二代测序RRBS
b. 构建sgRNA载体—单载体系统(pSpCas9(BB)-2A-GFP)。
首先,按照前述方法target site确定,根据target site设计需插入的sgRNA Oligo。
一般来说,sgRNA oligo的形式如下:
sgRNA top: CACCgNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
sgRNA bottom: AAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNc
两条设计好的oligo需经磷酸化,退火成双链,其体系如下:
程序如下:37 °C 30 min; 95 °C 5 min; 每分钟降5 °C 至25 °C。
结束后按照1:200加水稀释(1ul oligo+199 H2O)
其次,将合成好的sgRNA oligo插入到目的载体中,本实验将使用pSpCas9(BB)-2A-GFP。其连接反应体系如下: