困惑之九：校企双方文化的冲突。企业文化与校园文化是两种不同性质的文化类别，在校企合作中，学校文化和企业文化必然会存在一些碰撞，有时还产生学校和企业间的摩擦、碰撞与冲突，甚至还会出现工作上的不协调、排斥、堵塞现象，导致合作后并未发挥协同效应，制约校企合作的发展。如何将两种文化的碰撞力，更好地转变为推进校企合作、促进学校发展和学生成长的持续动力，如何处理好文化的融合和贯通问题，关系到校企合作办学的文化内质，因此，合理控制校企文化融合的“度”与“量”成为关键
困惑之十：理论研究的困惑。我国对高职教育校企合作的理论研究才刚刚起步，理论研究基础薄弱。杭职院建校时间短，青年教师居多，科研力量薄弱，学校多年来对高职教育理论研究不够重视，缺乏对校企合作理论研究的氛围，当校企合作实践环节出现问题时，缺乏运用理论解决问题的依据，理论研究相对滞后。诸如对校企合作的内容研究、现状研究、比较研究、发展定位研究、实现途径研究、主体行为研究、共性与特性研究、评价标准研究方面，以及在校企合作过程中，经济社会的发展、社会的要求等方面的相关研究基本处于初级阶段，定性研究较少，定量研究就更少，因此理论层面的研究亟待加强。
困惑之十一：办学特色的困惑。高职院校的办学特色是指高职院校在长期的办学实践中，逐步形成的具有优于其他院校的稳定的特性、办学风格和发展模式。目前，高职高专人才培养的评估标准特别重视“特色”，所以学校都苦苦追求办学特色，“为了特色而特色”，
大家因“特色”而困惑。校企合作也不例外，大家对校企合作教育的典型特色重视有余，而对其产生的条件和原本内涵认识不足。其实校企合作的特色并不神秘，高职院校只要抓住了高职教育校企合作的本质，贴紧地方经济和区域经济，贴紧行业和市场，严格按照高职教育规律办学，自然就形成了自己的特色。
困惑之十二：典型引路的困惑。校企合作需要高质量的典型引路，在普遍研究的基础上抽取共性，建立具典型意义的不同类型的校企合作模式，使各校各专业共享成型的经验，是教育水平共同提高的要求，也是推动总体经济发展的要求。现阶段相当多的学校校企合作的工作还做得很不够，基本现状是分散、孤立、量少的，能起示范和推广作用的典型数量不多，从而影响了校企合作总体水平的提高和实施效果。目前迫切需要解决的问题是总结成功的经验，为其他学校提供示范和参考。
本章小结：