有关科目，在会计确认方面减少职业判断，在会计计量上使用历史成本，资产持有期间发生的资产增值和减值都不进行账项调整。而《小企业会计制度》要求对短期投资、存货及应收款项计提减值准备，不要求对固定资产、无形资产等长期资产计提减值准备。这一方法与所得税法中对资产损失的认定存在差异，因而形成了会计所得与纳税所得之间的暂时性差异，需在申报纳税时进行调整。
（2）金融资产核算简化，短期投资持有期间所收到的股利、利息等，均在约定付息日确认投资收益，不再冲减投资成本处理。
（3）新准则存货计价取消发出存货后进先出法，而原制度采用后进先出法对发出存货计价。
（4）新准则下，固定资产的折旧和后续支出与税法一致。规定了与所得税法相一致的固定资产计提折旧最低年限以及后续支出的会计处理方法。无形资产摊销期限的确定也应当考虑税法的规定。而原制度没有提及。
新准则统一采用直线法摊销债券的折价或者溢价。
新准则长期股权投资统一采用成本法核算。取消原制度的权益法核算。
新准则规定对盘亏盘盈资产均要通过“待处理财产损溢”科目核算。
2．负债确认与计量的比较。
主要不同有：（1）新准则规定负债要求以实际发生额入账，利息计算统一采用票面利率或合同利率。（2）减少预提会计方法的使用。（3）扩大了应付职工薪酬核算的范围。（4）不预计负债；对于尚未实际发生的事项，如产品保修形成的预计负债等都不提前预计，而是在实际发生时再进行确认和记录。
3．所有者权益确认与计量的比较。
主要不同有：（1）《小企业会计准则》规定，资本公积仅包括资本溢价(或股本溢价)，是指小企业收到的投资者出资额超过其在注册资本或股本中所占份额的部分。而《小企业会计制度》规定资本公积的核算内容包括资本溢价、接受捐赠非现金资产准备、外币资本折算差额和其他资本公积。（2）新准则不允许计提法定公益金；而原制度可以计提法定公益金。
4．收入确认与计量的比较。
主要不同有：新准则不再要求遵循实质重于形式的原则，而是采用发出货物和收取款项作为收入确认的标准，减少关于风险报酬转移的职业判断，同时就几种常见的销售方式明确规定了收入确认的时点。在收入计量方面，不再要求小企业按照从购买方已收或应收的合同或协议价款或者应收的合同或协议价款的公允价值确定收入的金额，而是要求按照从购买方已收或应收的合同或协议价款确定收入的金额。
5．成本费用确认与计量的比较。
主要不同有：《小企业会计准则》要求企业采用应付税款法核算所得税，将计算的应交所得税确认为所得税费用，这大大简化了所得税的会计处理。《小企业会计准则》与企业所得税法中允许扣除的资产损失界定标准基本相同，消除了原本小企业存在的会计所得与纳税所得的差异，需要小企业进行纳税调整的交易或事项较少。
6．新准则取消了外币财务报表折算差额。
《小企业会计准则》要求小企业对外币财务报表进行折算时，应当采用资产负债表日的即期汇率对外币资产负债表、利润表和现金流量表的所有项目进行折算。这样，小企业既不会产生外币财务报表折算差额，也减少了外币财务报表折算的工作量。