（1）加工贸易企业开展深加工结转业务，应事先经外经贸主管部门批准。
\h0 yT%/ Q （2）海关对保税货物深加工结转采用计划备案制度。根据海关总署 [2004]109号令，加工贸易企业开展深加工结转的，转入、转出企业应当向各自主管海关申报结转计划，经双方主管海关备案后，可以办理实际收发货及报 关手续。转出、转入企业向海关申报结转计划时应当提交《中华人民共和国海关加工贸易保税货物深加工结转申请表》（以下简称“申报表”）。
$ e# w1 OH0 Oy+K 2、深加工结转业务的海关监管方法。
转出、转入企业实际收发货 后，应当按照以下规定办理结转报关手续：转出、转入企业应当分别在转出地、转入地海关办理结转报关手续。转出、转入企业可以凭一份《申请表》分批或者集中 办理报关手续。转入企业凭《申请表》、《登记表》等单证向转入地海关先办理结转进口报关手续，并在结转进口报关后的第二个工作日内将报关情况通知转出企 业。转出企业自接到转入企业通知之日起10日内，凭《申请表》、《登记表》等单证向转出地海关办理结转出口报关手续。
3、深加 工结转的外汇核销管理。
+ K/ E*$ E6Y/ FN7 @%T|A 开展深加工结转业务的上、下游企业之间可比照进出口贸易的外汇结算，并按规定办理进口付汇和出口收汇核销手续。同时，也存在大量的人民币结算业务。
3 Y9 wo\3Nq%M*S&|Q 4、深加工结转业务的税收管理。
对加工贸易深加工结转业务的国内环节的税收问题，税收如何处理，在现行的税收规定中没有直接明确，理论上和实际执行中主要有三种不同的处理方法：
一是道道结转，道道征税，深加工结转的复出口货物报关离境后按现行一般贸易规定进行退（免）税管理。
b~## W9W 二是道道结转、道道免税，深加工结转的复出口货物报关离境后按现行加工贸易规定进行退（免）税管理。
@%Y8 9^o6 ~# n 三是道道“免、抵、退”税，深加工结转的复出口货物报关离境后按现行加工贸易规定进行退（免）税管理。
（二）深加工结转业务税收政策的利弊分析。
1、实行征税政策的利弊分析。
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利：一是符合增值税条例的基本规定，由于转厂加工的上下游企业，都是在境内，此种形式的深加工结转业务，符合增值税“境内销售货物行为”，应按内销规 定征税，同时根据增值税专用发票的使用规定，在结转时，可以按规定开具增值税专用发票，下游加工企业据
此作为进项税额的抵扣凭证，从当期的销项税额中抵 扣，深加工结转的复出口货物，按一般贸易规定给予全额退（免）税,保持了增值税征、退两条线和链条关系的连续性；二是有利于规范出口加工区等海关特殊监管 区域的管理，改变加工贸易企业过于分散的现状；三是有助于加工贸易企业使用国产料件。
4 ^&P$ my2 ~3 o2 Z_5C6 q+ 2CF 弊：（1）改变了现行加工贸易政策，造成国家有关部门实施加工贸易政策不统一、不协
调。按照国办发[1999]35号的规定，对深加工结转业务，国家 有关部门视同进出口贸易实行保税监管，如海关对保税进口料件深加工结转进行保税监管，外管允许深加工结转以外汇结算并办理进出口的售付汇。如果对间接出口 视同内销，转出企业在结转时缴纳增值税，企业需要开具增值税专用发票，海关将据此认定企业进料加工后内销，需要补征关税和进口环节增值税，外管部门也不予 外汇核销。因此，如对深加工结转业务征税将造成国家政策的相互矛盾和混乱，破坏了我国整体加工贸易政策一致性、连贯性和系统性，整个加工贸易政策可能由于 税收管理的原因导致国办发[1999]35号文件的规定无法落实。
w* b8 / ?8 n%Z7 V+~TRd （2）严重占压企业资金，增大企业的经营成本，严重削弱企业竞争能力。企业普遍反映，
对深加工结转业务征税将增加企业资金负担，企业难以承受。
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（3）导致深加工转厂业务的 萎缩，中断深加工链条，直接对加工贸易出口造成严重的影响。由于对深加工出口业务征税，只有在产品报关离境时才予以退税，而间接出口中间每道环节均实行征 税，这样势必造成对深加工链条长、配套要求高、附加值高的产业带来极大的影响。
