一、检测流程
①富集白细胞样本。样本处理方法可参照一、(一)至(五)中的内容。
②将待测样本、质控加入到试剂中,上机,编辑样本名称并选择基因型。某一批次的试剂第一次检测时,须加质控用于设定参数,之后的检测不需要再加质控。选择基因型时,样本选择相应的基因型,质控选择“通用”
③设备运行检测。
④根据质控的St值关系,计算出ΔSt,依据“三、1”的内容,进行MaxSt差值上限与MinSt差值下限(在博奥客户端中,此二项为ΔSt上限、ΔSt下限)的设定。必要时,修正St值上限与St值下限等参数。
⑤重新加载实验数据文件,进行结果的判定。
(一) 可检测样本
1、血液样本:2-3ml静脉全血(不需空腹),使用一次性真空抽血管(EDTA抗凝紫帽管)采集,于4℃或-20℃低温保存,保存时间不宜超过24h。
2、组织样本:样本量大于0.3g(约黄豆大小),普通肌肉或肠胃黏膜等组织样本均可。使用石蜡或其他染色液处理的样本需要清除包埋剂或染色液。
3、纯化的基因组。
(二) 试剂与器材准备
1.商品名:耀金保;用于在进行SNP分析前对血液、组织标本的保存。
2.商品名:耀金分/耀金染;用于荧光染色原位杂交及染色体核型分析、化学药物用药指导时的样本分析。 3. 10×NH4Cl预处理液。处理血液样本时用于裂解红细胞。
4. 1×NH4Cl。使用注射用灭菌水,按照注射用灭菌水:预处理液=1:9的比例,将预处理液10×NH4Cl稀释为1×NH4Cl,备用。
5. 1000ul、200ul、2.5ul移液枪及枪尖,1.5ml离心管(灭菌)。
6.液氮。用于组织样本处理。
7.陶瓷研钵、研棒。用于组织样本的处理。 8.注射用灭菌水。
(三) 样本处理方法—从血液样本中富集白细胞
1.对用EDTA抗凝管采集到的临床全血样本进行编号(年、月、日、患者编号),上下颠倒混匀;取若干1.5ml离心管,并在管盖上编写序号,与抗凝管上编号一致。
2.在1.5ml离心管中加入1.2mL 1×NH4Cl预处理液。
3.取150ul混匀的临床全血,加入对应编号的1×NH4Cl预处理液离心管中。
4.上下颠倒10次,室温静置5min,此时1×NH4Cl裂解红细胞。血样与1×NH4Cl混匀后,液体颜色会逐渐变为澄清的红色。
5.室温3000rpm (或500-700g)离心5min,将上层透明红色液体吸取干净,注意避免吸走沉淀在管底的白细胞。
注:离心后管底部可见约2×2mm的白细胞沉淀,如白细胞团过小,须重复2-5步骤。
6.加入1mL1×NH4Cl(或生理盐水)彻底重悬白细胞,室温3000rpm (或500-700g)离心5min,将上层液体吸干净,注意避免吸走管底白细胞。
7.向富集有白细胞的离心管中加入50ul耀金保,反复吹打混匀。 8.室温静置20-30min,期间颠倒混匀2次,待检测。
(四)样本处理方法—组织样本处理
1.在洁净的陶瓷研钵中加入待处理组织样本,加入足量液氮。 2.使用陶瓷研棒将组织样本研磨破碎,尽量破碎组织样本的细胞结构。
3.向研钵中加入100ul耀金保,使用研棒搅动以溶解破碎的样本。 4.将溶有样本的耀金保吸取到1.5ml离心管中,待检测。
(五)样本处理方法—纯化的基因组
纯化的基因组不需要进行预处理,也不需要使用耀金保保存。可以直接加入到试剂中进行检测。 (六) 上样
1、根据需要检测的基因位点,取出相应耀金分/耀金染试剂,并将样本编号标注在试剂管盖上;如果试剂粘附在管壁或者上盖,需要离心,保证检测体系完整。
2、向相应编号的耀金分试剂中加入1.5ul处理后的白细胞样本(加样时应再次混匀,枪头在管内液体中间吸足样本,加入量过少会直接影响结果);