类假冒商标、侵犯专利权等违法行为，通过扩大跨部门联合执法和跨地区联合执法的范围和效能，努力从源头上切断侵权产品进入流通领域的途径。知识产权保护秩序作为主要内容，以整体提高区域知识产权保护水平。
2.斩断执法人员与侵权人的不正当关系
个别执法人员与本地部分侵权行为人有千丝万屡的联系，并成为影响地区协同执法的主要因素之一，因此，必须斩断个别执法人员与侵权行为人的各种不正当关系，保证地区之间协同执法的顺利进行。具体来说，我们可以从以下两个方面着手:
其一，严格贯彻落实《国家公务员法》，杜绝地方执法人员以任何形式向企业参资入股，己参资入股者必须撤资退股;
其二，严格实行执法回避制度，执法人员在执法过程中如遇到相对人为自己近亲属或与自己有利害关系者应当主动提出回避，不得参与案件的执法。
3.加强“阳光执法”
地方保护主义常伴有“暗箱操作下进行，”行为，为此，行政机关应当加强执法的透明度，使一切执法行为在“阳光”不给地方保护主义任何机会。一般来说，可以从三个方面采取措施加强“阳光执法”活动:
其一，是行政执法机关自身的政务公开，例如，通过行政机关政务网、门前宣传栏等形式公开;
其二，行政机关在执法过程中可以邀请国家级或其他地方的行业协会或社会团体的参与;
其三，加强异地媒体对案件执法情况的全程报导，使全社会对案件的执法情况都能够有清楚的认识。加强“阳光执法”，可以有效的防止“暗箱操作”行为，客观上也有利于打击地方保护主义。
(五)建立知识产权行政保护与司法保护的联动机制
我国自知识产权制度建立以来，对其保护就实行“双轨制”，即行政保护与司法保护。两种保护方式各有优点，也各自存在不足:行政保护具有主动、高效、专业等优势的一面，也存在保护主体模糊、
执法力度不强、地方保护主义盛行等不足的一面;司法保护具有程序严格的优点，但同时也存在废时废力、效率低下的缺点。所以，行政保护和司法保护二者应当相互配合、各司其职，发挥各自的优势。然而，目前我国知识产权保护中行政保护手劝段和司法保护手段在配合上还存在一些漏洞，突出的表现在行政权力过于庞大，一定程度上排挤了司法权的介入，证据转化规则的缺失等，在解决这两个问题时，我们应当根据司法权与行政权的法理关系、根据法律实践中的现实情况建立知识产权行政保护与司法保护的联动机制:
1.依法移送案件、杜绝“以罚代刑”
在入世前，我国知识产权行政机关“以罚代刑”的现象比较多，行政权力过于膨胀，造成许多本该移送司法机关追究侵权人刑事责任的案件而被行政机关简单进行行政处罚了事，致使国际上许多国家对我国知识产权保护水平提出很大疑义。自2001年以来，国家和地方知识产权行政执法与刑事执法的协作和衔接机制逐步建立，形成了层次丰富、形式多样的知识产权执法工作模式，开创了知识产权执法保护的新格局。
2.建立完善的证据转化规则
行政执法机关在处理具体的知识产权侵权案件当中，可根据涉案金额的多少、案件的危害程度决定是否请求公安机关提前介入，建立以公安机关为主、行政机关为辅的证据搜集机制。同时，依照《刑事诉讼法》第45条，人民法院、人民检察院和公安机关有权向有关单位和个人收集、调取证据，有关单位和个人应当如实提供证据，由此可将行政证据作为司法执法中收集的证据，实现从行政证据到刑事证据的转化。其中，实物证据如书证、物证、视听资料等“与言词证据相比，其最突出的特点是客观性、稳定性强，不易失真，受人的主观因素影响的程度较小”，可以直接转化为刑事证据;对于行政执法过程中制作的证人证言、谈话笔录等言词证据材料，“一般应要求重新提取后才可以使用，这样也有利于法庭审理、质证的顺利进行”。确因不可抗力导致无法再次取证，经审查能与其它证据相互印证的，可作为刑事证据使用。
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