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（4）不利于对从事加工贸易 业务出口货物的税收管理。对于既耗用深加工结转的进口料件，又耗用直接进口料件的复出口货物，税务部门对加工贸易的税收管理有难度。
（5）深加工结转货物在各环节的税负不均，不利于足额征收，造成企业之间、地区之间的税源转移。第一道从事进料加工的生产企业当加工的货物结转下道深加工 企业继续加工时对进口料件不能虚拟进项税额，造成第一道加工企业的税负特别高。深加工结转的复出口货物所涉及的加工环节较多（二到五个环节），有的还跨地 区，其整个税负主要集中在第一道的加工企业，此时该地区的税源就相对比较多，而最后一道报关出口的加工企业，如实行的是“免、抵、退”税办法且与第一道加 工企业又不在同一地区的，这对本地区的税源有很大的影响。
%g&# HY?1 D8 X 2、实行免税政策的利弊分析。
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利：符合35号文有关规定及其它有关管理部门的管理要求。采用免税政策，深加工结转业务不管结转多少环节，也不管是否跨地区，其中间环节均实行免税政 策。
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弊：（1）不符 合“鼓励加工贸易企业使用国产料件”的政策取向。对加工贸易深加工结转货物实行“道道免税”政策，即对加工贸易进口料件及加工费免税，对耗用国产料件所支 付的进项税额计入成本的政策，不利于加工贸易企业使用国产料件。如，江苏昆山联颖电线电缆有限公司，由于国产料件的进项税额要计入成本，促使企业不得不使 用进口料件替代国产料件，从而减少企业的负担。该司今年1—6月的总的原材料采购为1370万元，其中，进口料件就达1010万元，占总原材料的74%， 而这些进口料件在国内都有替代的国产料件。
企业表示，如果对深加工结转业务货物实行免抵退税政策，他们将改用国产料件。
（2）不利于规范加工贸易管理的方向。鉴于目前加工贸易管理中存在的诸多问题，国家批准设定了若干出口加工区，以引导加工贸易企业向出口加工区集中，逐步 规范区外加工贸易管理，由于出口加工区监管较多，约束较多，与区外加工贸易政策相比，如出口加工区无明显的优惠政策，则无法达到引导加工贸易企业向出口加 工区集中的目的。如对加工贸易深加工结转实行免税办法，则使得区外加工贸易政策更优惠于区内加工贸易政策，进而无法达到规范区外加工贸易管理的目的。实际 上变成了区外的就是一个大的“出口加工区”，这样不利于各部门对深加工结转业务的管理。
gZd*U7 ?9 _h9 T （3）不利于鼓励一般贸易出口。退税率下调后，加工贸易在税收上已比一般贸易要优惠得多，就必然更不利于一般贸易的出口和国产料件的使用。如对加工贸 易使用的进口原料免税，其加工产品在以后的各个国内加工环节都实行退（免）税，形成凡使用进口保税原料，在国内进行多次加工后出口的产品，各个环节都不负 担增值税，而使用国产原料加工的出口产品，每个环节都须按规定纳税，鼓励了出口产品使用进口料件。
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（4）不利于税务部门对深加工结转业务的管理。目前，大多数地区对深加工结转实行的是免税政策，实际上税务部门都是凭企业的帐面数、申报数来确认的， 在具体的管理上，一方面，没有深加工结转的进、出口电子信息；另一方面，也没有专门用于申请免税政策的纸质凭证，税务部门很难管理，这是一个管理的盲区。
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3、实行“免、抵、退”税政策的利弊分析。
