可能影响东江水质的污染源，强化重点风险源监督管理，确保东江水质安全。加大水源地流域综合整治力度，整治、搬迁和关闭流域内威胁饮用水源的重点污染源，严厉打击违法排污行为。加强水库型饮用水源环境风险排查和环境整治，加大对入库河流的治理和管控力度，加强对南水水库、高州水库、鹤地水库等富营养化和蓝藻水华生态修复。加强地下水水质保护，加快备用水源和供水应急机制建设，强化饮用水源地环境监管及应急能力建设。2015年，全省城市集中式饮用水源水质达标率稳定在95%以上，其中粤北山区保持100%达标率。
3．深入推进重点流域环境整治。
强化重点水环境污染综合整治，珠江三角洲地区重点抓好淡水河、石马河、前山河、佛山水道、市桥水道、珠江广州河段、深圳河、独水河、巴江等流域的综合整治工作，整治流域内电镀、印染、制革等重污染型和劳动密集型产业，加大截污管网和污水集中处理设施建设力度；加大畜禽养殖和面源污染治理力度，2012年前关停畜禽禁养区内所有养殖场，2015年前全面清退流域内畜禽养殖企业。粤东地区重点抓好练江、枫江流域污染治理工作，及时关闭流域内不符合功能区划和产业布局要求的污染企业；加快推进污水处理设施及配套管网建设，2012年练江、枫江干流两岸中心镇均建成生活污水处理设施，生活污水处理率达60%以上。粤西地区重点加强小东江流域和漠阳江流域的污染防治，湛江、茂名市要联合制订小东江水质达标方案，依法取缔违法违规的小炼油、小造纸企业和畜禽养殖场；加快污水处理设施建设，推进截污、疏浚、补水、景观生态改造等工程，改善水环境，到2015年，小东江水质恢复到Ⅳ类。
4．持续推进污水处理设施建设。
优先完善现有污水处理设施的配套管网，加快在建污水处理设施建设步伐，积极推进中心镇和水源保护区周边、重要江河沿线建制镇的污水处理设施建设，强化污水处理厂脱氮除磷效果，提高生活源氨氮等污染物去除效率。到2015年，全省废污水排放总量控制在100亿吨以内，城镇污水集中处理能力达2200万吨/日以上，新增污水管网1.5万公里以上，管网覆盖率达75%以上，城镇生活污水处理率达80%。完善污水处理厂在线监控系统联网，加强对污水处理厂的环境监管，确保污水处理设施稳定运行。
珠江三角洲地区全面提高管网覆盖率和污水收集率，到2012年，争取镇镇建成污水处理设施；到2015年，珠江三角洲地区城区基本实现污水收集管网全覆盖，新增污水处理能力340万吨/日，城镇生活污水处理率达到90%以上。粤东西北地区重点完善“一县一厂”配套管网，推进水源保护区、重要生态敏感区周边城镇的污水处理设施建设。新丰江水库、枫树坝水库、飞来峡水库、南水水库、高州水库、鹤地水库等重要水库库区和东江、西江、北江、韩江、鉴江、漠阳江干流及其重要一级支流沿河的镇建成污水处理设施。到2015年，粤东西北地区分别新增污水处理能力80万吨/日、45万吨/日和60万吨/日，城镇生活污水处理率达到65%以上。
5．加强海洋水污染防治。
贯彻实施广东省碧海行动计划，加大入海水道及入海口的污染综合整治力度。加大重点河口和海湾水污染防治力度，积极开展河口和海湾生态修复技术示范工程。开展珠江口等重点海域环境容量评估，大力实施重点海域污染物入海总量控制制度。加强对陆源污染排海项目、海岸和海洋工程建设项目的监督管理。
加强沿海地区非点源污染综合治理，推进水产养殖向生态养殖转变，减少海水养殖饵料对养殖水域的污染。推进海洋环境质量监测网络建设，推进监测点位的全面化与监测领域的全覆盖，加强对船舶、舰艇、石油平台及其相关活动的环境监督管理，加强海上溢油、有毒化学品泄漏等污染事故应急处置能力建设，加强海洋灾害预警与应急系统建设。
（二）联防联控，改善大气环境质量。
1．强化珠江三角洲区域复合污染治理。
