ESI的特点
*软电离, 产生准分子离子?
正离子：(M+H)+，(M + NH4) +，(M + Na) +，(M + K) +… 负离子：(M -H)–，(M + CH3COO)–，(M + Cl)–… *对很多种类的化合物都有很高的灵敏度? *高分子量生物大分子和聚合物产生多电荷离子? (M + nH)n+ (M - nH)n–
*低分子量化合物一般产生单电荷离子(失去或得到一个质子)? *高分子量生物大分子和聚合物产生多电荷离子? *几乎没有碎片离子?
*可能生成加合物和/或多聚体?
常见的是溶剂加合物和NH4+(M+18), Na+(M+23),和K+(M+39) 加合物 *灵敏度取决于化合物本身和基质?
2、大气压化学电离 (APCI)
工作原理：APCI电离是在大气压条件下利用尖端高压（电晕）放电促使溶剂和其他反应物电离、碰撞，及电荷转移等方式，形成一个反应气等离子区，样品分子通过等离子区时，发生质子转移，形成了(M＋H) 或(M-H)离子或加和离子。
大气压化学电离可分为以下两个步骤：
1.快速蒸发：液流被强迫通过一根窄的管路使其得到较高的线速度，给毛细管高温加热及雾化气的作用使液流在脱离管路的时候蒸发成气体
2.气相化学电离(电晕放电)：通过电晕放电，达到气相化学电离
APCI的特点
*软电离，产生准分子离子? 正离子：(M+H)+，(M + NH4)+，….
负离子：(M-H)–，(M + CH3COO)–，(M + Cl)–，…
*主要产生单电荷离子,几乎没有碎片离子,纯气相离子化过程，只产生极少的添加离子? *受基质影响较小? (相对于ESI), 质谱图不受缓冲盐及其缓冲力变化的影响
*与ESI相比适于极性较小的化合物,? 一般适合分析挥发性化合物，也常分析从中性到极性的化合物
*热不稳定化合物可能会发生降解?
*可能生成加合物和/或多聚体;? 一般是溶剂加合物及NH4+ (M+18), Na+ (M+23), 和 K+(M+39)加合物
*流速范围大，从0.2? 到2.0mL/min ，而不用分流。
（三）质量分析器
任何质谱仪的基本功能都是分析气态离子。样品的电离过程和蒸发都在离子源中进行。质量分析器分析那些离子，当它们进入检测器时，控制它们的移动，并将它们转化为实际信号。
1、单四极杆质谱仪
四极杆工作原理
四极杆质量分析器由四个平行的杆组成，DC和 RF电压被加载在四极杆上，用于过滤除了某个特定的质荷比数值离子以外的所有离子。四根杆都施加 RF电压，但是负―–‖极杆与正―+‖极杆相差了 180度。杆根据施加的DC电压标记了 +和 –。当施加某个电压时，只有某个特定数值的质荷比的离子能通过四极杆到检测器中，就算所有的样品都在源中产生离子。当电压变化成其它数值，其他质荷比的离子也能通过。因此，一个完整的质谱扫描就是应用到四根杆上的 DC和 RF电压不断的变动。
一个精确设定的RF和 DC电压被加载到杆上，该电压允许某个质荷比通过。如果对于DC和 RF电压对来说质量过大的离子将会漂到负极杆，因为 RF力不足以克服离子动力。当正极杆有一个负电压的时候，质荷比低于所选择的质荷比的离子将会加速而漂到正极杆。这个过程将过滤超过带宽的质量。这个带宽是通过在调谐文件中设定的 DC和RF的比值确定的。施加于杆的DC和 RF电压会改变，这样下一个质量数就可以通过进入检测器。
四极杆分辨率
这是马修稳定图，是RF和DC电压的结合图。这张图可以预测给定的离子在四级杆场中是否稳定。对于特定的RF和DC电压，包含这个点的在质谱区域内的离子将会通过进入四级杆进入检测器。这条扫描线由调谐文件中设置的宽度增益和宽度补偿决定。如果降低宽度补偿，扫描线将会下降，峰宽度将会加宽,分辨降低。如果扫描线被提高，峰宽度将会变窄,分辨率增加。
2、多级串联质谱仪——三重四极杆