重新排列缩略图:
点击拖动缩略图,对其进行重新排列。
使用Files Pane打开一个文件:
(1) 点击文件的缩略图,在现在窗口中打开文件;
(2) 右键点击缩略图,选择Open in New Window,在新窗口中打开文件。
显示Slideshows和Animations
使用Views pane,我们可以使用Files pane中的文件来展示Animated slideshows。选用Overview Actions 菜单
。
History Pane
Crystalmaker会跟踪文件修改,并把它们显示在History Pane中。
History Pane左上侧的缩略图为用户最近打开的文件;接下来的缩略图代表按时间顺序编辑过的文件。点击缩略图,转到那个阶段的文件。
Log Pane
Overview window上的Log Pane显示了状态信息和屏幕工具的操作结果和化学键搜索结果。 用户可以把Log Pane中的信息拷贝到其他程序中。在Overview Actions 菜单
中,选择
Text Options可以对文本进行编辑。
工具面板(Tools Palette)
工具面板中的屏幕工具,可以操作、测量和编辑结构。测量工具加上旋转工具,可以对晶体进行精确位向操作。
用户可以在键盘上输入相应的字母来选择工具。 在工具面板的最上面,会显示晶体结构或单分子的彩色图片:这是显示是否在分子模式的快捷方法。分子模式用来描述原子团以及其它没有长程对称的结构。
使用工具面板
选择Window > Palettes显示工具面板。所有窗口的大小和位置都在在上次退出程序时自动保存。
设定工作台
选择Window > Workspace,在其子菜单中显示工作台。
全屏模式
Crystalmaker支持全屏模式,便于用户专注于结构。
全屏模式下,Graphics window会自动调整以适应全屏的尺寸。通过把鼠标移至屏幕的上部,用户仍然可以使用菜单命令。
进入全屏模式:
点击window toolbar或者Tools palette上的Full Screen按钮,或者快捷键F。
退出全屏模式: (1) 按Escape键;
(2) 或者点击Tools pallete中的Standard Screen,快捷键F。
在线帮助系统
Crystalmaker的在线帮助可以通过以下途径获得: (1) 选择Help菜单;
(2) 点击一些出口中左下角的Help; (3) 点击F1。
第二章 软件预览
本章分为三个连续的部分,分别介绍Crystalmaler的不同功能。第一部分我们将建立一个新的晶体结构,包括对称性和化学键。第二部分我们研究不同的显示选项,包括图形样式和不同的模型类型。最后一部分我们将使用程序中的不同工具来测量结构、显示配位团,以及以文本文件和网页的方式输出数据。
第一节 建立无机物晶体结构
本节我们介绍如何创建、显示和保存一个新的晶体结构。我们将以和其他无机物结构类似MgAl2O4为例。
结构数据
在Crystalmaker中,可以使用数据编辑器来编辑晶体常数、对称性以及位置坐标。同时还可以编辑颜色、原子半径,定义化学键等。 使用以下结构数据:
输入结构数据
(1) 选择File > New Crystal命令; (2) 出现以下Edit Crystal对话框:
(3) 在Spacegroup栏中输入以下字符: F d 3 m [origin 2]
(字符间留空格)。如果输入格式错误,Crystalmaker会提醒用户。
如果空间群符号输入正确,只有一个晶格常数会保留。Crystalmaker识别出输入的空间群符号对应一个立方晶体,并且只需要a单胞参数。 (4) 按Tab键移至a栏,输入8.08,对话框如下:
(5) 现在我们需要考虑晶体的非对称基元中的三个位置,对于每个位置,Crystalmaker需要以下信息:
位置标注(最多六位字符,字符间不能有空格);
一个或多个化学符号以及它们的占位率值(Crystalmaker使用元素符号来决定其原子半径和原子颜色;元素符号可以是一个或两个字母);