完善统一规划、统一监测、统一监管、统一评估、统一协调的珠江三角洲区域大气污染联防联治机制，推进实施珠江三角洲清洁空气行动计划，督促区域内各市承担共同但有区别的责任，共同推进珠江三角洲地区大气污染治理。完善区域空气质量评价体系，全面开展臭氧和细颗粒物等污染物监测，并纳入空气质量评价体系。在珠江三角洲地区率先建立与国际接轨的大气复合污染监测和评价方法，构建大气污染综合防治体系。力争到2015年，珠江三角洲地区酸雨污染明显降低，大气灰霾现象明显改善。
2．持续推进电力行业污染减排。
继续加强电力行业脱硫工程建设。新建燃煤机组必须配套建设脱硫设施，综合脱硫率达95%以上。尚未实施脱硫改造的热电联产机组应配套烟气脱硫设施，鼓励燃油电厂实施“油改气”工程。已投运脱硫设施应取消烟气旁道或实施技术更新改造，确保综合脱硫率达90%以上。加强火电厂烟气在线监控管理，确保稳定达标排放。
全面推进电力行业降氮脱硝。新建燃煤机组全部配套建设脱硝设施，脱硝效率达80%以上；全省12.5万千瓦以上燃煤机组全部建成降氮脱硝设施，综合脱硝效率达70%以上；12.5万千瓦以下（不含本数）燃煤机组实行低氮燃烧改造，并确保达标排放；燃油机组优先选择改用燃气，2014年底前仍在役的燃油机组必须完成降氮脱硝设施改造，实现达标排放。珠江三角洲地区2012年底前完成区域内30万千瓦以上燃煤机组降氮脱硝工程改造；2013年底前完成区域内30万千瓦以下（不含本数）、12.5万千瓦以上燃煤机组降氮脱硝工程改造。其他地区2013年底前完成区域内60万千瓦以上燃煤机组降氮脱硝工程改造；2014年底前完成区域内60万千瓦以下（不含本数）、12.5万千瓦以上燃煤机组降氮脱硝工程改造。
3．强化工业锅炉污染整治。
禁止高污染型锅炉投入使用，新建大中型燃煤锅炉应安装脱硫脱硝设施，在用工业锅炉必须符合排放限值强制性标准要求。加快小锅炉淘汰力度，珠江三角洲地区（山区县除外）力争2012年底前淘汰所有4蒸吨/小时以下和使用8年以上的10蒸吨/小时以下燃煤、燃重油和燃木材工业锅炉，其他地区2015年底前完成淘汰任务。强化工业锅炉治理，到2015年，不符合排放限值强制性标准要求的10蒸吨/小时以上和使用不足8年的10蒸吨/小时以下（不含本数）工业锅炉应改造为节能环保燃烧方式、改燃清洁能源或建设高效除尘脱硫设施，确保稳定达标排放；35蒸吨/小时以上的现有燃煤锅炉安装低氮燃烧设施。1蒸吨/小时以下锅炉鼓励使用电锅炉。推进在线监测系统建设，20蒸吨/小时以上工业燃煤锅炉要安装烟气在线监控装置，并与当地环保部门联网。
4．加大重点行业污染治理力度。
加强工业窑炉烟气二氧化硫治理，现有石油炼化设备、有色金属冶炼设备、建材窑炉、炼焦炉等应安装烟气脱硫设施。全面推动钢铁行业烧结机烟气脱硫，新建烧结机应配套烟气脱硫脱硝设施，对单台烧结面积90平方米以上的现役烧结机及有条件的现役球团生产设备实施烟气脱硫，鼓励单台烧结面积180平方米以上的烧结机实施烟气脱硝。以规模大于2000吨熟料/日的新型干法水泥窑为重点，在水泥行业推行低氮燃烧技术，鼓励实施烟气脱硝。所有建材窑炉及未采用静电除尘器的现役烧结（球团）设备应加装高效除尘设施。
5．提高机动车污染防治水平。
提高新车准入门槛，全面实施机动车国Ⅳ排放标准和摩托车国Ⅲ排放标准，依法禁止不符合相应标准的汽车和摩托车办理登记和转入手续。提升车用燃油品质，珠江三角洲地区全面供应粤Ⅳ车用燃油，其他地区逐步供应粤Ⅳ车用燃油。加快淘汰高排放车辆，珠江三角洲地区争取2015年底前淘汰全部“黄标车”。全面开展油气回收治理，2011年底前珠江三角洲地区完成所有加油站、油罐车和储油库的油气综合治理及验收，2012年底前其他地区完成油气综合治理任务。加强机动车环保标志管理，加快机动车工况排气检测线建设，严格执行机动车排气污染道路抽检、停放地抽检及定期检测制度。建立机动车排气监督管理信息网络体系。加大清洁能源汽车的推广使用力度，加快建设城际快速轨道交通系统。
6．加强挥发性有机物（VOCs）污染控制。