脉冲场凝胶电泳(4)

2019-01-27 12:24

将20克SDS 小心加入装有80 ml灭菌纯水的容器中,在35°- 45℃轻轻混匀溶解,定容至100ml 。

5、20 mg/ml 蛋白酶K 储存液*

100 mg Proteinase K 粉末溶于5 ml 灭菌纯水中,混匀,分装在1.5 ml离心管中,每管

500-600 μl ,-20℃保存备用。 6、10X Tris- 0.9 M Tris base (108 g 0.9 M Boric Acid (55 g

0.02 M EDTA, pH 8.0 (40 ml 0.5 M 溶于1000 ml灭菌的纯水中,高压灭菌 注意:如果缓冲液有沉淀生成必须丢弃。 7、Ethidium Bromide(EB*

10 mg/ml EB的储存液用纯水1:10,000 稀释(即100 ml水中加入10 μl 储存液 ,(500ml水中加50ul 。稀释液在丢弃前可以染5-6块胶。

实验试剂

注意:用灭菌的玻璃制品、塑料制品和纯水来制备以下试剂。

1、Tris:EDTA Buffer (TE, pH 8.0*-(10 mM Tris-HCL:1 mM EDTA , pH 8.0 10 ml 1 M Tris-HCL, pH 8.0 2 ml 0.5 M EDTA, pH 8.0

用灭菌的纯水稀释到1000 ml

在E. coli O157:H7, Salmonella and Shigella sonnei, and Campylobacter jejuni PFGE -用TE Buffer 于:

⑴. 溶解1% SeaKem Gold:1% SDS agarose ⑵. 细菌裂解后洗胶块

在L. monocytogenes PFGE -用TE Buffer于: ⑴. 悬浮菌细胞 ⑵. 细菌裂解后洗胶块

2、Cell Suspension Buffer (CS-100 mM Tris-HCl:100 mM EDTA, pH 8.0 用于E. coli O157:H7, Salmonella, and Shigella sonnei PFGE 10 ml 1 M Tris-HCl, pH 8.0 20 ml 0.5 M EDTA, pH 8.0 用灭菌的纯水稀释到100 ml

3、Cell Lysis Buffer(CLB-50 mM Tris-HCl:50 mM EDTA, pH 8.0 + 1% N-Lauroyl-Sarcosine,

Sodium salt (Sarcosyl,0.1mg/ml Proteinase K (用前再加入

用于裂解E. coli O157:H7, Salmonella, Shigella sonnei,和 Campylobacter jejuni 25 ml 1 M Tris-HCl, pH 8.0

50 ml 0.5 M EDTA, pH 8.0 50 ml 10% Sarcosyl 3

用灭菌的纯水稀释到500 ml,每5 ml CLB加入25μl 蛋白酶K 储存液(20 mg/ml,使其终浓度为0.1 mg/ml.

5、0.5X TBE Buffer

200 ml 5X TBE用纯水稀释到2000 ml或 100 ml 10X TBE用纯水稀释到2000 ml

注意:用来稀释5X TBE、10X TBE的纯水可以不灭菌。 6、SeaKem Gold Agarose -做胶块; -电泳胶

报价 seakem gold 琼脂糖 25g 货号50111,1567元人民币。可打9折。 125g 货号 50150 ,BMA , 6422元。 7、无菌的超纯水

8、蛋白酶K 粉末或蛋白酶K 溶液(20mg/ml 6、限制性内切酶

E. coli O157:H7, Salmonella, Shigella sonnei -XbaI, ,AvrII (同切限制内切酶BlnI ,SpeI (NotI可用于S. sonnei;但不用于E. coli O157:H7 L. monocytogenes,-AscI, ApaI

Campylobacter jejuni, C. coli,-SmaI, KpnI 器 材

1、Dade Microscan Turbidity Meter Spectrophotometer

bioMérieux Vitek Colorimeter -调整细胞悬浊液的浓度 2、微波炉-溶胶 3、水浴摇床

-裂解胶块中的细胞(54℃ -用水和TE(50℃ 洗胶块

4、56℃水浴箱-平衡和保温熔化的胶 5、25℃, 30℃, 37℃水浴箱-酶切

6、50℃水浴箱-加热用于洗胶块的水和TE ,酶切 7、离心机。

8、最少需要两个水浴箱-一个平衡到56℃,另一个到37℃。如果需要,温度可以上下调动。Listeria PFGE中胶块的ApaI 酶切需30℃水浴。

耗 材

1、无菌的Falcon 2054(12-mm x 75-mm或Falcon 2057(17-mm x 100-mm-用于细胞悬浊液的制备

基因公司代理 ,

2、无菌的聚酯纤维或棉签-用于从琼脂平板上刮取细菌

3、无菌的枪头或巴斯得吸管

4、无菌的1.5 ml离心管-用于混合细胞悬浊液和胶、酶切

5、无菌的50 ml screw-cap tubes 或50 ml Oak Ridge tubes -用于装胶块, 6、Green Screened Caps(Bio-Rad 1703711-洗胶块时用伯乐公司 货号 170-3711。

7、模具

-10孔(可重复利用的,2cm x 1cm x 1.5mm -50孔(一次性的,1.5mm x 10mm x 5mm

8、单刃剃须刀、手术刀、平皿或类似物-用于切胶块 9、无菌的一次性皮氏平皿或大的玻璃载物片-用于切胶块 10、一端宽、一端窄的平铲

药铲,生工等公司的实验室耗材部分有。 11、标准胶槽(14 x 13cm的框和平板 12、10孔的梳子(14 cm长,1.5 mm宽

13、15孔的梳子(21 cm长,1.5 mm宽 -Bio-Rad 170-3627 14、胶水平台

15、盛放EB 染液的塑料容器

16、70%异丙醇、5%-10%的漂白剂或其它合适的消毒剂 17、各种体积的无菌烧瓶或瓶子(50 ml - 2000 ml


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