利：一是对深加工结转实行“免、抵、退”税政策是税务管理的需要。从客观上讲，深加工结转业务，不仅符合我国加工贸易和产业发展的客观规律和要求，也有 利于我国抓住当前国际产业转移的契机，加速发展国内配套产业，全面提升产业结构，促进先进科技的高新产业在我国“落地生根”，从而更好地发挥加工贸易对国 民经济和社会发展的促进作用。从税务管理上讲，从江苏的实际情况看，从事深加工结转业务的企业，90%以上有进料加工复出口和来料加工复出口业务。如果对 深加工结转采用免税政策，对进料加工复出口实行免抵退税政策，就一个纳税人而言，就采用了两种税收管理政策，增加了税务部门的管理难度。近几年，对生产企 业出口货物全面实行免抵退税政策后，一方面，免抵退税政策的管理相对比较严密，责任明确，增值税专用发票全面实行金税工程交叉稽核比对，不会给增值税管理 造成新的漏洞；另一方面，企业和税务部门都已经适应，所以全面实行免抵退税管理的条件已具备。
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二是从总体上看，“免抵 退”税政策优于免税政策。据江苏对1018户从事深加工结转业务的企业测算，2004年1—6月，1018户企业（占全省深加工结转业务企业95%），实 现销售收入（内外销）1224亿元，其中深加工结转业务收入281亿元，占22.96%。这些企业在今年上半年对深加工结转业务均实行免税政策，按增值税 有关政策，对免税货物耗用的国产料件所支付的进项税额不予抵扣，转入产品成本。据统计，1018户企业今年上半年共分摊深加工结转货物的不予抵扣税额 6.46亿元。如果这些企业将深加工结转业务由免税政策改为免抵退税政策，一方面从事深加工结转业务的货物所耗用的国产料件的进项税额允许抵扣，另一方 面，要计算深加工结转业务货物征、退税率之差不予抵扣税额，据测算，深加工结转业务的不予抵扣税额为3.67亿元。对深加工结转业务由免税政策改为免抵退 税政策
后，有128户次企业增加税负，增加额1.50亿元，有890户次企业减少税负，减少额4.29亿元。从总体上讲净减少税负2.79亿元。
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三是免抵退税政策有利于鼓励使用国产料件。如对深加工结转业务实行免税政策，其耗用国产料件所支付的进项税额就不得抵扣，一方面计算不予抵扣的公式存 在许多弊端，往往将生产其他货物所耗用的国产料件的进项税额人为地分摊到深加工结转业务中，造成不予抵扣税额的金额偏大，加大深加工结转业务的成本。另一 方面，企业为了尽可能减少深加工结转的成本，只要在国产料件质量、价格与进口料件相同的情况下，企业会尽量选择进口料件而不使用国产料件，政策导向是鼓励 企业使用进口料件。实行免抵退税办法后，一方面，从事深加工结转业务货物所耗用的国产料件所支付的进项税额予以抵扣；另一方面，为了避免大量使用进口料 件，出现按征、退税率之差计算的不予抵扣税额转成本，造成免抵缴税的现象（据我们测算，只要出口货物中使用进口料件的成本超过72%，就会出现此情况）， 企业也会使用一部分国产料件，从而达到不缴税的目的。综上分析，免抵退税政策是鼓励企业使用国产料件，这也是我们所需要的。
弊：不利于现行的海关特定的 保税监管区域的发展，如出口加工区、海关保税物流中心等的发展。实行免抵退税后，区内外的企业和中心内外的企业税收政策基本一致，而且，在一定程度上区外 和中心外的企业的配套服务还优于区内和中心内，这样就可能降低区外加工贸易企业进入区内的积极性，从而影响其发展。
（三）税收管理政策建议。
根据上述利弊分 析，我们认为，深加工结转业务税收政策的制度与执行，不仅仅是税收政策本身问题，而且是涉及如何贯彻落实党的十六届三中全会关于“继续发展加工贸易，着力 吸引跨国公司把更大增值含量的加工制造环节转移到我国，引导加工贸易转型升级”的决定和国务院加工贸易政策的问题，同时，还涉及到商务、海关、外管等部门 的协调、统一和配合的问题，无论是征税、免税还是免抵退税都各有利弊，但利相衡取其重，弊相权取其轻，因此，在目前全国税收政策尚未明确的情况下，根据客 观管理的要求，我们建议实行免抵退税管理办法。
2 4B$ P%^2 +wn 三、实行“免、 抵、退”税办法的管理要求
