互转化,可能是基因调控的方式 3.超螺旋DNA(质粒DNA)
开始在环形DNA中发现(SV40),其后发现在几乎一切DNA中(环型、线型DNA中)均存在
双螺旋DNA放松可得负超螺旋,拧紧可得正超螺旋。 超螺旋使DNA上储备了能量,约占总DNA 5% 单链泡状结构
效应:使DNA拧得更紧,电泳率加大
拓扑异构酶:使DNA骨架上形成暂时性断裂,DNA多核苷酸链得以穿越,改变螺旋状态,不改变序列
真核生物的负超螺旋存在于核小体的缠绕上 4.DNA分子的变性与复性 ①什么是DNA的变性:
增色效应 变性特点 Tm值(P4)
热变性,pH11.3以上时碱变性,盐浓度低于0.01mol/L ②什么是复性
成核作用与拉拉链作用
a. 变性不完全时
b. 变性完全时:碰撞下组合与长度、浓度、复杂程度有关, 非原配分子
cot曲线:变性越快,cot越陡
③分子杂交:DNA-DNA、DNA-RNA、RNA-RNA,标记,分子杂交实验 ④DNA分子的呼吸作用 分子遗传P9 5.遗传物质的存在状态
①大肠杆菌DNA:(亦有人称染色体) 其它与基因表达有关的蛋白质 在其对数生长期,有细胞有2-4个同样的DNA分子:
类核: DNA结合蛋白位于核心,将双链环状DNA结合成脚手架结构,约100
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个小区
②真核生物染色体 a.DNA的蛋白质
真核生物的DNA蛋白质:非组蛋白质:复制、重组、转录有关 蛋白质:DNA 2:1(质量比)
组蛋白是染色体的结构蛋白,与DNA组成核小体,组蛋白分为5种:H1、
H2A、H2B、H3及H4 (现代分子生物学P19)
组蛋白有如下特征:⑴进化极端保守性: 特别是H3与H4 ⑵无组织特异性 ⑶AA分布不均匀 ⑷修饰作用
非组蛋白:多种多样(与基因调控有关,也可能与染色体稳定有关) b.染色体组织方式
染色体平时以染色质的形态出现,电子显微镜观察是由核小组成的念珠
状结构,可以看到一条细丝连接着的一串直径为10nm的球状体。核小体间的DNA称为接头DNA,从无特异性的DHaseI切割可得n?200的单位,表明其它部分受保护;10nm每圈6个形成直径30nm中空管。
研究表明:核小体是由H2A,H2B,H3,H4,各两个分子生成的八聚体和大
约200bpDNA组成。H1在核小体外面
c.一些DNA序列的不寻常结构
DNA的不寻常结构并非一个专有名词,揭示现有的DNA结构:如Z-DNA、
十字形结构、单链泡状结构
要指出的是:所有不寻常结构均是按生物大分子的形成规则去形成的,
只是由于其组成成分特殊而形成不寻常的结构。(书P94)
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第四章 DNA的复制
一.DNA复制
1.DNA复制的半保留与半不连续
先导链与后随链、岗崎片断、1968年岗崎:H3-脱氧胸苷标记 N15→N14 第一代中间,第二代轻链与中间各一半 。
2.DNA复制的方向与速度 ①复制起始原点
复制子:原核一个,真核多个 大肠杆菌:a. A-T 56%
b.部份序列保守,部份数目恒定 c.无大于20密码子ORF ②方向与速度:多为双向同速
a.Q复制(西塔):证明E.coli双向等速复制(插入或缺失) b.D复制:线粒体(动物):一条合成60%以上
c.Σ复制(西格马)\\滚环复制:双链切断,5’可结合蛋白,
3’甩出,某些噬菌体DNA ¢X174
3.原核生物DNA聚合酶特性 《现代分子生物学》(第二版)P47
5’-3’聚合 5’-3’外切 3’-5’外切 5’-3’内切
为什么只从5’-3’?
Ⅰ √ √ √ √ Ⅱ √ × √ × Ⅲ √ × √ × 8
a.三磷酸不易正确配对 b.修复时该结点仅一个磷酸 4.参与原核生物DNA复制的蛋白质
①DNA螺旋酶:促进DNA分子解链,与SSB协同作用,作用于DNA,具有
ATP水解酶活性
②拓扑异构酶:与负超一起协同解链
③SSB蛋白:原核生物有协同作用,牛、鼠、人中无,保持单链稳定 ④引发酶:RNA聚合酶
5.E.coli复制起始(许多与起始有关的蛋白并不参与复制)
①起始蛋白DnaA识别并与oril结合→可促进DNA解链或使DNA发生扭曲
使DNA解螺旋酶能进入,帮助与复制叉组装和功能有关的其它因子加入 ②可能DnaB进入(螺旋酶):识别潜在单链结构与拓扑酶结合解链,SSB
稳定,DnaB与6个DnaC形成DnaB/DnaC复合体,与oril结合形成预引发体
③预引发体引入其它蛋白并引入引发酶形成引发体,在后随链上前进,生
成短的RNA引物
④先导链RNA的形成很可能是RNA聚合酶的转录而成(转录激活):
RNA聚合酶对利福霉素敏感,引发酶不敏感。
二.岗崎片断还是尿嘧啶片断:
dUTP:dTTP=1:300 如在体外进行无dUTP H3-胸腺嘧啶→片断数目是预期2倍左右,1000-2000b 尿嘧啶糖是酶,AP内切酶
三.DNA复制中的5末端缺失(环形分子无)(《分子遗传学》)张玉静P133) 1.少数噬菌体环化 2.T4连环分子末端冗余 3.某些生物以蛋白质为引物 腺病毒
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四.端粒与端粒酶:
1.端粒:30-40年代Muller、Moclintock:端粒不融合,保证染色体间不融
合、末端不受酶切(以P.保护)
1978年 Blackburn等人,单细胞四膜虫,短的(TTGGGG),不同个体重复
的数量不同,总长度约:370n520bp
2.端粒酶:1984年,Blackburn将合成的端粒与四膜虫提取液混合在一起,
发现端粒得到延伸〈在低等真核生物中〉
是一种含RNA的蛋白复合体,所含RNA长约150核苷酸,并约含1-5拷
贝的CyAx序列,可能是合成端粒的模板,其蛋白质有逆转录酶活性
①端粒酶在单细胞生物体中应存在,但在体细胞中因找不到
②1989年,Morin首次在人的癌细胞系中发现了端粒酶,但并非所有肿瘤
均有端粒酶
五.癌基因与抑癌基因
1926年 菲比格(丹麦):寄生虫致癌学说(J.Fibiger) 1966年 劳斯(美国):对致癌病毒的研究(F.P.Rous)
1975年 杜尔贝科(R.Dulbecco)、巴尔的摩(D.Baltimore)、特明(H.M.Temin)
美: 发现病毒在体内的致癌机理
1988年 埃利昂(女)(G.Elion) 、希钦斯(G.Hithings)美: 抗癌药物及机理 1989年 毕晓普(M.Biahop)、瓦慕斯(H.Varmus)美: 正常细胞中存在原癌基因 1. 病毒癌基因:
1910年美国洛克菲勒医学研究所的Rons发现提取自鸡肉瘤的无细胞滤液 中有一种病毒→放弃,几十年后,1966年获诺贝尔奖 ①病毒中的癌基因
某些RNA病毒可通过逆转录合成DNA,具有使细胞癌变的能力→肿瘤病 急性转化病毒:真正携带可诱发癌症的遗传信息
慢性转化病毒:并不携带癌基因,可能因其基因插入宿主细胞某些基因
附近而引起癌变
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