DNA甲基化的生物信息学研究进展(11)

2021-04-06 00:55

aprt gene promoter is to block epigenetic gene inactivation 1998(22)

44.Fan S.Fang F.Zhang X Putative zinc finger protein binding sites are over-represented in theboundaries of methylation-resistant CpG islands in the human genome 2007(11)45.Issa J P Aging,DNA methylation and cancer 1999(1)

46.Jones P A.Baylin S B The fundamental role ofepigenefic events in cancer 2002(6)

47.Ordway J M.Budiman M A.Korshunova Y Identification of novel high-frequency DNA methylationchanges in breast cancer 2007(12)

48.Piotrowski A.Benetkiewicz M.Menzel U Microarray-hased survey of CpG islands identifies concurrenthyper-andhypomethylation patterns in tissues derived from patients with breast cancer 2006(7)49.Keshet I.Schlesinger Y.Farkash S Evidence for an instructive mechanism of de novo methylation incancer cells 2006(2)

50.Gebhard C.Schwarzfischer L.Pham T H Genome-wide profiling of CpG methylation identifies noveltargets of aberrant hypermethylation in myeloid leukemia 2006(12)

51.JIAN YU.HONG YU ZHANG.ZHEN ZHONG MA.WEI Lu.YI FEI WANG.JINGDE ZHU Methylation profiling of twentyfour genes and the concordant methylation behaviours of nineteen genes that may contribute tohepatocellular carcinogenesis[期刊论文]-细胞研究(英文版) 2003(5)

52.Zhang C Y.Man L.Li L Promoter methylation as a common mechanism for inactivating E-cadherin inhuman salivary gland adenoid cystic carcinoma 2007(1)

53.Yang H J.Liu V W.Wang Y Differential DNA methylation profiles in gynecological cancers andcorrelation with clinicopathological data 2006

54.Tamaru H.Selker E U A histone H3 methyltransferase controls DNA methylation in Neurospora crassa2001(6861)

55.Jackson J P.Lindroth A M.Cao X Control of CpNpG DNA methylation by the KRYPTONITE histone H3methyltransferase 2002(6880)

56.Jaenisch R.Bird A Epigenetic regulation of gene expression:how the genome integrates intrinsicand environmental signals 2003(Suppl)

57.Lehnertz B.Ueda Y.Derijck A A Suv39h-mediated histone H3 lysine 9 methylation directs DNAmethylation to major satellite repeats at pericentric heterochromatin 2003(14)

58.Li X.Wang X.He K High-resolution mapping of epigenetic modifications of the rice genome uncoversinterplay between DNA methylation,histone methylation,and gene expression 2008(2)

相似文献(1条)

1.学位论文 何坤 高等植物光形态建成过程中基因调控的生物信息学分析——转录调控及表观遗传调控分析 2006

转录调控(tanscriptionalregulation)和表观遗传调控(epigeneticregulation)是真核生物基因调控的两种主要途径。本论文的工作内容为:利用生物信息学手段分析生物实验室提供的数据分别对上述两种调控机制进行研究。 利用结构域搜索并结合文献检索,预测了拟南芥基因组共1826个转录因子,为拟南芥转录因子的重大国际合作项目提供了基因克隆的基本信息;同时结合核酸和蛋白质序列、结构以及拟南芥基因组等公共数据库信息,构建了拟南芥转录因子数据库,提供友好方便的使用界面和全面丰富的注释信息。通过对拟南芥和水稻MYB家族361个转录因子进行深入的系统发育分析,为MYB家族成员的克隆以及进化和功能分化提供了重要线索。 由于覆瓦式芯片(tilingarray)结果目前还没有可以直接使用的分析软件,本文基于统计学软件R和Perl语言,开发了适用于覆瓦式芯片数据的软件包,并用该软件成功对以下两类芯片数据进行了分析:第一类是基于拟南芥全基因组覆瓦式芯片进行免疫共沉淀芯片(ChIP-chip)实验来确定拟南芥幼苗bZIP(basicleucinezipper,碱性亮氨酸拉链)转录因子家族成员HY5光调控下结合位点的数据;第二类是利用覆瓦式芯片技术,分别对拟南芥光照和黑暗状态下6天期幼苗组蛋白H3亚基第9位赖氨酸双甲基化(H3K9Me2)、乙酰化(H3K9Ac)修饰,水稻悬浮培养细胞以及光照和黑暗状态下幼苗组蛋白H3亚基第4位赖氨酸上双甲基化(H3K4Me2)、三甲基化(H3K4Me3)和DNA甲基化修饰进行研究的数据。该软件包具有良好的平台移植性,且提供可调参数,可用于其它各种物种全基因组覆瓦式芯片结果。 对第一类数据分析发现,HY5的结合位点


DNA甲基化的生物信息学研究进展(11).doc 将本文的Word文档下载到电脑 下载失败或者文档不完整,请联系客服人员解决!

下一篇:人事廉政风险点防范措施

相关阅读
本类排行
× 注册会员免费下载(下载后可以自由复制和排版)

马上注册会员

注:下载文档有可能“只有目录或者内容不全”等情况,请下载之前注意辨别,如果您已付费且无法下载或内容有问题,请联系我们协助你处理。
微信: QQ: