CRISPR-Cas9体系实验流程 (2)(6)

2020-12-24 22:47

二代测序RRBS

方法均与前述方法一致。验证质粒构建正确后则可进行后续转染细胞实验。

通用pUC19测序引物:(只选一端用于测序即可)

pUC-Fwd - M13:GTAAAACGACGGCCAGT

pUC-Rev - M13:CAGGAAACAGCTGTAAC

3)转染KYSE150等细胞。

首先培养细胞至汇合度70-90%。转染可利用Lipofectamine 2000 (Invitrogen),依照说明书进行转染。

转染方案如下:

稳转:

可先转染cas9,得到其稳转株。其筛选流程如下,待按照lipo2000说明书转染后,2-3d,收细胞,计数,将细胞稀释。60cells稀释在12ml培养基中,然后将这12ml培养基接种到96孔板中。待长成克隆,观察绿色荧光即可。或者直接进行流式单细胞分选,分选后的细胞分种到96孔板,待长成克隆。

单载体系统稳转可参照上述方法。

瞬转:依旧是参照说明书,转染后48-72小时收细胞,转染效率可参照GFP荧光信号,同时可进行WB或者qRT检测。

需注意的是sgRNA PCR产物的转染,其体系如下:

注:本实验中Cas9将选用pSpCas9(BB)-2A-GFP,含有GFP标签。


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