其实质是对学校之间除教育质量以外的其他初始差异进行统计控制，通过多元回归分析，计算出各种初始差异对学校成就的贡献，得出各初始差异的预测方程，然后，再在学校的实际观察成就中排除由初始差异预测方程所估计出来的预测成就，其剩余的部分（又称残差（residuals）就是学校的效能。在这种情况下，学校效能被操作化定义为:观察到的（实际的）学校平均分与基于这些特征预测的平均分之间的差异（即回归残差）。这些残差提供了识别“异常者（outfiers）"的基础。
这一方法的局限性表现在以下三个方面:
a.在统计控制中，因为缺乏广泛的学生成就因果模型，所以可能会忽略一些重要的变量，预测方程不能包含所有的相关变量。此外，由于测量方法或逻辑上的困难，也会丢失一些重要的变量，这会降低统计控制的效果，导致对学校效能的估计偏差。
b.按照定义，学校的效能估计就是预测等式的残差，这不是一个衡量学校效能的绝对标准，而只是一个相对标准，一个学校是否有效，会受到与之比较的学校情况的影响。因此，“附加值”估计只能作为一种用来识别“异常者”的初筛工具，而不能用来定义学校的效能。它不能准确描述学校能做什么。以“附加值”来判断学校改进也存在同样的问题。
c.目前所采用的统计控制方法大多使用了学校总体的社会经济特征（SES）来估计预测成就，对其他影响成就因素的变量的控制还很不够。因此，这种方法在很大程度上难以反映真实的学校贡献情况。
②采用校内设计来估计学校效能的方法
这种方法将学校效能定义为:同一学校某组学生在连续两个年级之间的成绩增长（即在x年级与x-1年级的成绩差）。由于学生是同一组，因此，学生特征是恒定的，只需要考虑学校的影响和学生自然成熟及年龄相关因素的影响，这种方法要求使用同一成就测量工具，在连续两个年级，对同一组学生进行两次测量，同时采用“年级间”准实验回归非连续设计。这种设计有两个主要特点:第一，学生分配到出生日期是随机的;第二，年级水平是惟一的年龄囚素。
这种方法将学生的成绩增长分解为两部分，即一年的年龄成长和一年的学校教学。年龄的效果以同年级内学生测验分数在生理年龄上的回归来表不，学校学习的效果以两个年级的年龄回归线之间的非连续性表不，如图所示。
图
这种方法的优势在于，采用校内设计方法来估计学校效能，克服了以学校之间的相对比较来确定学校效能的缺陷，其所定义的学校效能具有实质性含义，它能够说明学生取得进步的实际情