一项重大政策的出台， 必然会影响到方方面面，也需要方方面面的配合和协调。深加工结转税收管理办法的统一也同样离不开与之管理相关的各个部门，如商务、海关、外汇管理等部门的 配合，只有这样，才能保证政策执行的统一和政策的严肃性。
（一）要明确深加工结转业务范围。
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为规范加工贸易深加工结转业务的健康发展，引导加工贸易企业进入出口加工区开展加工贸易，改变加工贸易企业分散、难以管理的局面，对深加工结转符合以 下条件的，可以实行免抵退税政策，否则视同内销货物处理，按增值税的有关规定征收增值税。
W%kYNOT 1、从国内购进保税进口料件的成本占销售深加工结转货物比重高于40%。根据江苏的测算，2003年以来，直接从事国外进口料件的保税成本占进料加工 复出口货物的平均比重
为67.34%，最高的达到90%以上，最低的也要在20%左右。如果低于此规定，税收上按照内销货物处理，这样迫使企业转入到出口 加工区进行加工，以便于管理。
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2、从事深加工结转业务的贸易性质，仅限于进料加工转进料加工贸易，不允许进料转来料或来料转进料以及来料转来。如果允许在不同贸易性质之间相互结 转，从税务管理来看，很难管理到位，也不利于所得税的管理。
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3、从事深加工结转业务的企业，目前江苏尚未发现有外贸企业从事深加工结转，全部在生产型企业之间结转。鉴于此情况，我们建议，不允许外贸企业从事深 加工结转业务。
（二）需要相关部门的配合。
F*Q#UD _+ Q% 1、商务部门：主要是深加工结转的审批问题。从源头上控制深加工结转业务的范围，我们意见，对外购国内保税进口料件成本比重进行限制（如40%），对 低于这个比重的建议外经贸主管部门不予审批。
6 F|4 4M8A3H9 v1 w6 C 2、海关：一是对深加工结转业务单独办手册，不能与其他手册混在一起；二是对转出企业需要签发出口报关单（出口退税专用）、转入企业签发进口报关单 （增加一联“税务联”）；三是传递相关的电子信息，包括：深加工结转业务的登记信息、手册核销信息、出口报关单信息、进口报关单信息。在进、出口报关单信 息中要含有手册号、批准文号（即核销单号）、进出口日期等字段。
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3、外汇管理：上下游 企业结转的，要对上游企业签发核销单，对实行人民币结算的，也给予签发核销单。
*+ SRq&FS9 Ka1 X （三）税务部门采取的管理措施。
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对深加工结转业务实行免抵退税管理后，总体上应按加工贸易规定，统一纳入正常的税收管理范围。具体可采取以下管理措施：
3 G5 6G1 u%1 Z+# 1、对上游企业，根据海关签发的出 口货物报关单（出口退税专用）和企业开具的出口
发票，从出口日期后的90天内，与正常直接出口业务一并向主管税务机关申报免抵退税。对上游企业从国外直接 进口保税料件或从国内转出企业购进的保税进口料件，计算免抵退税抵减额。
%|6 u$ b1Q# y/ S%aZ*M 2、对上游企业申请深加工结转业务中使用的保税进口料件，税务部门审核深加工结转的进出口电子信息后，出具“深加工结转业务免税证明”。
+ S/ WRd 3、对上游企业申请的深加工结转业务免抵退税，税务机关要依据海关传递的出口和进口的电子信息，与其他直接出口业务，一并计算审核企业当月的应退税额 和免抵退税额。对从事深加工结转业务的货物，凡实际保税进口料件的成本低于规定比例，税务部门应视同内销货物，按以下公式计算应补征的增值税：
应补增值税=深加工结转业务收入÷（1+增值税税率）—购进保税进口料件的组成计税
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