实行政府统一规划、宏观调控、依法管理、优质服务，企业按市场经济规律“自筹资金、自我建设、自主经营、自负盈亏”建设和经营港口的模式。政府按照政企分开的原则，在政策上、资源上及财税上给予一系列优惠和倾斜政策，不参与和不干预港口企业的正常经营活动，港口行政主管部门的港政管理工作主要集中在规划、立法、改革、服务及依法管理等方面。
目前深圳市的港口行政管理机构是深圳市交通局（港务管理局），是全国唯一的具有综合大交通职能的管理局，其职能范围包括公路、水路、民航、铁路、城市公交和邮政。
（二）主要港口企业现状
深圳港的发展模式主要是先由政府规划港口发展所需要的岸线和水陆域资源，再由相应的码头开发商按照国家规定的基本建设程序进行开发建设，并成立股份制码头公司负责具体经营和管理。因此，深圳市的港口企业可以分为码头开发商和码头公司（营运商）两大类。
深圳市主要有招商局国际有限公司、中国南山开发集团有限公司、深圳市盐田港集团有限公司、深圳市大铲湾投资有限公司以及深圳市机场集团公司、深圳市航运总公司等六个港口开发公司，负责大多数港区和码头的开发建设。
截止2007年底，深圳港共有码头公司30多家，其中从事集装箱运输业务的码头公司从统计口径只有5家，经过企业之间的整合，逐步向集约化、规模化经营转变。从2008年开始，盐田国际与盐
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田西港区合并，实行统一经营；招商国际将蛇口集装箱码头、招商港务集装箱运输中心和海星港口发展有限公司的集装箱业务进行合理分工；赤湾港区将赤湾集装箱码头、妈湾5—7#泊位和赤湾港航本部的集装箱业务按照各自特点统筹考虑。另外，还有大铲湾集装箱一期2008年1月开始试运营和机场港务经营集装箱运输业务。
主要从事散杂货运输的码头公司主要是赤湾港航股份有限公司、招商港务（深圳）有限公司、海星港口发展有限公司等；主要从事油气、化工品储运的公司有光汇石油化工股份有限公司、华安液化石油气有限公司、中石化深圳石油分公司（下洞油库）、亿升液体仓储有限公司、中石油美视妈湾油港油库有限公司、承远航空油料有限公司、广东大鹏液化天然气码头等；主要客运码头公司是蛇口招港客运实业有限公司、机场港务公司。
（三）各港区情况
[蛇口港区]
由招商局蛇口工业区开发建设，是深圳市最早开发建设的港区，1981年1月开港，同年12月对外国籍船舶开放。目前共有500吨级以上48个，其中经营性泊位42个，非生产性泊位8个；其中经营性万吨级以上深水泊位18个，最大靠泊能力散杂货为7.5万吨级、集装箱为10万吨级。5万吨级以上集装箱专用泊位8个，码头岸线总长度8179.6米。
港区内的主要企业有：招商港务（深圳）有限公司，主要经营散、杂货；蛇口客运专业从事客运服务；蛇口集装箱码头有限公司，主要
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经营集装箱业务；蛇口招商石油化工实业有限公司，专营油气品；香港友联船坞（深圳）有限公司，是深圳市西部港区唯一的修船基地。此外，还有交通部广州救捞局深圳救捞站。
2007年完成货物吞吐量5426.68万吨，占全港总吞吐量的27.14%，其中集装箱503.41万标准箱（含海星公司及妈湾港区0#泊位）；旅客吞吐量315.17万人次。
[赤湾港区]
由中国南山开发(集团)股份有限公司开发经营，1983年开港，1984年5月对外国籍船舶开放。赤湾港区现有500吨级以上泊位共26个，其中经营性泊位17个，万吨级以上经营性深水泊位11个，最大靠泊能力多用途泊位5万吨级、集装箱7万吨级，5万吨级以上集装箱专用泊位5个；还有南海石油后勤服务基地专用泊位7个。码头岸线总长4405.5米。
赤湾港区是重要的深水中转港区和条件优越的南海石油后勤服务基地。西半部是商业码头区，由赤湾港航股份有限公司经营散杂货，赤湾集装箱码头有限公司专营集装箱；东半部是南海石油后勤服务基地及广聚能源赤湾油气库分公司。赤湾港区是中国主要的散装化肥进出口中转基地之一。
2007年完成货物吞吐量5943.44万吨，占全港总吞吐量的29.73%，其中集装箱600.3万标准箱（含妈湾港区5—7#泊位）。
[妈湾港区]
由深圳南油集团有限公司开发。1987年开始建设，1990年7月
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建成第一个3.5万吨级多用途泊位，1990年10月对外国籍船舶开放。现有500吨级以上泊位19个，其中经营性泊位16个，万吨级以上经营性深水泊位9个，最大靠泊能力为5万吨级，码头岸线总长4526米。
妈湾港区面临珠江口矾石水道。该水域以涨潮流为主，含沙量少，进港航道长8500米，自然水深11米，乘潮可通航5万吨级船舶，是中国优良的河口港区，而且与密布的珠江水网相连接，形成良好的水水中转条件。其后方陆域宽阔，能开辟大规模的仓储基地。 港区内的主要企业有：海星港口发展有限公司，主要经营件杂货和散装水泥，并兼营集装箱运输业务；月亮湾油料码头有限公司、美视电厂码头及乐意液体仓储有限公司，专营油品及液体化工产品；妈湾电力有限公司码头，接卸电厂发电用煤；赤湾集装箱妈湾公司、招商港务妈湾0#泊位经营内贸集装箱，大铲岛燃气电厂工作船码头。此外还有一个5000吨级海军后勤码头。
2007年完成货物吞吐量1794.19万吨，占全港总吞吐量的8.97%。
[东角头港区]
东角头港区由深圳市航运总公司开发建设，1987年6月对外国籍船舶开放。现有经营性泊位5个，最大靠泊能力3000吨级，码头岸线总长389.5米。
港区内圳华港湾企业有限公司主要经营散杂货，兼营与香港港口之间的集装箱水路过驳业务，由于深港西部通道的开通，码头功能将改变；蛇口油库及岩谷气库主要经营油气库品。
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